登録情報 | データベース: PDB / ID: 6rma |
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タイトル | Crystal structure of the DEAH-box ATPase Prp2 in complex with Spp2 and ADP |
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要素 | - Putative mRNA splicing factor
- Putative pre-mRNA splicing protein
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キーワード | HYDROLASE (加水分解酵素) / Prp2 / DEAH-box ATPase / G-patch / spliceosome (スプライセオソーム) |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
spliceosomal complex / mRNA splicing, via spliceosome / nucleic acid binding / hydrolase activity / ヘリカーゼ / ribonucleoprotein complex / ATP binding類似検索 - 分子機能 Spp2/MOS2, G-patch domain / G-patch domain / G-patch domain / G-patch domain profile. / G-patch domain / glycine rich nucleic binding domain / : / Helicase associated domain (HA2), ratchet-like / DEAD-box helicase, OB fold / Oligonucleotide/oligosaccharide-binding (OB)-fold ...Spp2/MOS2, G-patch domain / G-patch domain / G-patch domain / G-patch domain profile. / G-patch domain / glycine rich nucleic binding domain / : / Helicase associated domain (HA2), ratchet-like / DEAD-box helicase, OB fold / Oligonucleotide/oligosaccharide-binding (OB)-fold / Helicase-associated domain / Helicase associated domain (HA2), winged-helix / Helicase associated domain (HA2) Add an annotation / DNA/RNA helicase, ATP-dependent, DEAH-box type, conserved site / DEAH-box subfamily ATP-dependent helicases signature. / DEAD/DEAH box helicase / DEAD/DEAH box helicase domain / Helicase conserved C-terminal domain / RNA-binding domain superfamily / helicase superfamily c-terminal domain / Superfamilies 1 and 2 helicase C-terminal domain profile. / Superfamilies 1 and 2 helicase ATP-binding type-1 domain profile. / DEAD-like helicases superfamily / Helicase, C-terminal / Helicase superfamily 1/2, ATP-binding domain / Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase類似検索 - ドメイン・相同性 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / 2-プロパノール / ヘリカーゼ / Putative pre-mRNA splicing protein類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Chaetomium thermophilum var. thermophilum DSM 1495 (菌類) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.1 Å |
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データ登録者 | Hamann, F. / Neumann, P. / Ficner, R. |
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引用 | ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2020 タイトル: Structural analysis of the intrinsically disordered splicing factor Spp2 and its binding to the DEAH-box ATPase Prp2. 著者: Hamann, F. / Schmitt, A. / Favretto, F. / Hofele, R. / Neumann, P. / Xiang, S. / Urlaub, H. / Zweckstetter, M. / Ficner, R. |
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履歴 | 登録 | 2019年5月6日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2020年2月5日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2020年2月19日 | Group: Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title |
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改定 1.2 | 2024年5月15日 | Group: Advisory / Data collection ...Advisory / Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / refine / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _refine.pdbx_diffrn_id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id |
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