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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1wks | ||||||||||||||||||||
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タイトル | Solution structure of an RNA stem-loop derived from the 3' conserved region of eel LINE UnaL2 | ||||||||||||||||||||
![]() | 5'-R(*![]() ![]() ![]() ![]() 機能・相同性 | ![]() ![]() 手法 | ![]() ![]() Model type details | minimized average | ![]() Baba, S. / Kajikawa, M. / Okada, N. / Kawai, G. | ![]() ![]() タイトル: Solution structure of an RNA stem-loop derived from the 3' conserved region of eel LINE UnaL2 著者: Baba, S. / Kajikawa, M. / Okada, N. / Kawai, G. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 218.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 183.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: RNA鎖 | 分子量: 5467.309 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 詳細: Chemical synthesized 17-mer RNA corresponding to the RT binding site of eel LINE RNA. |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 |
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試料状態 | イオン強度: 50mM NaCl / pH: 6.0 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | |||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | |||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: ![]() 詳細: The structures are based on a total of 298 restraints, 204 are NOE-derived distance constraints, 80 dihedral angle restraints, 14 distance restraints from hydrogen bonds. | ||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: minimized average structure | ||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 21 |