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万見生物種
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生物種情報

名称 *1Aeromonas hydrophila
その他の名称 *1別称: Aeromonas dourgesi / Aeromonas hydrophila (Chester 1901) Stanier 1943 (Approved Lists 1980) ...Aeromonas dourgesi / Aeromonas hydrophila (Chester 1901) Stanier 1943 (Approved Lists 1980) / Aeromonas liquefaciens / Bacillus hydrophilus fuscus / Bacterium hydrophilum / Proteus hydrophilus / Proteus ichthyosmius / Pseudomonas hydrophila / includes: Aeromonas sp. ATCC 14715 / Aeromonas sp. ATCC 19570 ...Aeromonas sp. ATCC 14715 / Aeromonas sp. ATCC 19570 / Aeromonas sp. CCRC 13881 / Aeromonas sp. CCRC 13980 / Aeromonas sp. E20 / Aeromonas sp. G17 / Aeromonas sp. TH001 / Aeromonas sp. TH003 / Aeromonas sp. TH019 / Aeromonas sp. TH020 / Aeromonas sp. TH021 / Aeromonas sp. TH022 / Aeromonas sp. TH023 / Aeromonas sp. TH024 / Aeromonas sp. TH025 / Aeromonas sp. TH026 / Aeromonas sp. TH027 / Aeromonas sp. TH028 / Aeromonas sp. TH029 / Aeromonas sp. TH030 / Aeromonas sp. TH031 / Aeromonas sp. TH033 / Aeromonas sp. TH034 / Aeromonas sp. TH036 / Aeromonas sp. TH054 / Aeromonas sp. TH055 / Aeromonas sp. TH058 / Aeromonas sp. TH068 / Aeromonas sp. TH069 / Aeromonas sp. TH071 / Aeromonas sp. TH072 / Aeromonas sp. TH083 / Aeromonas sp. TH084 / Aeromonas sp. TH085 / Aeromonas sp. TH097 / Aeromonas sp. TH100 / Aeromonas sp. TH102 / Aeromonas sp. TH104 / Aeromonas sp. TH105 / Aeromonas sp. TH107 / Aeromonas sp. TH108 / Aeromonas sp. TH109 / Aeromonas sp. TH110 / Aeromonas sp. TH113 / Aeromonas sp. TH115 / Aeromonas sp. TH117 / Aeromonas sp. TH118 / Aeromonas sp. TH120 / Aeromonas sp. TH121 / Aeromonas sp. TH122 / Aeromonas sp. TH123 / Aeromonas sp. TH124 / Aeromonas sp. TH125 / Aeromonas sp. TH126 / Aeromonas sp. TH127 / Aeromonas sp. TH128 / Aeromonas sp. TH129 / Aeromonas sp. TH130 / Aeromonas sp. TH131 / Aeromonas sp. TH132 / Aeromonas sp. TH133 / Aeromonas sp. TH134 / Aeromonas sp. TH135 / Aeromonas sp. TH136 / Aeromonas sp. TH137 / Aeromonas sp. TH138 / Aeromonas sp. TH139 / Aeromonas sp. TH140 / Aeromonas sp. TH141 / Aeromonas sp. TH142 / その他: Aeromonas hydrophila (Chester 1901) Stanier 1943 (Approved Lists 1980) emend. Beaz-Hidalgo et al. 2013 / "Aeromonas liquefaciens" Kluyver and van Niel 1936 ...Aeromonas hydrophila (Chester 1901) Stanier 1943 (Approved Lists 1980) emend. Beaz-Hidalgo et al. 2013 / "Aeromonas liquefaciens" Kluyver and van Niel 1936 / ATCC 7966 / "Bacillus hydrophilus fuscus" Sanarelli 1871 / "Bacterium hydrophilum" (Chester 1901) Weldin and Levine 1923 / BCRC 13018 / CCRC 13018 / CCRC:13018 / CCUG 14551 / CDC 359-60 / CECT 839 / CIP 76.14 / DSM 30187 / HAMBI 1847 / HAMBI 1973 / IAM 12460 / JCM 1027 / LMG 12156 / LMG:12156 / LMG 13439 / LMG:13439 / LMG 2844 / LMG:2844 / NCDC 359-60 / NCIB 9240 / NCIMB 9240 / NCMB 86 / NCMB:86 / NCTC 8049 / "Proteus hydrophilus" (Chester 1901) Bergey et al. 1923 / "Pseudomonas hydrophila" (Chester 1901) Breed et al. 1948
NCBI Taxonomy ID644
系統 *1細胞生物 > 細菌 > Pseudomonadota > ガンマプロテオバクテリア綱 > エアロモナス目 > アエロモナス科 > エロモナス属
ウィキペディアウィキペディア - エロモナス・ハイドロフィラ:

エロモナス・ハイドロフィラ（Aeromonas hydrophila）は、腸内細菌の一種でグラム陰性の通性嫌気性菌である。

コメントバクテリア
出典*1: NCBI Taxonomy

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EMDB エントリ (4)

全4件を表示しています

EMDB-0326:
Aeromonas hydrophila ExeD

EMDB-8185:
aerolysin prepore cryo-EM map

EMDB-8187:
aerolysin pore cryo-EM map

EMDB-8188:
aerolysin post-prepore and quasipore cryo-EM maps.

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PDB エントリ (46)

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SASBDB エントリ (0)

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万見生物種について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見生物種

EMDB/PDB/SASBDBの生物種情報

EMDB/PDB/SASBDBの構造データの試料情報、由来する生物種に関するデータベース

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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