登録情報 データベース : PDB / ID : 1zde 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル 1.95 Angstrom Crystal Structure of a dnaE Intein Precursor from Synechocystis Sp. Pcc 6803 要素DNA polymerase III alpha subunit 詳細 キーワード TRANSFERASE (転移酵素) / DnaE / Intein / Splicing / Precursor機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
intein-mediated protein splicing / 3'-5' exonuclease activity / DNA複製 / nucleic acid binding / DNAポリメラーゼ / DNA-directed DNA polymerase activity / 細胞質 類似検索 - 分子機能 Bacterial DNA polymerase III alpha subunit, thumb domain / DNA polymerase III, alpha subunit / Bacterial DNA polymerase III, alpha subunit, NTPase domain / DNA polymerase, helix-hairpin-helix motif / DNA polymerase III alpha subunit finger domain / Bacterial DNA polymerase III alpha NTPase domain / Helix-hairpin-helix motif / Bacterial DNA polymerase III alpha subunit finger domain / Endonuclease - Pi-scei; Chain A, domain 1 / Hedgehog/Intein (Hint) domain ... Bacterial DNA polymerase III alpha subunit, thumb domain / DNA polymerase III, alpha subunit / Bacterial DNA polymerase III, alpha subunit, NTPase domain / DNA polymerase, helix-hairpin-helix motif / DNA polymerase III alpha subunit finger domain / Bacterial DNA polymerase III alpha NTPase domain / Helix-hairpin-helix motif / Bacterial DNA polymerase III alpha subunit finger domain / Endonuclease - Pi-scei; Chain A, domain 1 / Hedgehog/Intein (Hint) domain / PHP domain / PHP domain / Polymerase/histidinol phosphatase, N-terminal / DNA polymerase alpha chain like domain / Polymerase/histidinol phosphatase-like / Intein C-terminal splicing region / Intein C-terminal splicing motif profile. / Intein N-terminal splicing region / Intein N-terminal splicing motif profile. / Hint domain N-terminal / Hint (Hedgehog/Intein) domain N-terminal region / OB-fold nucleic acid binding domain, AA-tRNA synthetase-type / Hint domain superfamily / OB-fold nucleic acid binding domain / Beta Complex / Mainly Beta 類似検索 - ドメイン・相同性生物種 Synechocystis sp. PCC 6803 (バクテリア)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.95 Å 詳細データ登録者 Sun, P. / Ye, S. / Ferrandon, S. / Evans, T.C. / Xu, M.Q. / Rao, Z. 引用ジャーナル : J.Mol.Biol. / 年 : 2005タイトル: Crystal structures of an intein from the split dnaE gene of Synechocystis sp. PCC6803 reveal the catalytic model without the penultimate histidine and the mechanism of zinc ion ... タイトル : Crystal structures of an intein from the split dnaE gene of Synechocystis sp. PCC6803 reveal the catalytic model without the penultimate histidine and the mechanism of zinc ion inhibition of protein splicing著者 : Sun, P. / Ye, S. / Ferrandon, S. / Evans, T.C. / Xu, M.Q. / Rao, Z. 履歴 登録 2005年4月14日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : PDBJ改定 1.0 2006年1月24日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2008年4月30日 Group : Version format compliance改定 1.2 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 1.3 2021年11月10日 Group : Database references / Derived calculationsカテゴリ : database_2 / pdbx_struct_conn_angle ... database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr1_symmetry / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_symmetry / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id 改定 1.4 2024年5月29日 Group : Data collection / カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond
すべて表示 表示を減らす