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Yorodumi- PDB-6ay1: Crystal structure of a nucleoside diphosphate kinase NDK from Hel... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 6ay1 | ||||||
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Title | Crystal structure of a nucleoside diphosphate kinase NDK from Helicobacter pylori | ||||||
Components | Nucleoside diphosphate kinaseNucleoside-diphosphate kinase | ||||||
Keywords | TRANSFERASE / NIAID / structural genomics / NDK / NDPK / kinase / ATP-dependent / Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease / SSGCID | ||||||
Function / homology | Function and homology information nucleoside-diphosphate kinase / CTP biosynthetic process / UTP biosynthetic process / GTP biosynthetic process / nucleoside diphosphate kinase activity / ATP binding / metal ion binding / cytoplasm Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Helicobacter pylori (bacteria) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / molecular replacement / Resolution: 2.05 Å | ||||||
Authors | Edwards, T.E. / Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID) | ||||||
Citation | Journal: To be Published Title: Crystal structure of a nucleoside diphosphate kinase NDK from Helicobacter pylori Authors: Edwards, T.E. / Dranow, D.M. / Lorimer, D.D. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 6ay1.cif.gz | 422.4 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb6ay1.ent.gz | 346.4 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 6ay1.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ay/6ay1 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ay/6ay1 | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Related structure data | 4hr2S S: Starting model for refinement |
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Other databases |
-Links
-Assembly
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Ens-ID: 1
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