温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 詳細: CaRai1-pU5-Mn2+ complex crystals were obtained using 1:2 protein:RNA molar ratio and 10mM MnCl2 in 0.1M Bis-Tris (pH 5.5) and 18% (w/v) PEG3350
モノクロメーター: Si / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.99→50 Å / Num. obs: 61906 / % possible obs: 99 % / 冗長度: 6.9 % / Rmerge(I) obs: 0.09 / Net I/σ(I): 19.6
反射 シェル
解像度: 2→2.07 Å / 冗長度: 6.5 % / Rmerge(I) obs: 0.422 / Mean I/σ(I) obs: 4.2 / % possible all: 99
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.7.0029
精密化
HKL-2000
データ削減
HKL-2000
データスケーリング
PHASER
位相決定
精密化
構造決定の手法: フーリエ合成 / 解像度: 1.99→47.47 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.957 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.932 / SU B: 3.877 / SU ML: 0.11 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.187 / ESU R Free: 0.173 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.24301
3301
5.1 %
RANDOM
Rwork
0.18651
-
-
-
obs
0.18947
61906
99.2 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK