登録情報 | データベース: PDB / ID: 3nzm |
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タイトル | Crystal structure of DNAE intein with N-extein in redox trap |
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要素 | DNA polymerase III subunit alpha DNA polymerase III holoenzyme |
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キーワード | TRANSFERASE (転移酵素) / disulfide bond (ジスルフィド) |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
intein-mediated protein splicing / 3'-5' exonuclease activity / DNA複製 / nucleic acid binding / DNAポリメラーゼ / DNA-directed DNA polymerase activity / 細胞質類似検索 - 分子機能 Bacterial DNA polymerase III alpha subunit, thumb domain / DNA polymerase III, alpha subunit / Bacterial DNA polymerase III, alpha subunit, NTPase domain / DNA polymerase, helix-hairpin-helix motif / DNA polymerase III alpha subunit finger domain / Bacterial DNA polymerase III alpha NTPase domain / Helix-hairpin-helix motif / Bacterial DNA polymerase III alpha subunit finger domain / Endonuclease - Pi-scei; Chain A, domain 1 / Hedgehog/Intein (Hint) domain ...Bacterial DNA polymerase III alpha subunit, thumb domain / DNA polymerase III, alpha subunit / Bacterial DNA polymerase III, alpha subunit, NTPase domain / DNA polymerase, helix-hairpin-helix motif / DNA polymerase III alpha subunit finger domain / Bacterial DNA polymerase III alpha NTPase domain / Helix-hairpin-helix motif / Bacterial DNA polymerase III alpha subunit finger domain / Endonuclease - Pi-scei; Chain A, domain 1 / Hedgehog/Intein (Hint) domain / PHP domain / PHP domain / Polymerase/histidinol phosphatase, N-terminal / DNA polymerase alpha chain like domain / Polymerase/histidinol phosphatase-like / Intein C-terminal splicing region / Intein C-terminal splicing motif profile. / Intein N-terminal splicing region / Intein N-terminal splicing motif profile. / Hint domain N-terminal / Hint (Hedgehog/Intein) domain N-terminal region / OB-fold nucleic acid binding domain, AA-tRNA synthetase-type / Hint domain superfamily / OB-fold nucleic acid binding domain / Beta Complex / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) ![](data/taxo/icon/Synechocystis_sp_PCC_6803_S.png) Synechocystis sp. PCC 6803 (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 1.55 Å |
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データ登録者 | Van Roey, P. / Belfort, M. / Callahan, B.P. |
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引用 | ジャーナル: Nat.Struct.Mol.Biol. / 年: 2011 タイトル: Structure of catalytically competent intein caught in a redox trap with functional and evolutionary implications. 著者: Callahan, B.P. / Topilina, N.I. / Stanger, M.J. / Van Roey, P. / Belfort, M. |
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履歴 | 登録 | 2010年7月16日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2011年6月1日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2023年9月6日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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改定 2.0 | 2023年11月15日 | Group: Atomic model / Data collection / Derived calculations カテゴリ: atom_site / chem_comp_atom ...atom_site / chem_comp_atom / chem_comp_bond / struct_conn Item: _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id ..._atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id / _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_1 / _chem_comp_bond.atom_id_2 / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id |
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