登録構造単位 | A: AFTRAX B: AFTRAX C: AFTRAX D: AFTRAX E: AFTRAX F: AFTRAX G: AFTRAX H: AFTRAX I: AFTRAX J: AFTRAX K: AFTRAX L: AFTRAX M: 5'-R(*UP*UP*CP*GP*AP*CP*GP*CP*GP*UP*CP*GP*AP*AP*UP*U)-3' N: 5'-R(*UP*UP*CP*GP*AP*CP*GP*CP*GP*UP*CP*GP*AP*AP*UP*U)-3' O: 5'-R(*UP*UP*CP*GP*AP*CP*GP*CP*GP*UP*CP*GP*AP*AP*UP*U)-3' ヘテロ分子
| 分子量 (理論値) | 分子数 |
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合計 (水以外) | 289,251 | 31 |
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ポリマ- | 288,818 | 15 |
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非ポリマー | 433 | 16 |
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水 | 1,549 | 86 |
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1 | E: AFTRAX F: AFTRAX G: AFTRAX H: AFTRAX N: 5'-R(*UP*UP*CP*GP*AP*CP*GP*CP*GP*UP*CP*GP*AP*AP*UP*U)-3' ヘテロ分子
I: AFTRAX J: AFTRAX K: AFTRAX L: AFTRAX O: 5'-R(*UP*UP*CP*GP*AP*CP*GP*CP*GP*UP*CP*GP*AP*AP*UP*U)-3' ヘテロ分子
| 分子量 (理論値) | 分子数 |
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合計 (水以外) | 192,846 | 21 |
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ポリマ- | 192,545 | 10 |
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非ポリマー | 301 | 11 |
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水 | 144 | 8 |
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タイプ | 名称 | 対称操作 | 数 |
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identity operation | 1_555 | x,y,z | 1 | crystal symmetry operation | 6_664 | -x+1,-x+y+1,-z-2/3 | 1 |
Buried area | 29830 Å2 |
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ΔGint | -268 kcal/mol |
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Surface area | 64110 Å2 |
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手法 | PISA |
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2 | A: AFTRAX B: AFTRAX C: AFTRAX D: AFTRAX M: 5'-R(*UP*UP*CP*GP*AP*CP*GP*CP*GP*UP*CP*GP*AP*AP*UP*U)-3' ヘテロ分子 A: AFTRAX B: AFTRAX C: AFTRAX D: AFTRAX M: 5'-R(*UP*UP*CP*GP*AP*CP*GP*CP*GP*UP*CP*GP*AP*AP*UP*U)-3' ヘテロ分子
| 分子量 (理論値) | 分子数 |
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合計 (水以外) | 192,811 | 20 |
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ポリマ- | 192,545 | 10 |
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非ポリマー | 265 | 10 |
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水 | 144 | 8 |
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タイプ | 名称 | 対称操作 | 数 |
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identity operation | 1_555 | x,y,z | 1 | crystal symmetry operation | 4_555 | y,x,-z | 1 |
Buried area | 29490 Å2 |
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ΔGint | -260.7 kcal/mol |
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Surface area | 64880 Å2 |
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手法 | PISA |
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3 | I: AFTRAX J: AFTRAX K: AFTRAX L: AFTRAX O: 5'-R(*UP*UP*CP*GP*AP*CP*GP*CP*GP*UP*CP*GP*AP*AP*UP*U)-3' ヘテロ分子
E: AFTRAX F: AFTRAX G: AFTRAX H: AFTRAX N: 5'-R(*UP*UP*CP*GP*AP*CP*GP*CP*GP*UP*CP*GP*AP*AP*UP*U)-3' ヘテロ分子
| 分子量 (理論値) | 分子数 |
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合計 (水以外) | 192,846 | 21 |
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ポリマ- | 192,545 | 10 |
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非ポリマー | 301 | 11 |
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水 | 144 | 8 |
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タイプ | 名称 | 対称操作 | 数 |
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identity operation | 1_555 | x,y,z | 1 | crystal symmetry operation | 6_654 | -x+1,-x+y,-z-2/3 | 1 |
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単位格子 | Length a, b, c (Å) | 183.060, 183.060, 198.120 |
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Angle α, β, γ (deg.) | 90.00, 90.00, 120.00 |
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Int Tables number | 152 |
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Space group name H-M | P3121 |
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Components on special symmetry positions | ID | モデル | 要素 |
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1 | 1 | M-7-G |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCSドメイン: ID | Ens-ID |
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1 | 1 | 2 | 1 | 3 | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 3 | 2 | 1 | 3 | 2 | 3 | 3 | 3 | 1 | 4 | 2 | 4 | 3 | 4 | 1 | 5 | 2 | 5 | 1 | 6 | 2 | 6 |
NCSドメイン領域: Dom-ID | Component-ID | Ens-ID | Selection details |
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1 | 1 | 1 | CHAIN B AND NOT (RESID 76)2 | 1 | 1 | CHAIN F AND NOT (RESID 33 OR RESID 137 OR RESID 164)3 | 1 | 1 | CHAIN J AND NOT (RESID 51 OR RESID 52 OR RESID 58 OR RESID 148 OR RESID 158)1 | 1 | 2 | CHAIN C AND NOT (RESID 137 OR RESID 147 OR RESID 166 OR RESID 188)2 | 1 | 2 | CHAIN G AND NOT (RESID 18 OR RESID 26 OR RESID 65)3 | 1 | 2 | CHAIN K AND NOT (RESID 22 OR RESID 25 OR RESID 72 OR RESID 80)1 | 1 | 3 | CHAIN D AND NOT (RESID 28 OR RESID 68 OR RESID 94)2 | 1 | 3 | CHAIN H AND NOT (RESID 80 OR RESID 140)3 | 1 | 3 | CHAIN L AND NOT (RESID 8 OR RESID 22 OR RESID 100 OR RESID 137 OR | | | | | | | | |
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