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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1c2r | |||||||||
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タイトル | MOLECULAR STRUCTURE OF CYTOCHROME C2 ISOLATED FROM RHODOBACTER CAPSULATUS DETERMINED AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION | |||||||||
要素 | CYTOCHROME C2 | |||||||||
キーワード | ELECTRON TRANSPORT PROTEIN (CYTOCHROME) (電子伝達系) | |||||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | |||||||||
生物種 | Rhodobacter capsulatus (バクテリア) | |||||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2.5 Å | |||||||||
データ登録者 | Benning, M.M. / Wesenberg, G. / Caffrey, M.S. / Bartsch, R.G. / Meyer, T.E. / Cusanovich, M.A. / Rayment, I. / Holden, H.M. | |||||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1991 タイトル: Molecular structure of cytochrome c2 isolated from Rhodobacter capsulatus determined at 2.5 A resolution. 著者: Benning, M.M. / Wesenberg, G. / Caffrey, M.S. / Bartsch, R.G. / Meyer, T.E. / Cusanovich, M.A. / Rayment, I. / Holden, H.M. | |||||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1c2r.cif.gz | 55.3 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1c2r.ent.gz | 44.7 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1c2r.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/c2/1c2r ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/c2/1c2r | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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単位格子 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12286.013 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Rhodobacter capsulatus (バクテリア) 参照: UniProt: P00094 #2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.17 Å3/Da / 溶媒含有率: 61.26 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 7.5 / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.5 Å / 最低解像度: 30 Å / Num. obs: 9496 / Num. measured all: 12788 / Rmerge(I) obs: 0.039 |
-解析
ソフトウェア | 名称: TNT / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||
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精密化 | Rfactor obs: 0.168 / 最高解像度: 2.5 Å | ||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2.5 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最低解像度: 100 Å / Num. reflection obs: 9496 | ||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |