登録情報 | データベース: PDB / ID: 2dek |
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タイトル | Crystal structure of project ID PH0725 from Pyrococcus horikoshii OT3 at 1.65 A resolution |
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要素 | Probable diphthine synthase |
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キーワード | TRANSFERASE (転移酵素) / ALPHA/BETA FOLD / ANTIPARALLEL BETA-SHEET / Structural Genomics (構造ゲノミクス) / NPPSFA / National Project on Protein Structural and Functional Analyses / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative / RSGI |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
ジフチンシンターゼ / diphthine synthase activity / protein histidyl modification to diphthamide / メチル化類似検索 - 分子機能 ジフチンシンターゼ / Tetrapyrrole methylase, N-terminal domain / Tetrapyrrole methylase, C-terminal domain / Methyltransferase, Cobalt-precorrin-4 Transmethylase; Domain 2 / Tetrapyrrole methylase, subdomain 2 / Cobalt-precorrin-4 Transmethylase; domain 1 / Tetrapyrrole methylase / Tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) Methylases / Tetrapyrrole methylase, subdomain 1 / Tetrapyrrole methylase superfamily ...ジフチンシンターゼ / Tetrapyrrole methylase, N-terminal domain / Tetrapyrrole methylase, C-terminal domain / Methyltransferase, Cobalt-precorrin-4 Transmethylase; Domain 2 / Tetrapyrrole methylase, subdomain 2 / Cobalt-precorrin-4 Transmethylase; domain 1 / Tetrapyrrole methylase / Tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) Methylases / Tetrapyrrole methylase, subdomain 1 / Tetrapyrrole methylase superfamily / 2-Layer Sandwich / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Pyrococcus horikoshii (古細菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.65 Å |
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データ登録者 | Shimizu, K. / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI) |
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引用 | ジャーナル: To be Published タイトル: Crystal structure of project ID PH0725 from Pyrococcus horikoshii OT3 at 1.65 A resolution 著者: Shimizu, K. / Mizutani, H. / Kunishima, N. |
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履歴 | 登録 | 2006年2月10日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2006年7月18日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年4月30日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Source and taxonomy / Version format compliance |
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改定 1.3 | 2023年10月25日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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