PDB-6b3m: The crystal structure of a broadly-reactive human anti-hemaggluti...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 6b3m

タイトル

The crystal structure of a broadly-reactive human anti-hemagglutinin stalk antibody (70-1F02) in complex with H5 hemagglutinin

要素

(Hemagglutinin ...ヘマグルチニン) x 2
70-1F02 Fab Heavy Chain
70-1F02 Fab Light Chain

キーワード

VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM (ウイルス性) /

antibody (抗体) /

hemagglutinin (ヘマグルチニン) /

influenza (インフルエンザ) /

VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex (ウイルス性)

機能・相同性

機能・相同性情報

viral budding from plasma membrane / clathrin-dependent endocytosis of virus by host cell / host cell surface receptor binding / apical plasma membrane / fusion of virus membrane with host plasma membrane / fusion of virus membrane with host endosome membrane /

エンベロープ (ウイルス) / virion attachment to host cell / host cell plasma membrane / virion membrane / identical protein binding
類似検索 - 分子機能

生物種

unidentified influenza virus (インフルエンザウイルス)

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 3.92 Å

データ登録者

Shore, D.A. / Yang, H. / Stevens, J.

引用

ジャーナル: J. Virol. / 年: 2018
タイトル: Broadly Reactive Human Monoclonal Antibodies Elicited following Pandemic H1N1 Influenza Virus Exposure Protect Mice against Highly Pathogenic H5N1 Challenge.
著者: Nachbagauer, R. / Shore, D. / Yang, H. / Johnson, S.K. / Gabbard, J.D. / Tompkins, S.M. / Wrammert, J. / Wilson, P.C. / Stevens, J. / Ahmed, R. / Krammer, F. / Ellebedy, A.H.

履歴

登録	2017年9月22日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2018年6月13日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2018年6月27日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.journal_abbrev / _citation.pdbx_database_id_DOI ..._citation.journal_abbrev / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title
改定 1.2	2018年8月15日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / Item: _citation.journal_volume / _citation.title
改定 2.0	2020年7月29日	Group: Advisory / Atomic model ...Advisory / Atomic model / Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / database_PDB_caveat / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / pdbx_validate_chiral / pdbx_validate_close_contact / struct_asym / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _database_PDB_caveat.text / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id / _pdbx_validate_chiral.auth_asym_id / _pdbx_validate_chiral.auth_atom_id / _pdbx_validate_chiral.auth_comp_id / _pdbx_validate_chiral.auth_seq_id / _pdbx_validate_chiral.details 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation
改定 2.1	2023年10月4日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_ncs_dom_lim Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI ..._chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	6b3m.cif.gz	1 MB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb6b3m.ent.gz	885.2 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	6b3m.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/b3/6b3m ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/b3/6b3m	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	2fk0S S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	5wko-1 3gbm-2 5wko-2 4fqy-1 4fqv-d 4hlz-d 4kvn-1 4fqi-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

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「今月の分子」の関連する項目	#21 - 2001年9月抗体 (Antibodies) 類似性 (1) #256 - 2021年4月 SARSコロナウイルス2型のスパイクと抗体 (SARS-CoV-2 Spike and Antibodies) 類似性 (1) #76 - 2006年4月赤血球凝集素 (Hemagglutinin) 類似性 (6) #170 - 2014年2月広域中和抗体 (Broadly Neutralizing Antibodies) 類似性 (6) #259 - 2021年7月人工設計タンパク質と市民科学 (Designed Proteins and Citizen Science) 類似性 (5) #62 - 2005年2月主要組織適合性複合体 (Major Histocompatibility Complex) 類似性 (5) #63 - 2005年3月 T細胞受容体 (T-Cell Receptor) 類似性 (5) #200 - 2016年8月正二十面体型ウイルスの準対称性 (Quasisymmetry in Icosahedral Viruses) 類似性 (1)

PDBのページ

PDBj /

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「今月の分子」の関連する項目

#21 - 2001年9月
抗体 (Antibodies)
類似性 (1)
#256 - 2021年4月
SARSコロナウイルス2型のスパイクと抗体 (SARS-CoV-2 Spike and Antibodies)
類似性 (1)
#76 - 2006年4月
赤血球凝集素 (Hemagglutinin)
類似性 (6)
#170 - 2014年2月
広域中和抗体 (Broadly Neutralizing Antibodies)
類似性 (6)
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人工設計タンパク質と市民科学 (Designed Proteins and Citizen Science)
類似性 (5)
#62 - 2005年2月
主要組織適合性複合体 (Major Histocompatibility Complex)
類似性 (5)
#63 - 2005年3月
T細胞受容体 (T-Cell Receptor)
類似性 (5)
#200 - 2016年8月
正二十面体型ウイルスの準対称性 (Quasisymmetry in Icosahedral Viruses)
類似性 (1)

登録構造単位

A: Hemagglutinin HA1

B: Hemagglutinin HA2

C: 70-1F02 Fab Heavy Chain

E: Hemagglutinin HA1

F: Hemagglutinin HA2

G: Hemagglutinin HA1

H: Hemagglutinin HA2

I: 70-1F02 Fab Heavy Chain

K: Hemagglutinin HA1

L: Hemagglutinin HA2

M: 70-1F02 Fab Heavy Chain

O: 70-1F02 Fab Heavy Chain

P: 70-1F02 Fab Light Chain

Q: Hemagglutinin HA1

R: Hemagglutinin HA2

S: Hemagglutinin HA1

T: Hemagglutinin HA2

V: 70-1F02 Fab Heavy Chain

Y: 70-1F02 Fab Heavy Chain

U: 70-1F02 Fab Light Chain

J: 70-1F02 Fab Light Chain

D: 70-1F02 Fab Light Chain

W: 70-1F02 Fab Light Chain

N: 70-1F02 Fab Light Chain

ヘテロ分子

646 kDa, 24 ポリマー
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1

A: Hemagglutinin HA1

B: Hemagglutinin HA2

C: 70-1F02 Fab Heavy Chain

G: Hemagglutinin HA1

H: Hemagglutinin HA2

I: 70-1F02 Fab Heavy Chain

K: Hemagglutinin HA1

L: Hemagglutinin HA2

O: 70-1F02 Fab Heavy Chain

P: 70-1F02 Fab Light Chain

J: 70-1F02 Fab Light Chain

D: 70-1F02 Fab Light Chain

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
根拠: gel filtration
323 kDa, 12 ポリマー
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2

E: Hemagglutinin HA1

F: Hemagglutinin HA2

M: 70-1F02 Fab Heavy Chain

Q: Hemagglutinin HA1

R: Hemagglutinin HA2

Y: 70-1F02 Fab Heavy Chain

U: 70-1F02 Fab Light Chain

N: 70-1F02 Fab Light Chain

ヘテロ分子

S: Hemagglutinin HA1

T: Hemagglutinin HA2

V: 70-1F02 Fab Heavy Chain

W: 70-1F02 Fab Light Chain

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
323 kDa, 12 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	174.582, 205.368, 222.265
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:
NCSドメイン領域:

Component-ID: 0 / Refine code: 0

Dom-ID	Ens-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	ASP	ASP	PRO	PRO	A	A	1 - 321	1 - 321
2	1	ASP	ASP	PRO	PRO	E	D	1 - 321	1 - 321
1	2	ASP	ASP	PRO	PRO	A	A	1 - 321	1 - 321
2	2	ASP	ASP	PRO	PRO	G	F	1 - 321	1 - 321
1	3	ASP	ASP	PRO	PRO	A	A	1 - 321	1 - 321
2	3	ASP	ASP	PRO	PRO	K	I	1 - 321	1 - 321
1	4	ASP	ASP	PRO	PRO	A	A	1 - 321	1 - 321
2	4	ASP	ASP	PRO	PRO	Q	N	1 - 321	1 - 321
1	5	ASP	ASP	PRO	PRO	A	A	1 - 321	1 - 321
2	5	ASP	ASP	PRO	PRO	S	P	1 - 321	1 - 321
1	6	GLY	GLY	ILE	ILE	B	B	1 - 173	1 - 173
2	6	GLY	GLY	ILE	ILE	F	E	1 - 173	1 - 173
1	7	GLY	GLY	ILE	ILE	B	B	1 - 173	1 - 173
2	7	GLY	GLY	ILE	ILE	H	G	1 - 173	1 - 173
1	8	GLY	GLY	ILE	ILE	B	B	1 - 173	1 - 173
2	8	GLY	GLY	ILE	ILE	L	J	1 - 173	1 - 173
1	9	GLY	GLY	ILE	ILE	B	B	1 - 173	1 - 173
2	9	GLY	GLY	ILE	ILE	R	O	1 - 173	1 - 173
1	10	GLY	GLY	ILE	ILE	B	B	1 - 173	1 - 173
2	10	GLY	GLY	ILE	ILE	T	Q	1 - 173	1 - 173
1	11	GLN	GLN	LYS	LYS	C	C	3 - 221	3 - 221
2	11	GLN	GLN	LYS	LYS	I	H	3 - 221	3 - 221
1	12	GLN	GLN	LYS	LYS	C	C	3 - 221	3 - 221
2	12	GLN	GLN	LYS	LYS	M	K	3 - 221	3 - 221
1	13	GLN	GLN	LYS	LYS	C	C	3 - 221	3 - 221
2	13	GLN	GLN	LYS	LYS	O	L	3 - 221	3 - 221
1	14	GLN	GLN	LYS	LYS	C	C	3 - 221	3 - 221
2	14	GLN	GLN	LYS	LYS	V	R	3 - 221	3 - 221
1	15	GLN	GLN	LYS	LYS	C	C	3 - 221	3 - 221
2	15	GLN	GLN	LYS	LYS	Y	S	3 - 221	3 - 221
1	16	ASP	ASP	PRO	PRO	E	D	1 - 321	1 - 321
2	16	ASP	ASP	PRO	PRO	G	F	1 - 321	1 - 321
1	17	ASP	ASP	PRO	PRO	E	D	1 - 321	1 - 321
2	17	ASP	ASP	PRO	PRO	K	I	1 - 321	1 - 321
1	18	ASP	ASP	PRO	PRO	E	D	1 - 321	1 - 321
2	18	ASP	ASP	PRO	PRO	Q	N	1 - 321	1 - 321
1	19	ASP	ASP	PRO	PRO	E	D	1 - 321	1 - 321
2	19	ASP	ASP	PRO	PRO	S	P	1 - 321	1 - 321
1	20	GLY	GLY	SER	SER	F	E	1 - 175	1 - 175
2	20	GLY	GLY	SER	SER	H	G	1 - 175	1 - 175
1	21	GLY	GLY	SER	SER	F	E	1 - 175	1 - 175
2	21	GLY	GLY	SER	SER	L	J	1 - 175	1 - 175
1	22	GLY	GLY	SER	SER	F	E	1 - 175	1 - 175
2	22	GLY	GLY	SER	SER	R	O	1 - 175	1 - 175
1	23	GLY	GLY	SER	SER	F	E	1 - 175	1 - 175
2	23	GLY	GLY	SER	SER	T	Q	1 - 175	1 - 175
1	24	ASP	ASP	PRO	PRO	G	F	1 - 321	1 - 321
2	24	ASP	ASP	PRO	PRO	K	I	1 - 321	1 - 321
1	25	ASP	ASP	PRO	PRO	G	F	1 - 321	1 - 321
2	25	ASP	ASP	PRO	PRO	Q	N	1 - 321	1 - 321
1	26	ASP	ASP	PRO	PRO	G	F	1 - 321	1 - 321
2	26	ASP	ASP	PRO	PRO	S	P	1 - 321	1 - 321
1	27	GLY	GLY	SER	SER	H	G	1 - 175	1 - 175
2	27	GLY	GLY	SER	SER	L	J	1 - 175	1 - 175
1	28	GLY	GLY	SER	SER	H	G	1 - 175	1 - 175
2	28	GLY	GLY	SER	SER	R	O	1 - 175	1 - 175
1	29	GLY	GLY	SER	SER	H	G	1 - 175	1 - 175
2	29	GLY	GLY	SER	SER	T	Q	1 - 175	1 - 175
1	30	GLN	GLN	LYS	LYS	I	H	3 - 221	3 - 221
2	30	GLN	GLN	LYS	LYS	M	K	3 - 221	3 - 221
1	31	GLN	GLN	LYS	LYS	I	H	3 - 221	3 - 221
2	31	GLN	GLN	LYS	LYS	O	L	3 - 221	3 - 221
1	32	GLN	GLN	LYS	LYS	I	H	3 - 221	3 - 221
2	32	GLN	GLN	LYS	LYS	V	R	3 - 221	3 - 221
1	33	GLN	GLN	LYS	LYS	I	H	3 - 221	3 - 221
2	33	GLN	GLN	LYS	LYS	Y	S	3 - 221	3 - 221
1	34	ASP	ASP	PRO	PRO	K	I	1 - 321	1 - 321
2	34	ASP	ASP	PRO	PRO	Q	N	1 - 321	1 - 321
1	35	ASP	ASP	PRO	PRO	K	I	1 - 321	1 - 321
2	35	ASP	ASP	PRO	PRO	S	P	1 - 321	1 - 321
1	36	GLY	GLY	SER	SER	L	J	1 - 175	1 - 175
2	36	GLY	GLY	SER	SER	R	O	1 - 175	1 - 175
1	37	GLY	GLY	SER	SER	L	J	1 - 175	1 - 175
2	37	GLY	GLY	SER	SER	T	Q	1 - 175	1 - 175
1	38	GLN	GLN	LYS	LYS	M	K	3 - 221	3 - 221
2	38	GLN	GLN	LYS	LYS	O	L	3 - 221	3 - 221
1	39	GLN	GLN	LYS	LYS	M	K	3 - 221	3 - 221
2	39	GLN	GLN	LYS	LYS	V	R	3 - 221	3 - 221
1	40	GLN	GLN	LYS	LYS	M	K	3 - 221	3 - 221
2	40	GLN	GLN	LYS	LYS	Y	S	3 - 221	3 - 221
1	41	GLN	GLN	LYS	LYS	O	L	3 - 221	3 - 221
2	41	GLN	GLN	LYS	LYS	V	R	3 - 221	3 - 221
1	42	GLN	GLN	LYS	LYS	O	L	3 - 221	3 - 221
2	42	GLN	GLN	LYS	LYS	Y	S	3 - 221	3 - 221
1	43	ILE	ILE	GLU	GLU	P	M	2 - 213	2 - 214
2	43	ILE	ILE	GLU	GLU	U	T	2 - 213	2 - 214
1	44	ILE	ILE	GLU	GLU	P	M	2 - 213	2 - 214
2	44	ILE	ILE	GLU	GLU	J	U	2 - 213	2 - 214
1	45	ILE	ILE	GLU	GLU	P	M	2 - 213	2 - 214
2	45	ILE	ILE	GLU	GLU	D	V	2 - 213	2 - 214
1	46	ILE	ILE	GLU	GLU	P	M	2 - 213	2 - 214
2	46	ILE	ILE	GLU	GLU	W	W	2 - 213	2 - 214
1	47	ILE	ILE	GLU	GLU	P	M	2 - 213	2 - 214
2	47	ILE	ILE	GLU	GLU	N	X	2 - 213	2 - 214
1	48	ASP	ASP	PRO	PRO	Q	N	1 - 321	1 - 321
2	48	ASP	ASP	PRO	PRO	S	P	1 - 321	1 - 321
1	49	GLY	GLY	SER	SER	R	O	1 - 175	1 - 175
2	49	GLY	GLY	SER	SER	T	Q	1 - 175	1 - 175
1	50	GLN	GLN	LYS	LYS	V	R	3 - 221	3 - 221
2	50	GLN	GLN	LYS	LYS	Y	S	3 - 221	3 - 221
1	51	GLU	GLU	CYS	CYS	U	T	1 - 214	1 - 215
2	51	GLU	GLU	CYS	CYS	J	U	1 - 214	1 - 215
1	52	GLU	GLU	CYS	CYS	U	T	1 - 214	1 - 215
2	52	GLU	GLU	CYS	CYS	D	V	1 - 214	1 - 215
1	53	GLU	GLU	CYS	CYS	U	T	1 - 214	1 - 215
2	53	GLU	GLU	CYS	CYS	W	W	1 - 214	1 - 215
1	54	GLU	GLU	CYS	CYS	U	T	1 - 214	1 - 215
2	54	GLU	GLU	CYS	CYS	N	X	1 - 214	1 - 215
1	55	GLU	GLU	CYS	CYS	J	U	1 - 214	1 - 215
2	55	GLU	GLU	CYS	CYS	D	V	1 - 214	1 - 215
1	56	GLU	GLU	CYS	CYS	J	U	1 - 214	1 - 215
2	56	GLU	GLU	CYS	CYS	W	W	1 - 214	1 - 215
1	57	GLU	GLU	CYS	CYS	J	U	1 - 214	1 - 215
2	57	GLU	GLU	CYS	CYS	N	X	1 - 214	1 - 215
1	58	GLU	GLU	CYS	CYS	D	V	1 - 214	1 - 215
2	58	GLU	GLU	CYS	CYS	W	W	1 - 214	1 - 215
1	59	GLU	GLU	CYS	CYS	D	V	1 - 214	1 - 215
2	59	GLU	GLU	CYS	CYS	N	X	1 - 214	1 - 215
1	60	GLU	GLU	CYS	CYS	W	W	1 - 214	1 - 215
2	60	GLU	GLU	CYS	CYS	N	X	1 - 214	1 - 215

