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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4b2s | ||||||
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タイトル | Solution structure of CCP modules 11-12 of complement factor H | ||||||
要素 | COMPLEMENT FACTOR HFactor H | ||||||
キーワード | IMMUNE SYSTEM (免疫系) / SAXS (X線小角散乱) / SHORT CONSENSUS REPEAT | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 regulation of complement activation, alternative pathway / symbiont cell surface / complement component C3b binding / regulation of complement-dependent cytotoxicity / regulation of complement activation / heparan sulfate proteoglycan binding / serine-type endopeptidase complex / complement activation, alternative pathway / 補体 / Regulation of Complement cascade ...regulation of complement activation, alternative pathway / symbiont cell surface / complement component C3b binding / regulation of complement-dependent cytotoxicity / regulation of complement activation / heparan sulfate proteoglycan binding / serine-type endopeptidase complex / complement activation, alternative pathway / 補体 / Regulation of Complement cascade / heparin binding / blood microparticle / タンパク質分解 / extracellular space / extracellular exosome / extracellular region / identical protein binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | HOMO SAPIENS (ヒト) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Makou, E. / Mertens, H.D. / Maciejewski, M. / Soares, D.C. / Matis, I. / Schmidt, C.Q. / Herbert, A.P. / Svergun, D.I. / Barlow, P.N. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2012 タイトル: Solution Structure of Ccp Modules 10-12 Illuminates Functional Architecture of the Complement Regulator, Factor H. 著者: Makou, E. / Mertens, H.D. / Maciejewski, M. / Soares, D.C. / Matis, I. / Schmidt, C.Q. / Herbert, A.P. / Svergun, D.I. / Barlow, P.N. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 4b2s.cif.gz | 736.4 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb4b2s.ent.gz | 639.5 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 4b2s.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/b2/4b2s ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/b2/4b2s | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14111.796 Da / 分子数: 1 / 断片: CCPS 11-12, RESIDUES 627-747 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) HOMO SAPIENS (ヒト) / プラスミド: PPICZAB / 発現宿主: KOMAGATAELLA PASTORIS (菌類) / 株 (発現宿主): KM71H / 参照: UniProt: P08603 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: THE STRUCTURE WAS DETERMINED USING TRIPLE-RESONANCE NMR SPECTROSCOPY ON 13C, 15N-LABELED FH11-12. |
-試料調製
詳細 | 内容: 90% H2O/10% D2O | |||||||||||||||
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試料状態 |
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-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: THE STRUCTURE WAS REFINED IN EXPLICIT WATER IN CNS. REFINEMENT DETAILS CAN BE FOUND IN THE JRNL CITATION ABOVE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: LOWEST ENERGY / 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |