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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2frc | |||||||||
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タイトル | CYTOCHROME C (REDUCED) FROM EQUUS CABALLUS, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE | |||||||||
要素 | CYTOCHROME Cシトクロムc | |||||||||
キーワード | ELECTRON TRANSPORT (電子伝達系) | |||||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 cytochrome c-heme linkage / cytochrome complex / positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity / mitochondrial electron transport, cytochrome c to oxygen / mitochondrial electron transport, ubiquinol to cytochrome c / positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process / respirasome / ミトコンドリア / electron transfer activity / positive regulation of apoptotic process ...cytochrome c-heme linkage / cytochrome complex / positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity / mitochondrial electron transport, cytochrome c to oxygen / mitochondrial electron transport, ubiquinol to cytochrome c / positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process / respirasome / ミトコンドリア / electron transfer activity / positive regulation of apoptotic process / lipid binding / apoptotic process / heme binding / identical protein binding / metal ion binding / 細胞質基質 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | Equus caballus (ウマ) | |||||||||
手法 | 溶液NMR / SIMMULATED ANNEALING | |||||||||
データ登録者 | Qi, P.X. / Di Stefano, D.L. / Wand, A.J. | |||||||||
引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 1996 タイトル: Solution structure of horse heart ferricytochrome c and detection of redox-related structural changes by high-resolution 1H NMR. 著者: Qi, P.X. / Beckman, R.A. / Wand, A.J. #1: ジャーナル: Nat.Struct.Biol. / 年: 1994 タイトル: Structural Water in Oxidized and Reduced Horse Heart Cytochrome C 著者: Qi, P.X. / Urbauer, J.L. / Fuentes, E.J. / Leopold, M.F. / Wand, A.J. #2: ジャーナル: Biochemistry / 年: 1994 タイトル: Solution Structure of Horse Heart Ferrocytochrome C Determined by High-Resolution NMR and Restrained Simulated Annealing 著者: Qi, P.X. / Di Stefano, D.L. / Wand, A.J. #3: ジャーナル: Biochemistry / 年: 1989 タイトル: Proton Resonance Assignments of Horse Ferrocytochrome C 著者: Wand, A.J. / Di Stefano, D.L. / Feng, Y.Q. / Roder, H. / Englander, S.W. | |||||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2frc.cif.gz | 45.7 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2frc.ent.gz | 36.9 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2frc.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/fr/2frc ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/fr/2frc | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 11725.598 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: REDUCED / 由来: (天然) Equus caballus (ウマ) / 器官: HEART心臓 / 参照: UniProt: P00004 |
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#2: 化合物 | ChemComp-HEC / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
試料状態 | pH: 5.7 / 温度: 293 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: その他 / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
ソフトウェア |
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NMR software |
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精密化 | 手法: SIMMULATED ANNEALING / ソフトェア番号: 1 | |||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: LOWEST PENALTY / 計算したコンフォーマーの数: 256 / 登録したコンフォーマーの数: 1 |