NCSアンサンブル:

-
Hemagglutinin ... , 2種, 12分子 AEGKQSBFHLRT

#1: タンパク質	Hemagglutinin HA1 分子量: 37607.688 Da / 分子数: 6 / 断片: UNP residues 17-346 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) unidentified influenza virus (インフルエンザウイルス) 遺伝子: HA / 発現宿主: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ) / 参照: UniProt: Q5EP31, UniProt: Q6DQ33*PLUS
#2: タンパク質	Hemagglutinin HA2 分子量: 20881.104 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) unidentified influenza virus (インフルエンザウイルス) 発現宿主: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ) / 参照: UniProt: A0A182DWE1

-
抗体 , 2種, 12分子 CIMOVYPUJDWN

#3: 抗体	70-1F02 Fab Heavy Chain 分子量: 23534.408 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)
#4: 抗体	70-1F02 Fab Light Chain 分子量: 23439.988 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)

-
糖 , 8種, 28分子

#5: 多糖

alpha-D-mannopyranose-(1-3)-alpha-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1- ...

タイプ: oligosaccharide

オリゴ糖 / 分子量: 748.682 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現

記述子	タイプ	プログラム
DManpa1-3DManpa1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-	Glycam Condensed Sequence	GMML 1.0
WURCS=2.0/2,4,3/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-2/a4-b1_b4-c1_c3-d1	WURCS	PDB2Glycan 1.1.0
[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][a-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}}}}}	LINUCS	PDB-CARE

#6: 多糖

alpha-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta- ...

タイプ: oligosaccharide

オリゴ糖 / 分子量: 586.542 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現

記述子	タイプ	プログラム
DManpa1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-	Glycam Condensed Sequence	GMML 1.0
WURCS=2.0/2,3,2/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1a_1-5]/1-1-2/a4-b1_b4-c1	WURCS	PDB2Glycan 1.1.0
[]{[(4+1)][a-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][a-D-Manp]{}}}}	LINUCS	PDB-CARE

#7: 多糖

2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose

タイプ: oligosaccharide

オリゴ糖 / 分子量: 424.401 Da / 分子数: 9 / 由来タイプ: 組換発現

記述子	タイプ	プログラム
DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-	Glycam Condensed Sequence	GMML 1.0
WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1	WURCS	PDB2Glycan 1.1.0
[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}	LINUCS	PDB-CARE

#8: 多糖

alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]alpha-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2- ...

タイプ: oligosaccharide

オリゴ糖 / 分子量: 910.823 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現

記述子	タイプ	プログラム
DManpa1-3[DManpa1-6]DManpa1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH	Glycam Condensed Sequence	GMML 1.0
WURCS=2.0/2,5,4/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-2-2/a4-b1_b4-c1_c3-d1_c6-e1	WURCS	PDB2Glycan 1.1.0
[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][a-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}[(6+1)][a-D-Manp]{}}}}	LINUCS	PDB-CARE

#9: 多糖

alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[beta-D-mannopyranose-(1-6)]alpha-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2- ...

タイプ: oligosaccharide

オリゴ糖 / 分子量: 910.823 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現

記述子	タイプ	プログラム
DManpa1-3[DManpb1-6]DManpa1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-	Glycam Condensed Sequence	GMML 1.0
WURCS=2.0/3,5,4/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1a_1-5][a1122h-1b_1-5]/1-1-2-2-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1_c6-e1	WURCS	PDB2Glycan 1.1.0
[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][a-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}[(6+1)][a-L-Gulp]{}}}}}	LINUCS	PDB-CARE

#10: 多糖

beta-D-mannopyranose-(1-4)-alpha-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1- ...

タイプ: oligosaccharide

オリゴ糖 / 分子量: 748.682 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現

記述子	タイプ	プログラム
DManpb1-4DManpa1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-	Glycam Condensed Sequence	GMML 1.0
WURCS=2.0/3,4,3/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1a_1-5][a1122h-1b_1-5]/1-1-2-3/a4-b1_b4-c1_c4-d1	WURCS	PDB2Glycan 1.1.0
[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][a-D-Manp]{[(4+1)][b-D-Manp]{}}}}}	LINUCS	PDB-CARE

#11: 糖

ChemComp-NAG / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-acetyl-beta-D-glucosamine / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-glucose / N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE / N-アセチル-β-D-グルコサミン /

N-アセチルグルコサミン

タイプ: D-saccharide, beta linking / 分子量: 221.208 Da / 分子数: 9 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C₈H₁₅NO₆

識別子	タイプ	プログラム
DGlcpNAcb	CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0
N-acetyl-b-D-glucopyranosamine	COMMON NAME	GMML 1.0
b-D-GlcpNAc	IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	PDB-CARE 1.0
GlcNAc	SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0

#12: 糖

ChemComp-BMA / beta-D-mannopyranose / beta-D-mannose / D-mannose / mannose / β-D-マンノピラノ-ス /

マンノース

タイプ: D-saccharide, beta linking / 分子量: 180.156 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C₆H₁₂O₆

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 3.18 Å³/Da / 溶媒含有率: 61.32 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法 / pH: 5.5 詳細: 25% PEG3350, 200 mM sodium chloride, 100 mM Bis-Tris-HCl, pH 5.5

