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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1fhk | ||||||||||||||||||
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タイトル | NMR STRUCTURE OF THE 690 LOOP OF 16 S RRNA OF E. COLI | ||||||||||||||||||
要素 | RNA (5'-R(*キーワード | RNA (リボ核酸) / 690 loop of 16S / ribosomal RNA (リボソームRNA) | 機能・相同性 | リボ核酸 / RNA (> 10) | 機能・相同性情報 手法 | 溶液NMR / distance geometry | データ登録者 | Morosyuk, S.V. / Cunningham, P.R. / SantaLucia Jr., J. | 引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2001 | タイトル: Structure and function of the conserved 690 hairpin in Escherichia coli 16 S ribosomal RNA. II. NMR solution structure. 著者: Morosyuk, S.V. / Cunningham, P.R. / SantaLucia Jr., J. 履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1fhk.cif.gz | 135.6 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1fhk.ent.gz | 116.1 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1fhk.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/fh/1fhk ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/fh/1fhk | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: RNA鎖 | 分子量: 4541.771 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 詳細: T7 RNA polymerase run-off transcription and chemical synthesis |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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-試料調製
試料状態 | イオン強度: 0.05 M / pH: 6.5 / 圧: 1 atm / 温度: 289 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: その他 / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian UNITY / 製造業者: Varian / モデル: UNITY / 磁場強度: 500 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: distance geometry / ソフトェア番号: 1 / 詳細: IN WATER WITH COUNTERIONS USING PME | ||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 40 / 登録したコンフォーマーの数: 15 |