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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1spd | ||||||
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タイトル | AMYOTROPHIC LATERAL SCLEROSIS AND STRUCTURAL DEFECTS IN CU,ZN SUPEROXIDE DISMUTASE | ||||||
![]() | SUPEROXIDE DISMUTASE![]() | ||||||
![]() | ![]() | ||||||
機能・相同性 | ![]() action potential initiation / neurofilament cytoskeleton organization / positive regulation of oxidative stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway / protein phosphatase 2B binding / regulation of organ growth / relaxation of vascular associated smooth muscle / response to superoxide / anterograde axonal transport / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Parge, H.E. / Tainer, J.A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Amyotrophic lateral sclerosis and structural defects in Cu,Zn superoxide dismutase. 著者: Deng, H.X. / Hentati, A. / Tainer, J.A. / Iqbal, Z. / Cayabyab, A. / Hung, W.Y. / Getzoff, E.D. / Hu, P. / Herzfeldt, B. / Roos, R.P. / Warner, C. / Deng, G. / Soriano, E. / Smyth, C. / ...著者: Deng, H.X. / Hentati, A. / Tainer, J.A. / Iqbal, Z. / Cayabyab, A. / Hung, W.Y. / Getzoff, E.D. / Hu, P. / Herzfeldt, B. / Roos, R.P. / Warner, C. / Deng, G. / Soriano, E. / Smyth, C. / Parge, H.E. / Ahmed, A. / Roses, A.D. / Hallewell, R.A. / Pericak-Vance, M.A. / Siddique, T. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 68.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 51 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper: (Code: given Matrix: (-0.9988, 0.0099, -0.0486), ベクター ![]() 詳細 | THE TRANSFORMATION PRESENTED ON *MTRIX* RECORDS BELOW WILL YIELD APPROXIMATE COORDINATES FOR CHAIN *A* WHEN APPLIED TO CHAIN *B*. | |
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要素
#1: タンパク質 | ![]() 分子量: 15853.599 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() 参照: UniProt: P00441, ![]() #2: 化合物 | ![]() #3: 化合物 | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 4.2 Å3/Da / 溶媒含有率: 70.71 % |
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結晶化![]() | *PLUS 手法: unknown |
溶液の組成 | *PLUS 一般名: PEG4000 |
-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.4 Å / Num. obs: 17554 / % possible obs: 89.8 % / Num. measured all: 140309 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.4→5 Å / Rfactor Rwork![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.4→5 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.224 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: x_angle_d / Dev ideal: 3.5 |