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- PDB-2hjn: Structural and functional analysis of Saccharomyces cerevisiae Mob1 -
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Open data
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Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 2hjn | ||||||
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Title | Structural and functional analysis of Saccharomyces cerevisiae Mob1 | ||||||
![]() | Maintenance of ploidy protein MOB1 | ||||||
![]() | ![]() ![]() | ||||||
Function / homology | ![]() Sid2-Mob1 complex / mitotic spindle pole body / kinase regulator activity / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() Similarity search - Function | ||||||
Biological species | ![]() ![]() ![]() | ||||||
Method | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Mrkobrada, S. / Ceccarelli, D.F. / Sicheri, F. | ||||||
![]() | ![]() Title: Structural and Functional Analysis of Saccharomyces cerevisiae Mob1. Authors: Mrkobrada, S. / Boucher, L. / Ceccarelli, D.F. / Tyers, M. / Sicheri, F. | ||||||
History |
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Structure visualization
Structure viewer | Molecule: ![]() ![]() |
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Downloads & links
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Download
PDBx/mmCIF format | ![]() | 54 KB | Display | ![]() |
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PDB format | ![]() | 41.5 KB | Display | ![]() |
PDBx/mmJSON format | ![]() | Tree view | ![]() | |
Others | ![]() |
-Validation report
Arichive directory | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Similar structure data |
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Links
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Assembly
Deposited unit | ![]()
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1 | ![]()
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Unit cell |
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Details | The second part of the biological assembly is generated by: X,Y,-Z + (1,1,1) |
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Components
#1: Protein | Mass: 27721.668 Da / Num. of mol.: 1 / Source method: isolated from a natural source / Source: (natural) ![]() ![]() ![]() |
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#2: Chemical | ChemComp-ZN / |
#3: Chemical | ChemComp-SO4 / ![]() |
#4: Water | ChemComp-HOH / ![]() |
-Experimental details
-Experiment
Experiment | Method: ![]() |
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Sample preparation
Crystal | Density Matthews: 2.05 Å3/Da / Density % sol: 39.96 % |
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Crystal grow![]() | Temperature: 277 K / Method: vapor diffusion, hanging drop / pH: 6 Details: 1.2M ammonium sulfate, 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K |
-Data collection
Diffraction | Mean temperature: 100 K | ||||||||||||
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Diffraction source | Source: ![]() ![]() ![]() | ||||||||||||
Detector | Type: ADSC QUANTUM 4 / Detector: CCD / Date: Apr 1, 2004 | ||||||||||||
Radiation | Protocol: MAD / Monochromatic (M) / Laue (L): M / Scattering type: x-ray | ||||||||||||
Radiation wavelength |
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Reflection | Highest resolution: 2 Å / Num. obs: 14415 / % possible obs: 99.5 % / Redundancy: 5.3 % / Rmerge(I) obs: 0.068 / Net I/σ(I): 18.4 | ||||||||||||
Reflection shell | Resolution: 2→2.05 Å / Redundancy: 3.5 % / Rmerge(I) obs: 0.278 / Mean I/σ(I) obs: 2.9 / % possible all: 95 |
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Processing
Software |
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Refinement | Method to determine structure![]() ![]()
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Solvent computation | Ion probe radii: 0.8 Å / Shrinkage radii: 0.8 Å / VDW probe radii: 1.4 Å / Solvent model: MASK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Displacement parameters | Biso mean: 24.188 Å2
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Refinement step | Cycle: LAST / Resolution: 2→35 Å
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Refine LS restraints |
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LS refinement shell | Resolution: 2→2.052 Å / Total num. of bins used: 20
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