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 22-ID / 波長: 1 Å
検出器	タイプ: MARMOSAIC 300 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2015年5月16日
放射	モノクロメーター: double crystal Si(111) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 3.9→50 Å / Num. obs: 64141 / % possible obs: 98.8 % / 冗長度: 6.6 % / Net I/σ(I): 17.1
反射シェル	最高解像度: 3.9 Å

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.8.0158	精密化
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB entry 2FK0

2fk0

解像度: 3.92→50.01 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.773 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.705 / SU B: 161.2 / SU ML: 0.946 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R Free: 1.113 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.32926	3422	5.1 %	RANDOM
R_work	0.28626	-	-	-
obs	0.28842	64141	93.72 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 60.359 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-0.03 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	0.53 Å²	0 Å²
3-	-	-	-0.5 Å²

精密化ステップ

サイクル: 1 / 解像度: 3.92→50.01 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	43163	0	861	0	44024

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.012	0.019	45136
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.002	0.02	39978
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.607	1.966	61252
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	2.475	3	93484
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	6.41	5	5500
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	33.658	24.761	2027
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	16.491	15	7348
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	13.02	15	204
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.103	0.2	6811
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.005	0.021	49664
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.004	0.02	8840
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	6.639	6.222	22126
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	6.64	6.221	22125
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	11.501	9.308	27584
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_other	11.501	9.309	27585
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	5.231	6.211	23010
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_other	5.231	6.211	23010
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_other	9.44	9.296	33662
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_refined	15.806	65.617	46070
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_other	15.806	65.621	46071
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

Refine LS restraints NCS

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / タイプ: interatomic distance / Weight position: 0.05

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Rms dev position (Å)
1	1	A	18968	0.01
1	2	E	18968	0.01
2	1	A	18982	0.01
2	2	G	18982	0.01
3	1	A	18942	0.01
3	2	K	18942	0.01
4	1	A	18982	0.02
4	2	Q	18982	0.02
5	1	A	18976	0.01
5	2	S	18976	0.01
6	1	B	10170	0.02
6	2	F	10170	0.02
7	1	B	10148	0.02
7	2	H	10148	0.02
8	1	B	10128	0.02
8	2	L	10128	0.02
9	1	B	10184	0.02
9	2	R	10184	0.02
10	1	B	10168	0.02
10	2	T	10168	0.02
11	1	C	11406	0.01
11	2	I	11406	0.01
12	1	C	11420	0.01
12	2	M	11420	0.01
13	1	C	11432	0.01
13	2	O	11432	0.01
14	1	C	11410	0.01
14	2	V	11410	0.01
15	1	C	11408	0.01
15	2	Y	11408	0.01
16	1	E	18980	0.01
16	2	G	18980	0.01
17	1	E	18972	0.01
17	2	K	18972	0.01
18	1	E	19002	0.02
18	2	Q	19002	0.02
19	1	E	19002	0.01
19	2	S	19002	0.01
20	1	F	10236	0.02
20	2	H	10236	0.02
21	1	F	10228	0.02
21	2	L	10228	0.02
22	1	F	10256	0.03
22	2	R	10256	0.03
23	1	F	10242	0.02
23	2	T	10242	0.02
24	1	G	18968	0.01
24	2	K	18968	0.01
25	1	G	19020	0.02
25	2	Q	19020	0.02
26	1	G	18996	0.01
26	2	S	18996	0.01
27	1	H	10198	0.02
27	2	L	10198	0.02
28	1	H	10250	0.02
28	2	R	10250	0.02
29	1	H	10218	0.03
29	2	T	10218	0.03
30	1	I	11408	0.01
30	2	M	11408	0.01
31	1	I	11420	0.01
31	2	O	11420	0.01
32	1	I	11400	0.01
32	2	V	11400	0.01
33	1	I	11400	0.01
33	2	Y	11400	0.01
34	1	K	18974	0.02
34	2	Q	18974	0.02
35	1	K	19024	0.01
35	2	S	19024	0.01
36	1	L	10218	0.03
36	2	R	10218	0.03
37	1	L	10216	0.02
37	2	T	10216	0.02
38	1	M	11420	0.01
38	2	O	11420	0.01
39	1	M	11408	0.01
39	2	V	11408	0.01
40	1	M	11408	0.01
40	2	Y	11408	0.01
41	1	O	11412	0.01
41	2	V	11412	0.01
42	1	O	11404	0.01
42	2	Y	11404	0.01
43	1	P	11956	0.01
43	2	U	11956	0.01
44	1	P	11958	0.01
44	2	J	11958	0.01
45	1	P	11968	0.01
45	2	D	11968	0.01
46	1	P	11950	0.01
46	2	W	11950	0.01
47	1	P	11952	0.01
47	2	N	11952	0.01
48	1	Q	18998	0.02
48	2	S	18998	0.02
49	1	R	10252	0.03
49	2	T	10252	0.03
50	1	V	11390	0.01
50	2	Y	11390	0.01
51	1	U	12034	0.01
51	2	J	12034	0.01
52	1	U	12034	0.01
52	2	D	12034	0.01
53	1	U	12034	0.01
53	2	W	12034	0.01
54	1	U	12026	0.01
54	2	N	12026	0.01
55	1	J	12012	0.01
55	2	D	12012	0.01
56	1	J	12014	0.01
56	2	W	12014	0.01
57	1	J	12004	0.01
57	2	N	12004	0.01
58	1	D	12032	0.01
58	2	W	12032	0.01
59	1	D	12038	0.01
59	2	N	12038	0.01
60	1	W	12028	0.01
60	2	N	12028	0.01

