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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1spi | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF SPINACH CHLOROPLAST FRUCTOSE-1,6-BISPHOSPHATASE AT 2.8 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
要素 | FRUCTOSE 1,6-BISPHOSPHATASEフルクトース-1,6-ビスホスファターゼ | ||||||
キーワード | HYDROLASE (PHOSPHORIC MONOESTER) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 reductive pentose-phosphate cycle / fructose-bisphosphatase / fructose 1,6-bisphosphate 1-phosphatase activity / 葉緑体 / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Spinacia oleracea (ホウレンソウ) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2.8 Å | ||||||
データ登録者 | Villeret, V. / Huang, S. / Zhang, Y. / Xue, Y. / Lipscomb, W.N. | ||||||
引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 1995 タイトル: Crystal structure of spinach chloroplast fructose-1,6-bisphosphatase at 2.8 A resolution. 著者: Villeret, V. / Huang, S. / Zhang, Y. / Xue, Y. / Lipscomb, W.N. #1: ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1994 タイトル: Toward a Mechanism for the Allosteric Transition of Pig Kidney Fructose-1,6-Bisphosphatase 著者: Zhang, Y. / Liang, J.-Y. / Huang, S. / Lipscomb, W.N. #2: ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 1994 タイトル: Crystal Structure of Fructose-1,6-Bisphosphatase Complexed with Fructose 2,6-Bisphosphate, AMP and Zn2+ at 2.0 Angstroms Resolution. Aspects of Synergism between Inhibitors 著者: Xue, Y. / Huang, S. / Liang, J.-Y. / Zhang, Y. / Lipscomb, W.N. #3: ジャーナル: Biochemistry / 年: 1993 タイトル: Crystallographic Studies of the Catalytic Mechanism of the Neutral Form of Fructose-1,6-Bisphosphatase 著者: Zhang, Y. / Liang, J.-Y. / Huang, S. / Ke, H. / Lipscomb, W.N. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1spi.cif.gz | 299.1 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1spi.ent.gz | 243.1 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1spi.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sp/1spi ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sp/1spi | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 39181.125 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Spinacia oleracea (ホウレンソウ) 参照: UniProt: P22418, fructose-bisphosphatase |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.14 Å3/Da / 溶媒含有率: 42.61 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 詳細: COMPND PH 5.2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS pH: 5.2 / 手法: microdialysis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
反射 | Num. obs: 29281 / % possible obs: 83.3 % |
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反射 | *PLUS 最高解像度: 2.7 Å / 最低解像度: 15 Å / Rmerge(I) obs: 0.106 |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.8→6 Å / Rfactor Rwork: 0.203 / Rfactor obs: 0.203 / σ(F): 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 28 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.8→6 Å
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拘束条件 |
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