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タイトルStructural organization of the C1b projection within the ciliary central apparatus.
ジャーナル・号・ページJ Cell Sci, Vol. 134, Issue 21, Year 2021
掲載日2021年11月1日
著者Kai Cai / Yanhe Zhao / Lei Zhao / Nhan Phan / Yuqing Hou / Xi Cheng / George B Witman / Daniela Nicastro /
PubMed 要旨Motile cilia have a '9+2' structure containing nine doublet microtubules and a central apparatus (CA) composed of two singlet microtubules with associated projections. The CA plays crucial roles in ...Motile cilia have a '9+2' structure containing nine doublet microtubules and a central apparatus (CA) composed of two singlet microtubules with associated projections. The CA plays crucial roles in regulating ciliary motility. Defects in CA assembly or function usually result in motility-impaired or paralyzed cilia, which in humans causes disease. Despite their importance, the protein composition and functions of most CA projections remain largely unknown. Here, we combined genetic, proteomic and cryo-electron tomographic approaches to compare the CA of wild-type Chlamydomonas reinhardtii with those of three CA mutants. Our results show that two proteins, FAP42 and FAP246, are localized to the L-shaped C1b projection of the CA, where they interact with the candidate CA protein FAP413. FAP42 is a large protein that forms the peripheral 'beam' of the C1b projection, and the FAP246-FAP413 subcomplex serves as the 'bracket' between the beam (FAP42) and the C1b 'pillar' that attaches the projection to the C1 microtubule. The FAP246-FAP413-FAP42 complex is essential for stable assembly of the C1b, C1f and C2b projections, and loss of these proteins leads to ciliary motility defects.
リンクJ Cell Sci / PubMed:34651179 / PubMed Central
手法EM (サブトモグラム平均) / EM (トモグラフィー)
解像度22.0 - 25.0 Å
構造データ

EMDB-22648:
The C1b projection within the ciliary central apparatus from the cryo-electron tomography and subtomographic average of isolated Chlamydomonas wild type axonemes
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 23.0 Å

EMDB-22649:
The C1b projection within the the ciliary central apparatus from the cryo-electron tomography and subtomographic average of isolated Chlamydomonas fap246 axonemes
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 22.0 Å

EMDB-22651:
The C1b projection within the the ciliary central apparatus from the cryo-electron tomography and subtomographic average of isolated Chlamydomonas fap42 axonemes
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 25.0 Å

EMDB-24489:
The C1b projection within the ciliary central apparatus from the cryo-electron tomography and subtomographic average of isolated Chlamydomonas fap413 mutant axonemes
手法: EM (トモグラフィー) / 解像度: 25.0 Å

由来
  • Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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