LS精密化シェル

解像度: 3.924→4.025 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.352	160	-
R_work	0.345	2682	-
obs	-	-	54.26 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.7638	-0.2907	-1.0605	0.3214	0.0902	2.2782	-0.109	-0.0169	0.0267	-0.0525	-0.1262	-0.1604	0.0658	-0.0603	0.2353	0.5772	0.0642	0.1046	0.3961	0.0173	0.7701	-7.9737	26.8941	-21.5058
2	2.8949	-1.4541	-3.6753	0.9447	1.7194	4.7943	0.0021	-0.2965	-0.0029	0.0278	0.1378	0.034	0.0623	0.317	-0.1399	0.5065	0.0303	0.0329	0.7497	-0.0602	0.5663	-30.6176	32.9802	26.7912
3	0.1558	0.1279	-0.3219	3.3398	-2.1432	2.6376	-0.1027	-0.1895	0.0333	-0.3654	-0.0678	0.2169	0.0276	0.0302	0.1704	0.6328	-0.0457	-0.2913	0.5535	-0.202	0.6461	-33.8056	65.4007	-3.2515
4	1.6977	-1.6369	0.5181	2.2814	-0.6579	0.6465	-0.0482	0.015	0.0261	-0.4054	0.0586	0.0086	-0.3451	0.1148	-0.0104	1.1499	0.0696	-0.3112	0.173	-0.1155	0.6162	-11.8479	114.214	-6.0823
5	2.1063	-3.1816	0.1885	5.1468	-0.2431	0.235	-0.1327	-0.1744	-0.1197	-0.2152	0.1458	0.3343	-0.0607	0.3137	-0.0132	0.6414	0.1316	0.1151	0.6117	-0.1242	0.7311	18.4169	75.9191	14.2255
6	0.7197	-0.2806	-1.1811	0.6891	0.525	1.9976	0.0307	-0.1934	0.0386	0.0835	0.024	-0.5446	-0.1202	0.1812	-0.0547	0.2738	0.0578	-0.0413	0.7665	-0.0963	0.8494	20.5137	19.806	-2.2936
7	1.2183	-0.3571	-2.2693	0.2687	0.5367	4.8606	-0.0773	0.0024	-0.2899	0.0883	0.0422	0.063	0.1537	-0.1574	0.0351	0.6248	0.0564	0.0043	0.7181	0.1745	0.5921	-26.6571	13.9691	33.9498
8	1.7934	2.3276	0.7484	3.1282	0.9934	0.3345	0.0604	0.2553	-0.1817	0.1217	0.0921	-0.223	-0.0232	0.0555	-0.1525	0.6357	-0.0222	-0.3747	0.4994	-0.0259	1.0395	-41.7309	-23.8091	14.8696
9	0.6866	-0.214	-1.0697	0.43	0.6313	2.4137	0.0911	-0.0962	-0.2038	0.0884	0.0486	-0.2526	0.2267	0.0175	-0.1397	0.5616	0.1847	-0.0317	0.48	0.0034	0.7447	-2.3972	-5.7339	-10.182
10	1.1298	-1.0526	-2.5161	1.1616	2.459	6.1975	-0.0605	-0.0092	-0.1486	0.2474	0.051	-0.1093	0.0879	-0.0318	0.0095	0.6906	0.0009	-0.0629	0.7094	0.0131	0.461	-13.8574	29.0992	37.9332
11	0.5238	0.4851	1.0931	0.6154	1.383	3.1214	-0.4544	0.081	0.3	-0.1758	0.0625	0.2152	-0.429	0.149	0.3919	0.8006	-0.1518	-0.1268	0.4182	-0.0195	0.8032	-3.0466	69.289	-25.2073
12	3.5706	-0.7837	0.9888	0.2366	-0.4737	1.5734	0.0495	0.2116	0.0284	-0.0231	-0.1275	-0.0264	0.0472	0.0591	0.078	0.7184	-0.1527	-0.2605	0.5168	0.2698	0.6101	29.122	22.0442	45.7761
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16	1.2659	1.3454	-0.2397	1.5039	-0.2803	1.1187	0.1352	0.1896	-0.0783	0.2529	0.107	-0.1183	0.7662	0.3043	-0.2422	0.9922	0.123	-0.0396	0.2483	-0.2172	0.9031	-85.5283	-30.2918	-20.154
17	4.0364	3.8966	-1.7001	4.0335	-1.6405	1.2548	0.1417	-0.0231	0.2919	0.2788	-0.0858	0.3386	0.1495	0.5283	-0.0559	0.3573	-0.0347	-0.0529	0.8469	-0.1037	0.7055	-60.7602	16.413	-29.4922
18	1.773	-1.2742	0.4714	1.7564	-0.1226	1.0523	0.5826	0.7699	-0.4289	-0.0971	-0.6486	0.442	0.6003	-0.3384	0.066	0.6822	-0.0099	-0.192	0.6973	-0.3833	0.6237	-36.753	-21.1731	-26.4758
19	1.6944	-0.2284	-0.4903	0.4383	0.7712	1.3959	0.0531	-0.6553	-0.1269	-0.0788	-0.074	-0.0125	-0.1257	0.0526	0.0209	0.6257	0.1832	0.4183	0.9382	0.1159	0.664	-19.8881	82.0112	65.3566
20	5.0326	0.8478	-2.7372	0.764	-0.1453	1.6881	0.3919	-1.4073	0.3942	0.3159	-0.2079	0.1843	-0.1683	0.8825	-0.184	0.8529	0.211	0.1755	1.1599	-0.1449	0.077	-10.6925	81.1083	81.2426
21	0.4393	0.3576	-0.3756	3.2016	2.0914	2.5099	0.0773	0.0139	-0.0226	0.1244	-0.5039	0.59	0.2324	-0.5298	0.4266	0.4564	-0.0667	-0.4632	0.658	-0.1518	0.8624	-60.1491	-22.7318	14.137
22	0.3164	0.3608	-0.5296	3.5009	-1.6783	1.3299	0.2055	-0.1903	-0.0538	0.3823	-0.3251	0.3715	-0.5281	0.2291	0.1196	0.7369	-0.1636	-0.384	0.5522	-0.2515	0.6665	-30.6634	80.8021	5.7811
23	0.9279	-0.8315	0.7797	3.9209	1.4661	2.5524	0.1355	0.1969	0.2019	0.9083	0.0444	-0.6167	0.7641	-0.0816	-0.1799	0.581	0.0309	-0.1523	0.491	0.0351	0.6817	-23.2046	-18.0899	-14.7952
24	1.7833	-0.0535	1.2373	0.3466	0.3676	2.8572	-0.1928	0.1076	-0.2512	-0.0545	0.1145	0.0554	0.2725	-0.1289	0.0783	0.7607	-0.178	0.021	0.2764	-0.1972	0.722	-10.2289	52.6136	-24.0171

