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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 5im5 | ||||||
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タイトル | Crystal structure of designed two-component self-assembling icosahedral cage I53-40 | ||||||
要素 |
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キーワード | PROTEIN BINDING (タンパク質) / icosahedron (二十面体) / designed protein cage (デザイン) / two-component / computational design / protein engineering (タンパク質工学) / Rosetta / self-assembling / co-assembling / multimerization / symmetry (対称性) / nanomaterial (ナノマテリアル) / nanostructure (ナノ構造体) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 riboflavin synthase / riboflavin synthase activity / 2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate aldolase / 2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate aldolase activity / riboflavin synthase complex / riboflavin biosynthetic process 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Methanocaldococcus jannaschii (メタン生成菌) Vibrionales bacterium (バクテリア) | ||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 3.699 Å | ||||||
データ登録者 | Liu, Y.A. / Cascio, D. / Sawaya, M.R. / Bale, J.B. / Collazo, M.J. / Thomas, C. / Sheffler, W. / King, N.P. / Baker, D. / Yeates, T.O. | ||||||
引用 | ジャーナル: Science / 年: 2016 タイトル: Accurate design of megadalton-scale two-component icosahedral protein complexes. 著者: Bale, J.B. / Gonen, S. / Liu, Y. / Sheffler, W. / Ellis, D. / Thomas, C. / Cascio, D. / Yeates, T.O. / Gonen, T. / King, N.P. / Baker, D. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 5im5.cif.gz | 1.9 MB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb5im5.ent.gz | 1.6 MB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 5im5.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/im/5im5 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/im/5im5 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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単位格子 |
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対称性 | 点対称性: (シェーンフリース記号: I (正20面体型対称)) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
非結晶学的対称性 (NCS) | NCSドメイン:
NCSドメイン領域: Component-ID: 1
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