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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7bgt | ||||||
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タイトル | Mason-Pfizer Monkey Virus Protease mutant C7A/D26N/C106A in complex with peptidomimetic inhibitor | ||||||
要素 |
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キーワード | HYDROLASE (加水分解酵素) / Mason-Pfizer Monkey Virus / M-PMV / retropepsin / active site inhibitor / active site mutant | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 dUTP diphosphatase / dUTP diphosphatase activity / 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素; アスパラギン酸プロテアーゼ / リボヌクレアーゼH / RNA stem-loop binding / DNA integration / 逆転写酵素 / viral genome integration into host DNA / establishment of integrated proviral latency / RNA-directed DNA polymerase activity ...dUTP diphosphatase / dUTP diphosphatase activity / 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素; アスパラギン酸プロテアーゼ / リボヌクレアーゼH / RNA stem-loop binding / DNA integration / 逆転写酵素 / viral genome integration into host DNA / establishment of integrated proviral latency / RNA-directed DNA polymerase activity / RNA-DNA hybrid ribonuclease activity / 転移酵素; リンを含む基を移すもの; 核酸を移すもの / viral nucleocapsid / DNA recombination / structural constituent of virion / 加水分解酵素; エステル加水分解酵素 / DNAポリメラーゼ / aspartic-type endopeptidase activity / DNA-directed DNA polymerase activity / symbiont entry into host cell / タンパク質分解 / DNA binding / zinc ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Mason-Pfizer monkey virus (ウイルス) synthetic construct (人工物) | ||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.93 Å | ||||||
データ登録者 | Wosicki, S. / Gilski, M. / Jaskolski, M. / Zabranska, H. / Pichova, I. | ||||||
資金援助 | チェコ, 1件
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引用 | ジャーナル: Protein Sci. / 年: 2021 タイトル: Crystal structures of inhibitor complexes of M-PMV protease with visible flap loops. 著者: Wosicki, S. / Kazmierczyk, M. / Gilski, M. / Zabranska, H. / Pichova, I. / Jaskolski, M. #1: ジャーナル: Acta Crystallogr D Struct Biol / 年: 2019 タイトル: Comparison of a retroviral protease in monomeric and dimeric states. 著者: Wosicki, S. / Gilski, M. / Zabranska, H. / Pichova, I. / Jaskolski, M. #2: ジャーナル: Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr. / 年: 2011 タイトル: High-resolution structure of a retroviral protease folded as a monomer. 著者: Gilski, M. / Kazmierczyk, M. / Krzywda, S. / Zabranska, H. / Cooper, S. / Popovic, Z. / Khatib, F. / DiMaio, F. / Thompson, J. / Baker, D. / Pichova, I. / Jaskolski, M. #3: ジャーナル: Nature / 年: 1989 タイトル: Crystal structure of a retroviral protease proves relationship to aspartic protease family. 著者: Miller, M. / Jaskolski, M. / Rao, J.K. / Leis, J. / Wlodawer, A. #4: ジャーナル: Science / 年: 1989 タイトル: Conserved folding in retroviral proteases: crystal structure of a synthetic HIV-1 protease. 著者: Wlodawer, A. / Miller, M. / Jaskolski, M. / Sathyanarayana, B.K. / Baldwin, E. / Weber, I.T. / Selk, L.M. / Clawson, L. / Schneider, J. / Kent, S.B. #5: ジャーナル: Nat. Struct. Mol. Biol. / 年: 2011 タイトル: Crystal structure of a monomeric retroviral protease solved by protein folding game players. 著者: Khatib, F. / DiMaio, F. / Cooper, S. / Kazmierczyk, M. / Gilski, M. / Krzywda, S. / Zabranska, H. / Pichova, I. / Thompson, J. / Popovic, Z. / Jaskolski, M. / Baker, D. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 7bgt.cif.gz | 207.1 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb7bgt.ent.gz | 157.4 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 7bgt.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bg/7bgt ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bg/7bgt | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | 7bguC 6s1vS S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献) |
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類似構造データ | |
実験データセット #1 | データ参照: 10.18150/1HQGWO / データの種類: diffraction image data |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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