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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2g6t | ||||||
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タイトル | Crystal structure of an uncharacterized protein from Clostridium acetobutylicum | ||||||
![]() | Uncharacterized protein, homolog HI1244 from Haemophilus influenzae | ||||||
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機能・相同性 | Protein of unknown function DUF1919 / CAC2185-like superfamily / Domain of unknown function (DUF1919) / NAD(P)-binding Rossmann-like Domain / ![]() ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Rao, K.N. / Swaminathan, S. / Burley, S.K. / New York SGX Research Center for Structural Genomics (NYSGXRC) | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of an uncharacterized protein from Clostridium acetobutylicum 著者: Rao, K.N. / Swaminathan, S. | ||||||
履歴 |
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Remark 999 | SEQUENCE EXTRA DENSITY AT THE C-TERMINUS WAS MODELED AS UNK (UNKNOWN RESIDUE). |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 131 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 108.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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2 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 36749.879 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 発現宿主: ![]() ![]() ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.84 Å3/Da / 溶媒含有率: 67.99 % |
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結晶化![]() | 温度: 293 K / pH: 7.5 詳細: PEG 8000, Ethylene Glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K, pH 7.50 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2005年9月13日 / 詳細: MIRRORS |
放射 | モノクロメーター: SILICON / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 3→50 Å / Num. obs: 23984 / % possible obs: 100 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 32.6 % / Biso Wilson estimate: 42 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.152 / Rsym value: 0.152 / Net I/σ(I): 7.3 |
反射 シェル | 解像度: 3→3.11 Å / 冗長度: 24.2 % / % possible all: 99.6 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]() 詳細: The atoms listed in remark 470 were not modeled due to lack of electron density.
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溶媒の処理 | 溶媒モデル: FLAT MODEL / Bsol: 44.9552 Å2 / ksol: 0.398683 e/Å3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 37.8 Å2
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Refine analyze |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 3→46 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 3→3.19 Å / Rfactor Rfree error: 0.034 / Total num. of bins used: 6
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