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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 471d | |||||||||||||||||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE AND IMPROVED ANTISENSE PROPERTIES OF 2'-O-(2-METHOXYETHYL)-RNA | |||||||||||||||||||||
![]() | RNA (5'-R(*![]() ![]() ![]() 機能・相同性 | ![]() ![]() 手法 | ![]() ![]() Teplova, M. / Minasov, G. / Tereshko, V. / Inamati, G. / Cook, P.D. / Egli, M. | ![]() ![]() タイトル: Crystal structure and improved antisense properties of 2'-O-(2-methoxyethyl)-RNA. 著者: Teplova, M. / Minasov, G. / Tereshko, V. / Inamati, G.B. / Cook, P.D. / Manoharan, M. / Egli, M. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 25.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 20.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: RNA鎖 | 分子量: 4524.284 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: O2* OF EACH RIBOSE MODIFIED BY METHOXYETHYL #2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.08 Å3/Da / 溶媒含有率: 40.73 % | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化![]() | pH: 7.5 詳細: DROPLETS CONTAINING 2MM OLIGONUCLEOTIDE, 50 MM MGCL2, 50 MM NA HEPES PH 7.5, 15% PEG 400, AGAINST 1 ML OF RESERVOIR SOLUTION CONTAINING 100 MM MGCL2, 100 MM NA HEPES PH 7.5, 30% PEG 400 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 |
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結晶化 | *PLUS 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 293 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: RIGAKU RAXIS IIC / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1998年4月3日 / 詳細: MIRRORS |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 2.7→20 Å / Num. all: 2129 / Num. obs: 2129 / % possible obs: 98 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 5.4 % / Rmerge(I) obs: 0.072 |
反射 | *PLUS Num. measured all: 11424 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.7→8 Å / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.7→8 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.7 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |