+データを開く
-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1e0n | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | YJQ8WW domain from Saccharomyces cerevisae | ||||||
要素 | HYPOTHETICAL PROTEIN | ||||||
キーワード | YJQ8WW DOMAIN / WW DOMAIN (WWドメイン) / SACCHAROMYCES CEREVISAE / YJQ8 PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 negative regulation of antisense RNA transcription / ascospore formation / negative regulation of reciprocal meiotic recombination / [histone H3]-lysine36 N-trimethyltransferase / histone H3K36 trimethyltransferase activity / DNA-templated transcription elongation / histone H3K36 methyltransferase activity / regulation of DNA-templated DNA replication initiation / DNA-templated transcription termination / メチル化 ...negative regulation of antisense RNA transcription / ascospore formation / negative regulation of reciprocal meiotic recombination / [histone H3]-lysine36 N-trimethyltransferase / histone H3K36 trimethyltransferase activity / DNA-templated transcription elongation / histone H3K36 methyltransferase activity / regulation of DNA-templated DNA replication initiation / DNA-templated transcription termination / メチル化 / クロマチン / regulation of DNA-templated transcription / 細胞核 / 細胞質基質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | SACCHAROMYCES CEREVISIAE (パン酵母) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Macias, M.J. / Gervais, V. / Civera, C. / Oschkinat, H. | ||||||
引用 | ジャーナル: Nat.Struct.Biol. / 年: 2000 タイトル: Structural Analysis of Ww Domains and Design of a Ww Prototype 著者: Macias, M.J. / Gervais, V. / Civera, C. / Oschkinat, H. | ||||||
履歴 |
|
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
---|
-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1e0n.cif.gz | 46.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | pdb1e0n.ent.gz | 30 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1e0n.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/e0/1e0n ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/e0/1e0n | HTTPS FTP |
---|
-関連構造データ
関連構造データ | 1e0lC 1e0mC C: 同じ文献を引用 (文献) |
---|---|
類似構造データ | |
その他のデータベース |
|
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||
NMR アンサンブル |
|
-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 3256.645 Da / 分子数: 1 / 断片: DOMAIN / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) SACCHAROMYCES CEREVISIAE (パン酵母) 発現宿主: ESCHERICHIA COLI (大腸菌) / 参照: UniProt: P46995*PLUS |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NMR実験 |
| ||||||||||||
NMR実験の詳細 | Text: THE STRUCTURE WAS DETERMINED USING HOMONUCLEAR NMR |
-試料調製
試料状態 | pH: 6.5 / 温度: 285 K |
---|
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DRX / 製造業者: Bruker / モデル: DRX / 磁場強度: 600 MHz |
---|
-解析
NMR software |
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | |||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: LOWEST ENERGY / 計算したコンフォーマーの数: 20 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |