- PDB-5vtd: Crystal Structure of the Co-bound Human Heavy-Chain Ferritin vari... -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 5vtd
タイトル
Crystal Structure of the Co-bound Human Heavy-Chain Ferritin variant 122H-delta C-star
要素
Ferritin heavy chainフェリチン
キーワード
OXIDOREDUCTASE (酸化還元酵素) / Node / Maxi-ferritin
機能・相同性
機能・相同性情報
iron ion sequestering activity / : / オートファゴソーム / Scavenging by Class A Receptors / Golgi Associated Vesicle Biogenesis / ferroxidase / intracellular sequestering of iron ion / ferroxidase activity / negative regulation of fibroblast proliferation / ferric iron binding ...iron ion sequestering activity / : / オートファゴソーム / Scavenging by Class A Receptors / Golgi Associated Vesicle Biogenesis / ferroxidase / intracellular sequestering of iron ion / ferroxidase activity / negative regulation of fibroblast proliferation / ferric iron binding / ferrous iron binding / Iron uptake and transport / tertiary granule lumen / iron ion transport / intracellular iron ion homeostasis / ficolin-1-rich granule lumen / 免疫応答 / iron ion binding / negative regulation of cell population proliferation / Neutrophil degranulation / extracellular exosome / extracellular region / identical protein binding / 細胞核 / 細胞質基質 / 細胞質 類似検索 - 分子機能
温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 詳細: Reservoir: 500 uL total volume: 25 mM Tris (pH 8), 12 mM CaCl2, 150 mM NaCl, 0.3 mM CoCl2, 1% PEG 1900 MME Sitting Drop: 2 uL reservoir, 2 uL of 4 uM ferritin
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データ収集
回折
平均測定温度: 100 K
放射光源
由来: 回転陽極 / タイプ: BRUKER AXS MICROSTAR / 波長: 1.5418 Å
検出器
タイプ: APEX II CCD / 検出器: CCD / 日付: 2017年5月6日
放射
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1.5418 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.95→63.72 Å / Num. obs: 18852 / % possible obs: 99.5 % / 冗長度: 8.1 % / CC1/2: 0.991 / Rmerge(I) obs: 0.132 / Net I/σ(I): 10.9
反射 シェル
解像度: 1.95→2.03 Å / 冗長度: 4.2 % / Rmerge(I) obs: 0.607 / Mean I/σ(I) obs: 2 / CC1/2: 0.797 / % possible all: 98.7