PDB-3o20: Electron transfer complexes:experimental mapping of the Redox-dep...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3o20

タイトル

Electron transfer complexes:experimental mapping of the Redox-dependent Cytochrome C electrostatic surface

要素

Cytochrome c

シトクロムc

キーワード

ELECTRON TRANSPORT (電子伝達系) /

globular protein (球状タンパク質) /

electron carrier (電子伝達系) / MITOCHONDRIAL RESPIRATION / Electron trasport chain

機能・相同性

機能・相同性情報

cytochrome c-heme linkage /

cytochrome complex / positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity / mitochondrial electron transport, cytochrome c to oxygen / mitochondrial electron transport, ubiquinol to cytochrome c / positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process /

respirasome /

ミトコンドリア /

electron transfer activity / positive regulation of apoptotic process ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Equus caballus (ウマ)

手法

X線回折 /

分子置換 / 解像度: 1.9 Å

データ登録者

De March, M. / De Zorzi, R. / Casini, A. / Messori, L. / Geremia, S. / Demitri, N. / Gabbiani, C. / Guerri, A.

引用

ジャーナル: J. Inorg. Biochem. / 年: 2014
タイトル: Nitrate as a probe of cytochrome c surface: crystallographic identification of crucial "hot spots" for protein-protein recognition.
著者: De March, M. / Demitri, N. / De Zorzi, R. / Casini, A. / Gabbiani, C. / Guerri, A. / Messori, L. / Geremia, S.

履歴

登録	2010年7月22日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2012年1月25日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2018年3月7日	Group: Data collection / カテゴリ: diffrn_source / Item: _diffrn_source.source
改定 1.2	2019年3月20日	Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: citation / citation_author / struct_conn Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag
改定 1.3	2023年9月6日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_conn_type / struct_ncs_dom_lim / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_conn_type.id / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	3o20.cif.gz	92.7 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb3o20.ent.gz	70 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	3o20.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/o2/3o20 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/o2/3o20	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	3o1yC 1hrcS 1kyo 1l9j 2pcb 2pcc S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	4rsz-6 3zcf-3 6ff5-d 5c9m-4 2n3y-d 6k9i-d 5exq-1 4rsz-5 5ty3-1 6ecj-7 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

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PDBのページ

PDBj /

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#36 - 2002年12月
シトクロムc (Cytochrome c)
類似性 (6)
#89 - 2007年5月
アコニターゼと鉄調節タンパク質１ (Aconitase and Iron Regulatory Protein 1)
類似性 (6)
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アポトソーム (Apoptosomes)
類似性 (5)
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ヒドロゲナーゼ (Hydrogenase)
類似性 (5)
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シトクロムbc1 (Cytochrome bc1)
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光化学系II (Photosystem II)
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光化学系I (Photosystem I)
類似性 (1)
#232 - 2019年4月
タンパク質と生体鉱物 (Proteins and Biominerals)
類似性 (1)

登録構造単位

A: Cytochrome c

B: Cytochrome c

C: Cytochrome c

ヘテロ分子

38.2 kDa, 3 ポリマー
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1

A: Cytochrome c

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
12.8 kDa, 1 ポリマー
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2

B: Cytochrome c

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
12.9 kDa, 1 ポリマー
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3

C: Cytochrome c

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
12.6 kDa, 1 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	90.092, 52.029, 77.749
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 123.07, 90.00
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:
NCSドメイン領域:

Component-ID: 1

Dom-ID	Ens-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Refine code	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	GLY	GLY	LYS	LYS	1	A	A	1 - 7	2 - 8
2	1	GLY	GLY	LYS	LYS	1	B	B	1 - 7	2 - 8
3	1	GLY	GLY	LYS	LYS	1	C	C	1 - 7	2 - 8
1	2	LYS	LYS	LYS	LYS	3	A	A	8	9
2	2	LYS	LYS	LYS	LYS	3	B	B	8	9
3	2	LYS	LYS	LYS	LYS	3	C	C	8	9
1	3	ILE	ILE	VAL	VAL	1	A	A	9 - 11	10 - 12
2	3	ILE	ILE	VAL	VAL	1	B	B	9 - 11	10 - 12
3	3	ILE	ILE	VAL	VAL	1	C	C	9 - 11	10 - 12
1	4	GLN	GLN	GLN	GLN	3	A	A	12	13
2	4	GLN	GLN	GLN	GLN	3	B	B	12	13
3	4	GLN	GLN	GLN	GLN	3	C	C	12	13
1	5	LYS	LYS	ALA	ALA	1	A	A	13 - 15	14 - 16
2	5	LYS	LYS	ALA	ALA	1	B	B	13 - 15	14 - 16
3	5	LYS	LYS	ALA	ALA	1	C	C	13 - 15	14 - 16
1	6	GLN	GLN	GLN	GLN	3	A	A	16	17
2	6	GLN	GLN	GLN	GLN	3	B	B	16	17
3	6	GLN	GLN	GLN	GLN	3	C	C	16	17
1	7	CYS	CYS	GLY	GLY	1	A	A	17 - 24	18 - 25
2	7	CYS	CYS	GLY	GLY	1	B	B	17 - 24	18 - 25
3	7	CYS	CYS	GLY	GLY	1	C	C	17 - 24	18 - 25
1	8	LYS	LYS	LYS	LYS	3	A	A	25	26
2	8	LYS	LYS	LYS	LYS	3	B	B	25	26
3	8	LYS	LYS	LYS	LYS	3	C	C	25	26
1	9	HIS	HIS	LEU	LEU	1	A	A	26 - 68	27 - 69
2	9	HIS	HIS	LEU	LEU	1	B	B	26 - 68	27 - 69
3	9	HIS	HIS	LEU	LEU	1	C	C	26 - 68	27 - 69
1	10	GLU	GLU	GLU	GLU	3	A	A	69	70
2	10	GLU	GLU	GLU	GLU	3	B	B	69	70
3	10	GLU	GLU	GLU	GLU	3	C	C	69	70
1	11	ASN	ASN	ILE	ILE	1	A	A	70 - 85	71 - 86
2	11	ASN	ASN	ILE	ILE	1	B	B	70 - 85	71 - 86
3	11	ASN	ASN	ILE	ILE	1	C	C	70 - 85	71 - 86
1	12	LYS	LYS	LYS	LYS	3	A	A	86 - 88	87 - 89
2	12	LYS	LYS	LYS	LYS	3	B	B	86 - 88	87 - 89
3	12	LYS	LYS	LYS	LYS	3	C	C	86 - 88	87 - 89
1	13	THR	THR	LYS	LYS	1	A	A	89 - 99	90 - 100
2	13	THR	THR	LYS	LYS	1	B	B	89 - 99	90 - 100
3	13	THR	THR	LYS	LYS	1	C	C	89 - 99	90 - 100
1	14	LYS	LYS	LYS	LYS	3	A	A	100	101
2	14	LYS	LYS	LYS	LYS	3	B	B	100	101
3	14	LYS	LYS	LYS	LYS	3	C	C	100	101
1	15	ALA	ALA	THR	THR	1	A	A	101 - 102	102 - 103
2	15	ALA	ALA	THR	THR	1	B	B	101 - 102	102 - 103
3	15	ALA	ALA	THR	THR	1	C	C	101 - 102	102 - 103
1	16	ASN	ASN	GLU	GLU	3	A	A	103 - 104	104 - 105
2	16	ASN	ASN	GLU	GLU	3	B	B	103 - 104	104 - 105
3	16	ASN	ASN	GLU	GLU	3	C	C	103 - 104	104 - 105

NCSアンサンブル:

#1: タンパク質	Cytochrome c / シトクロムc 分子量: 11751.635 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Equus caballus (ウマ) / 参照: UniProt: P00004
#2: 化合物	ChemComp-HEC / HEME C / Heme C 分子量: 618.503 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃₄H₃₄FeN₄O₄
#3: 化合物	ChemComp-NO3 / NITRATE ION / 硝酸塩分子量: 62.005 Da / 分子数: 18 / 由来タイプ: 合成 / 式: NO₃
#4: 水	ChemComp-HOH / water / 水分子量: 18.015 Da / 分子数: 365 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.17 Å³/Da / 溶媒含有率: 43.2 %
結晶化	温度: 300 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7.4 詳細: Excess of NaNO3 and 10% of Ditionite, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K

-
データ収集

放射光源	由来: SEALED TUBE / タイプ: OXFORD DIFFRACTION ENHANCE ULTRA
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	相対比: 1
反射	解像度: 1.9→65.09 Å / Num. obs: 21667

