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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	Discovery of Novel Peptidomimetic Boronate ClpP Inhibitors with Noncanonical Enzyme Mechanism as Potent Virulence Blockersin Vitroandin Vivo.
ジャーナル・号・ページ	J. Med. Chem., Vol. 63, Page 3104-3119, Year 2020
掲載日	2019年10月15日 (構造データの登録日)
著者	Ju, Y. / He, L. / Zhou, Y. / Yang, T. / Sun, K. / Song, R. / Yang, Y. / Li, C. / Sang, Z. / Bao, R. / Luo, Y.
リンク	J. Med. Chem. / PubMed:32031798
手法	X線回折
解像度	2.209 - 2.33 Å
構造データ	PDB-6l3x: Discovery of novel peptidomimetic boronate ClpP inhibitors with noncanonical enzyme mechanism as potent virulence blockers in vitro and in vivo 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.3054 Å PDB-6l40: Discovery of novel peptidomimetic boronate ClpP inhibitors with noncanonical enzyme mechanism as potent virulence blockers in vitro and in vivo 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.209 Å PDB-8qyf: Crystal structure of ClpP from Staphylococcus epidermidis in complex with ixazomib 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.33 Å
化合物	ChemComp-E4U: [(1~{R})-1-[[(2~{S})-2-[[2,5-bis(chloranyl)phenyl]carbonylamino]-3-(1~{H}-indol-3-yl)propanoyl]amino]-3-methyl-butyl]boronic acid ChemComp-HOH: WATER ChemComp-FN3: [(1S)-3-methyl-1-[[(2S)-3-phenyl-2-(pyrazin-2-ylcarbonylamino)propanoyl]amino]butyl]boronic acid / N^α-(ピラジン-2-イルカルボニル)-N-[(S)-1-ジヒドロキシボリル-3-メチルブチル](以下略) ChemComp-6V8: [(1~{R})-1-[2-[[2,5-bis(chloranyl)phenyl]carbonylamino]ethanoylamino]-3-methyl-butyl]boronic acid / イキサゾミブ
由来	staphylococcus aureus rf122 (黄色ブドウ球菌) staphylococcus aureus (strain bovine rf122 / et3-1) (黄色ブドウ球菌) staphylococcus epidermidis (表皮ブドウ球菌)
キーワード	HYDROLASE/INHIBITOR / S. aureus / Caseinolytic protease P / HYDROLASE-INHIBITOR complex / Caseinolytic protease P (ClpP) / HYDROLASE / ClpP / Serine Protease / Complex