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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4fqy | ||||||
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タイトル | Crystal structure of broadly neutralizing antibody CR9114 bound to H3 influenza hemagglutinin | ||||||
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機能・相同性 | ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Ekiert, D.C. / Dreyfus, C. / Wilson, I.A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Highly conserved protective epitopes on influenza B viruses. 著者: Cyrille Dreyfus / Nick S Laursen / Ted Kwaks / David Zuijdgeest / Reza Khayat / Damian C Ekiert / Jeong Hyun Lee / Zoltan Metlagel / Miriam V Bujny / Mandy Jongeneelen / Remko van der Vlugt / ...著者: Cyrille Dreyfus / Nick S Laursen / Ted Kwaks / David Zuijdgeest / Reza Khayat / Damian C Ekiert / Jeong Hyun Lee / Zoltan Metlagel / Miriam V Bujny / Mandy Jongeneelen / Remko van der Vlugt / Mohammed Lamrani / Hans J W M Korse / Eric Geelen / Özcan Sahin / Martijn Sieuwerts / Just P J Brakenhoff / Ronald Vogels / Olive T W Li / Leo L M Poon / Malik Peiris / Wouter Koudstaal / Andrew B Ward / Ian A Wilson / Jaap Goudsmit / Robert H E Friesen / ![]() 要旨: Identification of broadly neutralizing antibodies against influenza A viruses has raised hopes for the development of monoclonal antibody-based immunotherapy and "universal" vaccines for influenza. ...Identification of broadly neutralizing antibodies against influenza A viruses has raised hopes for the development of monoclonal antibody-based immunotherapy and "universal" vaccines for influenza. However, a substantial part of the annual flu burden is caused by two cocirculating, antigenically distinct lineages of influenza B viruses. Here, we report human monoclonal antibodies, CR8033, CR8071, and CR9114, that protect mice against lethal challenge from both lineages. Antibodies CR8033 and CR8071 recognize distinct conserved epitopes in the head region of the influenza B hemagglutinin (HA), whereas CR9114 binds a conserved epitope in the HA stem and protects against lethal challenge with influenza A and B viruses. These antibodies may inform on development of monoclonal antibody-based treatments and a universal flu vaccine for all influenza A and B viruses. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 376.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 322.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 2143C ![]() 2144C ![]() 2145C ![]() 2146C ![]() 2147C ![]() 2148C ![]() 2149C ![]() 2150C ![]() 4fqhC ![]() 4fqiC ![]() 4fqjC ![]() 4fqkC ![]() 4fqlC ![]() 4fqmC ![]() 4fqvC C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 35506.949 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 27-345 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() 株: A/Hong Kong/1/1968 H3N2 / 遺伝子: HA / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: タンパク質 | 分子量: 20041.131 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 346-519 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() 株: A/Hong Kong/1/1968 H3N2 / 遺伝子: HA / 発現宿主: ![]() ![]() |
#3: 抗体 | 分子量: 23594.311 Da / 分子数: 1 / 断片: Fab / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
#4: 抗体 | 分子量: 22840.172 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
配列の詳細 | THE AUTHORS STATE THAT R468G IS A NATURAL VARIANT. |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.45 Å3/Da / 溶媒含有率: 64.39 % |
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結晶化![]() | 温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 4 詳細: 200 mM zinc acetate, 14% PEG1000, 100 mM sodium acetate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARMOSAIC 300 mm CCD / 検出器: CCD |
放射 | モノクロメーター: double crystal cryo-cooled Si(111) プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 5.25→50 Å / Num. obs: 5386 / % possible obs: 99.7 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 20.2 % / Rsym value: 0.09 / Net I/σ(I): 27.3 |
反射 シェル | 解像度: 5.25→5.35 Å / 冗長度: 9 % / Mean I/σ(I) obs: 2 / Rsym value: 0.88 / % possible all: 99.3 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]()
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溶媒の処理 | 減衰半径: 1.4 Å / VDWプローブ半径: 1.3 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 5.253→48.015 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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精密化 TLS | 手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION
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精密化 TLSグループ |
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