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
AMoRE		位相決定
REFMAC	5	精密化
MOSFLM		データ削減
SCALA		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB entry 1HRC

1hrc

解像度: 1.9→65.09 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.931 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.863 / SU B: 4.879 / SU ML: 0.146 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R Free: 0.204 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.27616	1166	5.1 %	RANDOM
R_work	0.19285	-	-	-
obs	0.19712	21667	95.25 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 14.267 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	0.26 Å²	0 Å²	1.36 Å²
2-	-	-1.31 Å²	0 Å²
3-	-	-	2.53 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.9→65.09 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	2478	0	201	365	3044

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.02	0.022	2748
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.794	2.14	3682
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	6.279	5	311
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	34.061	25.294	102
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	16.915	15	517
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	26.403	15	6
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.099	0.2	352
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.011	0.02	2038
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined	0.207	0.2	1503
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined	0.305	0.2	1763
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined	0.215	0.2	292
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined	0.247	0.2	101
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined	0.268	0.2	59
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	1.085	1.5	1665
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	1.471	2	2478
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	2.379	3	1296
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	3.302	4.5	1197

Refine LS restraints NCS

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	タイプ	Rms dev position (Å)	Weight position
1	1	A	50	tight positional	0.08	0.05
1	2	B	50	tight positional	0.06	0.05
1	3	C	50	tight positional	0.08	0.05
2	1	A	3	tight positional	0.01	0.05
2	2	B	3	tight positional	0.01	0.05
2	3	C	3	tight positional	0.01	0.05
3	1	A	26	tight positional	0.05	0.05
3	2	B	26	tight positional	0.05	0.05
3	3	C	26	tight positional	0.05	0.05
4	1	A	4	tight positional	0.02	0.05
4	2	B	4	tight positional	0.02	0.05
4	3	C	4	tight positional	0.02	0.05
5	1	A	20	tight positional	0.07	0.05
5	2	B	20	tight positional	0.07	0.05
5	3	C	20	tight positional	0.07	0.05
6	1	A	4	tight positional	0.04	0.05
6	2	B	4	tight positional	0.04	0.05
6	3	C	4	tight positional	0.02	0.05
7	1	A	56	tight positional	0.06	0.05
7	2	B	56	tight positional	0.05	0.05
7	3	C	56	tight positional	0.05	0.05
8	1	A	4	tight positional	0.02	0.05
8	2	B	4	tight positional	0.02	0.05
8	3	C	4	tight positional	0.02	0.05
9	1	A	342	tight positional	0.06	0.05
9	2	B	342	tight positional	0.06	0.05
9	3	C	342	tight positional	0.06	0.05
10	1	A	4	tight positional	0.01	0.05
10	2	B	4	tight positional	0.03	0.05
10	3	C	4	tight positional	0.02	0.05
11	1	A	124	tight positional	0.06	0.05
11	2	B	124	tight positional	0.06	0.05
11	3	C	124	tight positional	0.06	0.05
12	1	A	12	tight positional	0.04	0.05
12	2	B	12	tight positional	0.06	0.05
12	3	C	12	tight positional	0.05	0.05
13	1	A	94	tight positional	0.07	0.05
13	2	B	94	tight positional	0.07	0.05
