登録情報 データベース : PDB / ID : 6ntz 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of E. coli PBP5-meropenem 要素D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase Muramoylpentapeptide carboxypeptidase 詳細 キーワード hydrolase/antibiotic / carboxypeptidase / HYDROLASE (加水分解酵素) / hydrolase-hydrolase inhibitor complex / hydrolase-antibiotic complex機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
peptidoglycan metabolic process / serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase / serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase activity / penicillin binding / peptidoglycan biosynthetic process / carboxypeptidase activity / cell wall organization / beta-lactamase activity / Β-ラクタマーゼ / regulation of cell shape ... peptidoglycan metabolic process / serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase / serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase activity / penicillin binding / peptidoglycan biosynthetic process / carboxypeptidase activity / cell wall organization / beta-lactamase activity / Β-ラクタマーゼ / regulation of cell shape / outer membrane-bounded periplasmic space / protein homodimerization activity / タンパク質分解 / 細胞膜 類似検索 - 分子機能 Peptidoglycan synthesis regulatory factor (PBP3), Domain 2 / D-Ala-D-Ala carboxypeptidase, C-terminal domain / D-Ala-D-Ala carboxypeptidase, C-terminal domain superfamily / Peptidase S11, D-Ala-D-Ala carboxypeptidase A, C-terminal / Penicillin-binding protein 5, C-terminal domain / Penicillin-binding protein 5, C-terminal domain / Penicillin-binding protein, C-terminal domain superfamily / Peptidase S11, D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase A, N-terminal / Peptidase S11, D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase A / D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase ... Peptidoglycan synthesis regulatory factor (PBP3), Domain 2 / D-Ala-D-Ala carboxypeptidase, C-terminal domain / D-Ala-D-Ala carboxypeptidase, C-terminal domain superfamily / Peptidase S11, D-Ala-D-Ala carboxypeptidase A, C-terminal / Penicillin-binding protein 5, C-terminal domain / Penicillin-binding protein 5, C-terminal domain / Penicillin-binding protein, C-terminal domain superfamily / Peptidase S11, D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase A, N-terminal / Peptidase S11, D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase A / D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase / Β-ラクタマーゼ / DD-peptidase/beta-lactamase superfamily / Beta-lactamase/transpeptidase-like / サンドイッチ / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-MXR / Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase / D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase DacA 類似検索 - 構成要素生物種 Escherichia coli (大腸菌)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.2 Å 詳細データ登録者 Caveney, N.A. / Strynadka, N.C.J. / Caballero, G. / Worrall, L.J. 資金援助 カナダ, 1件 詳細 詳細を隠す組織 認可番号 国 Canadian Institutes of Health Research (CIHR) カナダ
引用ジャーナル : Nat Commun / 年 : 2019タイトル : Structural insight into YcbB-mediated beta-lactam resistance in Escherichia coli.著者 : Caveney, N.A. / Caballero, G. / Voedts, H. / Niciforovic, A. / Worrall, L.J. / Vuckovic, M. / Fonvielle, M. / Hugonnet, J.E. / Arthur, M. / Strynadka, N.C.J. 履歴 登録 2019年1月30日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2019年3月20日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2019年5月8日 Group : Data collection / Database references / カテゴリ : citation / citation_authorItem : _citation.journal_volume / _citation.page_first ... _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation_author.identifier_ORCID / _citation_author.name 改定 1.2 2020年1月8日 Group : Author supporting evidence / カテゴリ : pdbx_audit_support / Item : _pdbx_audit_support.funding_organization改定 1.3 2023年10月11日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id
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