登録情報 データベース : PDB / ID : 4nii 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of AlkB D135I mutant protein with cofactors bound to dsDNA containing m6A/A 要素5'-D(*AP*AP*CP*GP*GP*TP*AP*TP*TP*AP*CP*CP*T)-3'5'-D(*TP*AP*GP*GP*TP*AP*AP*(6MA)P*AP*CP*CP*GP*T)-3'Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase AlkB 詳細キーワード OXIDOREDUCTASE/DNA / DNA/RNA direct repair / jelly-roll fold / DNA/RNA demethylation repair / Fe(II) (第一鉄) / 2-KG / OXIDOREDUCTASE-DNA complex機能・相同性 機能・相同性情報生物種 Escherichia coli (大腸菌)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.622 Å 詳細データ登録者 Yi, C.Q. / Zhu, C.X. 引用ジャーナル : Angew.Chem.Int.Ed.Engl. / 年 : 2014タイトル : Switching Demethylation Activities between AlkB Family RNA/DNA Demethylases through Exchange of Active-Site Residues.著者 : Zhu, C. / Yi, C. 履歴 登録 2013年11月6日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2014年4月16日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2014年5月28日 Group : Non-polymer description / Structure summary改定 1.2 2023年9月20日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
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