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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 5u2w
タイトルCrystal structure of a Short chain dehydrogenase from Burkholderia cenocepacia J2315 in complex with NADP
要素Short chain dehydrogenase
キーワードOXIDOREDUCTASE (酸化還元酵素) / Structural Genomics (構造ゲノミクス) / Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease / SSGCID
機能・相同性
機能・相同性情報


: / nucleotide binding
類似検索 - 分子機能
short chain dehydrogenase / Short-chain dehydrogenase/reductase SDR / NAD(P)-binding Rossmann-like Domain / NAD(P)-binding domain superfamily / ロスマンフォールド / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta
類似検索 - ドメイン・相同性
イミダゾール / NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE / Short chain dehydrogenase
類似検索 - 構成要素
生物種Burkholderia cenocepacia (バクテリア)
手法X線回折 / 分子置換 / 解像度: 1.55 Å
データ登録者Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID)
引用ジャーナル: to be published
タイトル: Crystal structure of a Short chain dehydrogenase from Burkholderia cenocepacia J2315 in complex with NADP
著者: Abendroth, J. / Horanyi, P.S. / Lorimer, D.D. / Edwards, T.E.
履歴
登録2016年12月1日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02017年1月18日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12023年10月4日Group: Data collection / Database references / Refinement description
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model
Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
A: Short chain dehydrogenase
B: Short chain dehydrogenase
C: Short chain dehydrogenase
D: Short chain dehydrogenase
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)107,82320
ポリマ-104,0774
非ポリマー3,74716
22,6271256
1


  • 登録構造と同一
  • 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
タイプ名称対称操作
identity operation1_555x,y,z1
Buried area20650 Å2
ΔGint-12 kcal/mol
Surface area29760 Å2
手法PISA
単位格子
Length a, b, c (Å)136.970, 72.370, 100.530
Angle α, β, γ (deg.)90.000, 100.880, 90.000
Int Tables number5
Space group name H-MC121
Components on special symmetry positions
IDモデル要素
11B-407-

HOH

21C-535-

HOH

-
要素

#1: タンパク質
Short chain dehydrogenase


分子量: 26019.244 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現) Burkholderia cenocepacia (strain ATCC BAA-245 / DSM 16553 / LMG 16656 / NCTC 13227 / J2315 / CF5610) (バクテリア)
: ATCC BAA-245 / DSM 16553 / LMG 16656 / NCTC 13227 / J2315 / CF5610
遺伝子: BCAL2464 / プラスミド: BuceA.00010.g.B1 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: B4E730
#2: 化合物
ChemComp-NAP / NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE / 2'-MONOPHOSPHOADENOSINE 5'-DIPHOSPHORIBOSE / ニコチンアミドアデニンジヌクレオチドリン酸


分子量: 743.405 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / : C21H28N7O17P3
#3: 化合物
ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル / エチレングリコール


分子量: 62.068 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / : C2H6O2
#4: 化合物
ChemComp-IMD / IMIDAZOLE / 1H-イミダゾ-ル-3-カチオン / イミダゾール


分子量: 69.085 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / : C3H5N2
#5: 水 ChemComp-HOH / water /


分子量: 18.015 Da / 分子数: 1256 / 由来タイプ: 天然 / : H2O

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実験情報

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実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶マシュー密度: 2.35 Å3/Da / 溶媒含有率: 47.8 %
結晶化温度: 290 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 6.5
詳細: Molecular Dimensions Morpheus screen G2: 10% w/v PEG 8000, 20% v/v ethylene glycol: 20mM of each sodium formate, ammonium acetate, trisodium citrate, sodium potassium L-tartrate, sodium ...詳細: Molecular Dimensions Morpheus screen G2: 10% w/v PEG 8000, 20% v/v ethylene glycol: 20mM of each sodium formate, ammonium acetate, trisodium citrate, sodium potassium L-tartrate, sodium oxamate: 100mM MES/imidazole pH 6.5: BuceA.00010.g.B1.PW37236 at 20.78mg/ml + 4mM NADP: cryo: direct: tray 285571g2, puck yrq2-3

-
データ収集

回折平均測定温度: 100 K
放射光源由来: 回転陽極 / タイプ: RIGAKU FR-E+ SUPERBRIGHT / 波長: 1.5418 Å
検出器タイプ: RIGAKU SATURN 944+ / 検出器: CCD / 日付: 2016年11月24日
放射プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 1.5418 Å / 相対比: 1
反射解像度: 1.55→43.945 Å / Num. obs: 137073 / % possible obs: 98 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 14.301 % / Biso Wilson estimate: 10.88 Å2 / CC1/2: 1 / Rmerge(I) obs: 0.047 / Net I/σ(I): 38.65
反射 シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)冗長度 (%)Rmerge(I) obsMean I/σ(I) obsNum. unique allCC1/2% possible all
1.55-1.598.3090.396.01126230.91190.4
1.59-1.6310.3560.327.640.95194
1.63-1.6811.2940.2668.980.9795.5
1.68-1.7311.6340.22210.770.98196.7
1.73-1.7912.0320.19112.530.98898
1.79-1.8512.4450.15715.030.99298.8
1.85-1.9212.8760.12119.080.99699.6
1.92-213.2910.10224.040.99799.9
2-2.0913.8780.08130.060.99899.9
2.09-2.1914.3360.06438.680.999100
2.19-2.3113.1580.06742.50.99999.8
2.31-2.4515.0250.05349.930.99999.8
2.45-2.6214.130.05454.370.99999.8
2.62-2.8316.2520.04263.991100
2.83-3.117.5320.03575.25199.9
3.1-3.4718.2120.03586.751100
3.47-423.1090.027113.33199.9
4-4.929.0390.025137.29199.8
4.9-6.9329.480.026127.621100
6.93-43.94527.9220.022139.720.99999.3

-
位相決定

位相決定手法: 分子置換

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
XDSデータ削減
XSCALEデータスケーリング
MOLREP位相決定
PHENIXモデル構築
Cootモデル構築
PHENIX(dev_2597)精密化
PDB_EXTRACTデータ抽出
精密化構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: PDB entry 3v2g via Balbes
解像度: 1.55→43.945 Å / SU ML: 0.12 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 15.22
Rfactor反射数%反射
Rfree0.1632 2019 1.47 %
Rwork0.1369 --
obs0.1373 137043 98.04 %
溶媒の処理減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å
原子変位パラメータBiso max: 61.99 Å2 / Biso mean: 15.5888 Å2 / Biso min: 4.38 Å2
精密化ステップサイクル: final / 解像度: 1.55→43.945 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数6919 0 244 1314 8477
Biso mean--12.98 28.64 -
残基数----981
拘束条件
Refine-IDタイプDev ideal
X-RAY DIFFRACTIONf_bond_d0.0087512
X-RAY DIFFRACTIONf_angle_d1.01710261
X-RAY DIFFRACTIONf_chiral_restr0.0641206
X-RAY DIFFRACTIONf_plane_restr0.0061454
X-RAY DIFFRACTIONf_dihedral_angle_d12.9514622
LS精密化 シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Rfactor Rfree error: 0 / Total num. of bins used: 14