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	1 - 337
2	X-RAY DIFFRACTION	2	B	1 - 177
3	X-RAY DIFFRACTION	3	C	3 - 221
4	X-RAY DIFFRACTION	4	E	1 - 340
5	X-RAY DIFFRACTION	5	F	1 - 175
6	X-RAY DIFFRACTION	6	G	1 - 336
7	X-RAY DIFFRACTION	7	H	1 - 175
8	X-RAY DIFFRACTION	8	I	3 - 221
9	X-RAY DIFFRACTION	9	K	1 - 337
10	X-RAY DIFFRACTION	10	L	1 - 175
11	X-RAY DIFFRACTION	11	M	3 - 221
12	X-RAY DIFFRACTION	12	O	3 - 221
13	X-RAY DIFFRACTION	13	P	2 - 214
14	X-RAY DIFFRACTION	14	Q	1 - 337
15	X-RAY DIFFRACTION	15	R	1 - 177
16	X-RAY DIFFRACTION	16	S	1 - 341
17	X-RAY DIFFRACTION	17	T	1 - 175
18	X-RAY DIFFRACTION	18	V	3 - 221
19	X-RAY DIFFRACTION	19	Y	3 - 221
20	X-RAY DIFFRACTION	20	U	1 - 214
21	X-RAY DIFFRACTION	21	J	1 - 214
22	X-RAY DIFFRACTION	22	D	1 - 214
23	X-RAY DIFFRACTION	23	W	1 - 214
24	X-RAY DIFFRACTION	24	N	1 - 214

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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