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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 5xqh | ||||||
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タイトル | Crystal structure of truncated human Rogdi | ||||||
![]() | Protein rogdi homolog | ||||||
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機能・相同性 | ![]() RAVE complex / odontogenesis of dentin-containing tooth / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Lee, H. / Lee, C. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The crystal structure of human Rogdi provides insight into the causes of Kohlschutter-Tonz Syndrome 著者: Lee, H. / Jeong, H. / Choe, J. / Jun, Y. / Lim, C. / Lee, C. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 58 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 44.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 30328.027 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 11-276 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / ![]() |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.66 Å3/Da / 溶媒含有率: 53.77 % |
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結晶化![]() | 温度: 277.15 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: 11% PEG 4000, 100mM MES pH 6.5, 5mM DTT |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2014年7月8日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 2.04→50 Å / Num. obs: 39509 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 9.4 % / Rmerge(I) obs: 0.082 / Net I/σ(I): 49.8 |
反射 シェル | 最高解像度: 2.04 Å / 冗長度: 9.3 % / Rmerge(I) obs: 0.469 / Mean I/σ(I) obs: 5.9 / % possible all: 99.9 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]() 詳細: THE STRUCTURE FACTOR FILE CONTAINS FRIEDEL PAIRS IN I_PLUS/MINUS COLUMNS
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.04→34.57 Å
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