13	3	C	94	tight positional	0.07	0.05
14	1	A	4	tight positional	0.03	0.05
14	2	B	4	tight positional	0.03	0.05
14	3	C	4	tight positional	0.01	0.05
15	1	A	12	tight positional	0.05	0.05
15	2	B	12	tight positional	0.04	0.05
15	3	C	12	tight positional	0.04	0.05
16	1	A	8	tight positional	0.08	0.05
16	2	B	8	tight positional	0.07	0.05
16	3	C	8	tight positional	0.04	0.05
4	1	A	5	loose positional	1.61	5
4	2	B	5	loose positional	2.52	5
4	3	C	5	loose positional	1.7	5
6	1	A	5	loose positional	0.64	5
6	2	B	5	loose positional	1.36	5
6	3	C	5	loose positional	0.74	5
8	1	A	5	loose positional	1.15	5
8	2	B	5	loose positional	1.21	5
8	3	C	5	loose positional	1.92	5
10	1	A	5	loose positional	0.99	5
10	2	B	5	loose positional	0.48	5
10	3	C	5	loose positional	0.53	5
12	1	A	15	loose positional	0.42	5
12	2	B	15	loose positional	0.54	5
12	3	C	15	loose positional	0.43	5
14	1	A	5	loose positional	1.24	5
14	2	B	5	loose positional	0.65	5
14	3	C	5	loose positional	0.84	5
16	1	A	10	loose positional	0.61	5
16	2	B	10	loose positional	0.42	5
16	3	C	10	loose positional	0.42	5
1	1	A	50	tight thermal	0.19	0.5
1	2	B	50	tight thermal	0.21	0.5
1	3	C	50	tight thermal	0.25	0.5
2	1	A	3	tight thermal	0.13	0.5
2	2	B	3	tight thermal	0.45	0.5
2	3	C	3	tight thermal	0.39	0.5
3	1	A	26	tight thermal	0.39	0.5
3	2	B	26	tight thermal	0.31	0.5
3	3	C	26	tight thermal	0.43	0.5
4	1	A	4	tight thermal	0.16	0.5
4	2	B	4	tight thermal	0.22	0.5
4	3	C	4	tight thermal	0.11	0.5
5	1	A	20	tight thermal	0.35	0.5
5	2	B	20	tight thermal	0.21	0.5
5	3	C	20	tight thermal	0.46	0.5
6	1	A	4	tight thermal	0.35	0.5
6	2	B	4	tight thermal	0.4	0.5
6	3	C	4	tight thermal	0.13	0.5
7	1	A	56	tight thermal	0.22	0.5
7	2	B	56	tight thermal	0.25	0.5
7	3	C	56	tight thermal	0.24	0.5
8	1	A	4	tight thermal	0.19	0.5
8	2	B	4	tight thermal	0.17	0.5
8	3	C	4	tight thermal	0.23	0.5
9	1	A	342	tight thermal	0.25	0.5
9	2	B	342	tight thermal	0.26	0.5
9	3	C	342	tight thermal	0.31	0.5
10	1	A	4	tight thermal	0.19	0.5
10	2	B	4	tight thermal	0.21	0.5
10	3	C	4	tight thermal	0.11	0.5
11	1	A	124	tight thermal	0.28	0.5
11	2	B	124	tight thermal	0.28	0.5
11	3	C	124	tight thermal	0.36	0.5
12	1	A	12	tight thermal	0.21	0.5
12	2	B	12	tight thermal	0.26	0.5
12	3	C	12	tight thermal	0.25	0.5
13	1	A	94	tight thermal	0.27	0.5
13	2	B	94	tight thermal	0.26	0.5
13	3	C	94	tight thermal	0.28	0.5
14	1	A	4	tight thermal	0.35	0.5
14	2	B	4	tight thermal	0.21	0.5
14	3	C	4	tight thermal	0.47	0.5
15	1	A	12	tight thermal	0.19	0.5
15	2	B	12	tight thermal	0.3	0.5
15	3	C	12	tight thermal	0.23	0.5
16	1	A	8	tight thermal	0.12	0.5
16	2	B	8	tight thermal	0.14	0.5
16	3	C	8	tight thermal	0.1	0.5
4	1	A	5	loose thermal	2.76	10
4	2	B	5	loose thermal	4.21	10
4	3	C	5	loose thermal	2.13	10
6	1	A	5	loose thermal	1.46	10
6	2	B	5	loose thermal	1.2	10
6	3	C	5	loose thermal	2.27	10
8	1	A	5	loose thermal	2.31	10
8	2	B	5	loose thermal	2.93	10
8	3	C	5	loose thermal	1.7	10
10	1	A	5	loose thermal	3.94	10
10	2	B	5	loose thermal	5.78	10
10	3	C	5	loose thermal	1.9	10
12	1	A	15	loose thermal	2.41	10
12	2	B	15	loose thermal	3.66	10
12	3	C	15	loose thermal	2.75	10
14	1	A	5	loose thermal	1.49	10
14	2	B	5	loose thermal	0.5	10
14	3	C	5	loose thermal	1.84	10
16	1	A	10	loose thermal	2.4	10
16	2	B	10	loose thermal	0.86	10
16	3	C	10	loose thermal	2.72	10

LS精密化シェル

解像度: 1.9→1.949 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.303	73	-
R_work	0.228	1311	-
obs	-	-	77.93 %

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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