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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1nnu | ||||||
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タイトル | Crystal Structure Analysis of Plasmodium falciparum enoyl-acyl-carrier-protein reductase with Triclosan Analog | ||||||
![]() | (enoyl-acyl carrier reductase) x 2 | ||||||
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機能・相同性 | ![]() enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH) activity / fatty acid biosynthetic process / ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Perozzo, R. / Kuo, M. / Sidhu, A.S. / Valiyaveettil, J.T. / Bittman, R. / Jacobs Jr., W.R. / Fidock, D.A. / Sacchettini, J.C. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural Elucidation of the Specificity of the Antibacterial Agent Triclosan for Malarial Enoyl Acyl Carrier Protein Reductase 著者: Perozzo, R. / Kuo, M. / Sidhu, A.S. / Valiyaveettil, J.T. / Bittman, R. / Jacobs Jr., W.R. / Fidock, D.A. / Sacchettini, J.C. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 125.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 99.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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2 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 25744.570 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() プラスミド: pET28a / 発現宿主: ![]() ![]() ![]() 参照: UniProt: Q9BH77, enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH) #2: タンパク質 | 分子量: 6829.676 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() プラスミド: pET28a / 発現宿主: ![]() ![]() ![]() 参照: UniProt: Q9BH77, enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH) #3: 化合物 | ![]() #4: 化合物 | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.84 Å3/Da / 溶媒含有率: 56.75 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化![]() | 温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 5.6 詳細: 100 mM sodium acetate, 2.35 M ammonium sulfate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS pH: 7.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 120 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: MACSCIENCE / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2001年3月6日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 2.5→30 Å / Num. all: 26564 / Num. obs: 25188 / % possible obs: 94.8 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 |
反射 | *PLUS Num. obs: 26564 / 冗長度: 3.7 % / Rmerge(I) obs: 0.098 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]()
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.5→30 Å
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精密化 | *PLUS 最低解像度: 30 Å / % reflection Rfree: 10 % | ||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |