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Open data
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Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 3twe | ||||||
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Title | Crystal Structure of the de novo designed peptide alpha4H | ||||||
![]() | alpha4H | ||||||
![]() | UNKNOWN FUNCTION / ![]() | ||||||
Function / homology | ![]() ![]() ![]() | ||||||
Method | ![]() ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Buer, B.C. / Meagher, J.L. / Stuckey, J.A. / Marsh, E.N.G. | ||||||
![]() | ![]() Title: Structural basis for the enhanced stability of highly fluorinated proteins. Authors: Buer, B.C. / Meagher, J.L. / Stuckey, J.A. / Marsh, E.N. | ||||||
History |
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Structure visualization
Structure viewer | Molecule: ![]() ![]() |
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Downloads & links
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Download
PDBx/mmCIF format | ![]() | 33.1 KB | Display | ![]() |
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PDB format | ![]() | 23.8 KB | Display | ![]() |
PDBx/mmJSON format | ![]() | Tree view | ![]() | |
Others | ![]() |
-Validation report
Arichive directory | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-Related structure data
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Links
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Assembly
Deposited unit | ![]()
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1 | ![]()
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2 |
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Unit cell |
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Components
#1: Protein/peptide | Mass: 3266.752 Da / Num. of mol.: 2 / Source method: obtained synthetically / Details: synthesized #2: Chemical | ChemComp-ACE / | ![]() #3: Chemical | ChemComp-PGE / | ![]() #4: Water | ChemComp-HOH / | ![]() |
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-Experimental details
-Experiment
Experiment | Method: ![]() |
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Sample preparation
Crystal | Density Matthews: 1.9 Å3/Da / Density % sol: 35.17 % |
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Crystal grow![]() | Temperature: 293.15 K / Method: vapor diffusion, hanging drop / pH: 9 Details: 48% PEG400, 0.1M CHES pH 9.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293.15K |
-Data collection
Diffraction | Mean temperature: 100 K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Diffraction source | Source: ![]() ![]() ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Detector | Type: MARMOSAIC 225 mm CCD / Detector: CCD / Date: Feb 3, 2011 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Radiation | Monochromator: Diamond [111] / Protocol: SINGLE WAVELENGTH / Monochromatic (M) / Laue (L): M / Scattering type: x-ray | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Radiation wavelength | Wavelength![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Reflection | Resolution: 1.36→50 Å / Num. all: 10618 / Num. obs: 10522 / % possible obs: 99.1 % / Observed criterion σ(I): -3 / Redundancy: 7.3 % / Rmerge(I) obs: 0.047 / Χ2: 0.722 / Net I/σ(I): 14.5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Reflection shell |
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-Phasing
Phasing![]() | Method: ![]() |
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Processing
Software |
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Refinement | Method to determine structure![]() ![]()
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Displacement parameters | Biso max: 95.18 Å2 / Biso mean: 24.6122 Å2 / Biso min: 11.68 Å2
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Refine analyze | Luzzati coordinate error obs: 0.172 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Refinement step | Cycle: LAST / Resolution: 1.36→10 Å
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Refine LS restraints |
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LS refinement shell | Resolution: 1.36→1.52 Å / Total num. of bins used: 5
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Refinement TLS params. | Method: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION
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Refinement TLS group |
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