解像度 (Å)Rfactor RfreeNum. reflection RfreeRfactor RworkNum. reflection RworkNum. reflection all% reflection obs (%)
1.55-1.58880.24141270.18648807893490
1.5888-1.63170.19221520.1569173932594
1.6317-1.67970.17141360.14799375951195
1.6797-1.7340.19141460.14339475962197
1.734-1.79590.16181230.13899642976598
1.7959-1.86780.15371370.13859658979599
1.8678-1.95290.18191480.139298179965100
1.9529-2.05580.17741580.13897799937100
2.0558-2.18460.1361380.12998379975100
2.1846-2.35330.13391450.130698289973100
2.3533-2.59010.18231580.136298359993100
2.5901-2.96480.16921550.1372984810003100
2.9648-3.7350.15871480.1304989410042100
3.735-43.96290.14491480.13191005610204100
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL112)L122)L132)L222)L232)L332)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T112)T122)T132)T222)T232)T332)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
12.4319-0.19430.25854.9011-0.93263.0259-0.0180.45410.0571-0.276-0.0320.0549-0.1293-0.07240.02250.0658-0.00370.02770.14390.00150.054949.14093.81211.3809
22.5790.27120.19851.51810.25222.3267-0.07840.1835-0.0818-0.05440.051-0.05960.0210.03770.01250.06030.0020.03380.0732-0.02060.069151.6608-1.76363.5201
31.22210.09050.68551.48951.33645.2645-0.00820.2601-0.1336-0.19940.0577-0.1345-0.08240.3262-0.03470.08140.00770.03930.1499-0.01750.133558.5004-1.09382.5199
44.058-1.89173.12433.8909-4.2777.2854-0.0930.06880.21880.1254-0.1541-0.3709-0.40570.510.1450.0677-0.0230.01030.0971-0.00050.12159.42510.05299.9047
50.9127-0.51970.19982.0486-2.35844.6905-0.0454-0.1128-0.1192-0.0344-0.0088-0.09720.25630.21560.04630.06160.02040.00220.068200.101751.8892-3.780622.7772
60.747-0.0784-0.02621.0497-0.68181.2688-0.005-0.00930.0527-0.03090.01870.03420.00590.0099-0.0090.0422-0.0017-0.00270.0419-0.01310.047243.6454.488118.666
71.3165-0.6958-0.08073.88530.50350.4876-0.0543-0.0092-0.25080.07090.0278-0.1570.14010.09970.00240.09020.01390.01620.061-0.00040.114143.3673-8.516213.6982
81.06490.7657-0.76223.6574-1.81562.0088-0.10240.0247-0.2159-0.10690.0706-0.12820.23580.04090.03540.08080.002-0.00270.0635-0.01940.093137.5066-13.022610.4636
91.46510.01430.17330.23050.21971.1266-0.00290.06570.0888-0.08930.0095-0.0123-0.0270.0520.00080.0442-0.00540.00320.0529-0.01390.059334.14891.178310.4504
102.30970.9235-0.02215.7917-0.8091.6510.0366-0.406-0.12150.2130.05970.21460.125-0.215-0.08550.1142-0.0128-0.02050.22590.02030.063439.23370.451553.0192
112.18450.03090.15310.9853-0.18871.7697-0.0741-0.26230.06170.0160.08380.0171-0.0097-0.0962-0.01770.09850.0244-0.00620.1483-0.03010.047640.88526.411251.9754
120.7883-0.449-0.38720.78620.93472.2152-0.0757-0.22990.05270.12520.1123-0.03050.07330.1282-0.03460.11080.0182-0.01130.164-0.03340.090946.49896.998455.7295
136.11822.1018-3.97821.9256-1.5192.849-0.1023-0.3846-0.13390.05490.0498-0.16080.33860.33940.07670.0940.033-0.02840.1729-0.020.097252.8763-3.77549.5177
141.00170.5662-0.46671.9686-1.50633.2242-0.0131-0.00530.0398-0.00030.0335-0.065-0.12010.1195-0.00530.0588-0.0093-0.02140.0861-0.02860.07148.50784.650836.241
150.9695-0.8040.8532.5514-2.64173.86570.0336-0.0749-0.037-0.02520.12560.1475-0.0002-0.1441-0.16490.05290.0021-0.00590.0647-0.01140.054436.80082.716535.5873
160.9716-0.04120.10140.19520.25680.7491-0.0241-0.08590.04630.04120.016-0.0071-0.05320.02460.00890.06840.0066-0.01040.0781-0.0050.054238.2833.303136.0496
170.6018-0.41620.6133.1412-2.20112.6903-0.0742-0.08210.11680.0680.0214-0.0536-0.2256-0.01220.04090.10320.0221-0.00610.1193-0.04350.091628.46914.153739.5778
180.6574-0.53270.42293.8476-1.15780.82720.0048-0.1538-0.01550.12770.0258-0.04210.0033-0.047-0.03920.06190.0102-0.00530.1-0.00140.049828.19850.318838.6809
192.7627-0.7633-0.28014.97610.70192.1706-0.01960.337-0.1325-0.1884-0.06770.00190.04960.09440.03950.0594-0.0068-0.01710.09540.00340.016419.4902-4.1425-4.2471
203.1355-0.0111-0.16511.56670.15151.7532-0.04260.11860.0265-0.04890.0015-0.0241-0.0339-0.01520.02810.0665-0.0065-0.01180.05190.01430.022916.63521.3852-3.7296
213.4066-3.3446-3.90425.2132.07176.46630.06040.34890.1499-0.3174-0.0703-0.0984-0.1929-0.0764-0.03440.1372-0.0259-0.04470.1390.04480.095813.33993.8863-11.1925
222.0280.0449-1.991.2243-0.14144.57140.01390.10070.0632-0.15310.0351-0.0065-0.010.0301-0.03090.0655-0.0083-0.0240.0764-0.00410.04959.6665-2.8723-4.3187
234.4829-2.893-4.9642.66163.11715.5008-0.13570.1589-0.19150.0081-0.01140.16180.2851-0.24510.20380.0759-0.0063-0.01270.0958-0.00490.09756.8592-10.5967-0.0454
241.3572-0.7196-0.61361.67651.10412.6753-0.0149-0.04770.08640.03650.04660.0144-0.107-0.1322-0.02380.0380.0059-0.01640.05790.01270.05749.43990.351312.4206
250.90440.20270.19771.42681.22971.8180.0123-0.0120.03840.00250.1071-0.1456-0.07340.0976-0.10030.05910.0051-0.01020.03940.00670.060820.9190.294213.106
261.1073-1.0716-0.31272.4390.84620.7980.0123-0.0207-0.04840.02250.0118-0.0430.0327-0.0307-0.01890.0558-0.0086-0.00640.05470.01160.042518.207-4.424217.0474
271.4837-0.6852-0.25413.891-0.27951.7227-0.00150.0362-0.134-0.18510.04260.18420.1618-0.0670.01220.063-0.01-0.01490.0320.00120.063923.6673-8.72669.8113
283.26150.29991.09147.4366-0.88850.4991-0.2089-0.17410.71180.11040.01580.4089-0.2296-0.28620.12810.15740.0165-0.050.0961-0.01380.202618.11417.08177.6681
290.7823-0.01930.50383.94272.06452.3616-0.08740.0360.1518-0.13250.01930.0932-0.241-0.02420.05760.082-0.0186-0.00210.07170.02030.092227.194612.79697.7972
300.81130.2670.28962.52680.85940.883-0.01020.0769-0.0319-0.09770.0449-0.00010.00620.0386-0.04510.0636-0.0114-0.00310.05820.00010.063630.14-0.76379.9859
312.36910.3278-0.09015.83830.90982.05880.1031-0.30930.19780.329-0.0337-0.0461-0.107-0.0627-0.06870.09730.00910.03150.1923-0.00920.07078.10941.00645.938
320.99170.2983-0.21171.2539-0.22321.124-0.0136-0.32960.00420.13320.02250.1375-0.012-0.0598-0.01710.09910.01830.0290.19090.03130.09074.9918-6.438246.9782
331.15310.4142-0.09831.97790.97834.7949-0.0142-0.19750.19940.10170.04870.2965-0.1408-0.26350.00860.07770.03930.04420.21860.02140.1658-1.54341.960239.9832
341.0796-0.2858-0.31491.18580.60971.6089-0.0163-0.0514-0.01810.05550.04210.09170.0539-0.1363-0.01040.0579-0.00830.00970.0850.03420.068810.4241-3.338328.8919
350.75390.0301-0.0630.1392-0.18470.888-0.0331-0.0966-0.07490.02610.02230.04740.0378-0.08410.00790.0480.00690.01010.08820.01510.063615.9881-2.430731.52
361.5433-1.6174-1.13763.73251.90141.9326-0.1166-0.1498-0.17930.14740.07220.14590.1931-0.02120.05850.0734-0.0033-0.00650.12110.04410.076823.418-12.932739.1957
371.8855-0.4430.09281.0533-0.69390.61550.0036-0.15760.05990.0508-0.02440.0765-0.0966-0.05490.01290.05930.00230.00130.10510.00450.043224.07691.391738.1462
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDSelection detailsAuth asym-IDAuth seq-ID
1X-RAY DIFFRACTION1chain 'A' and (resid 1 through 16 )A1 - 16
2X-RAY DIFFRACTION2chain 'A' and (resid 17 through 40 )A17 - 40
3X-RAY DIFFRACTION3chain 'A' and (resid 41 through 67 )A41 - 67
4X-RAY DIFFRACTION4chain 'A' and (resid 68 through 82 )A68 - 82
5X-RAY DIFFRACTION5chain 'A' and (resid 83 through 116 )A83 - 116
6X-RAY DIFFRACTION6chain 'A' and (resid 117 through 176 )A117 - 176
7X-RAY DIFFRACTION7chain 'A' and (resid 177 through 199 )A177 - 199
8X-RAY DIFFRACTION8chain 'A' and (resid 200 through 225 )A200 - 225
9X-RAY DIFFRACTION9chain 'A' and (resid 226 through 246 )A226 - 246
10X-RAY DIFFRACTION10chain 'B' and (resid 2 through 16 )B2 - 16
11X-RAY DIFFRACTION11chain 'B' and (resid 17 through 40 )B17 - 40
12X-RAY DIFFRACTION12chain 'B' and (resid 41 through 67 )B41 - 67
13X-RAY DIFFRACTION13chain 'B' and (resid 68 through 82 )B68 - 82
14X-RAY DIFFRACTION14chain 'B' and (resid 83 through 128 )B83 - 128
15X-RAY DIFFRACTION15chain 'B' and (resid 129 through 152 )B129 - 152
16X-RAY DIFFRACTION16chain 'B' and (resid 153 through 199 )B153 - 199
17X-RAY DIFFRACTION17chain 'B' and (resid 200 through 225 )B200 - 225
18X-RAY DIFFRACTION18chain 'B' and (resid 226 through 246 )B226 - 246
19X-RAY DIFFRACTION19chain 'C' and (resid 2 through 16 )C2 - 16
20X-RAY DIFFRACTION20chain 'C' and (resid 17 through 40 )C17 - 40
21X-RAY DIFFRACTION21chain 'C' and (resid 41 through 54 )C41 - 54
22X-RAY DIFFRACTION22chain 'C' and (resid 55 through 67 )C55 - 67
23X-RAY DIFFRACTION23chain 'C' and (resid 68 through 82 )C68 - 82
24X-RAY DIFFRACTION24chain 'C' and (resid 83 through 128 )C83 - 128
25X-RAY DIFFRACTION25chain 'C' and (resid 129 through 152 )C129 - 152
26X-RAY DIFFRACTION26chain 'C' and (resid 153 through 173 )C153 - 173
27X-RAY DIFFRACTION27chain 'C' and (resid 174 through 185 )C174 - 185
28X-RAY DIFFRACTION28chain 'C' and (resid 186 through 199 )C186 - 199
29X-RAY DIFFRACTION29chain 'C' and (resid 200 through 225 )C200 - 225
30X-RAY DIFFRACTION30chain 'C' and (resid 226 through 246 )C226 - 246
31X-RAY DIFFRACTION31chain 'D' and (resid 2 through 16 )D2 - 16
32X-RAY DIFFRACTION32chain 'D' and (resid 17 through 54 )D17 - 54
33X-RAY DIFFRACTION33chain 'D' and (resid 55 through 82 )D55 - 82
34X-RAY DIFFRACTION34chain 'D' and (resid 83 through 152 )D83 - 152
35X-RAY DIFFRACTION35chain 'D' and (resid 153 through 199 )D153 - 199
36X-RAY DIFFRACTION36chain 'D' and (resid 200 through 225 )D200 - 225
37X-RAY DIFFRACTION37chain 'D' and (resid 226 through 246 )D226 - 246

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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