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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1bbh | |||||||||
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タイトル | ATOMIC STRUCTURE OF A CYTOCHROME C' WITH AN UNUSUAL LIGAND-CONTROLLED DIMER DISSOCIATION AT 1.8 ANGSTROMS RESOLUTION | |||||||||
要素 | CYTOCHROME C' | |||||||||
キーワード | ELECTRON TRANSPORT(HEME PROTEIN) | |||||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | |||||||||
生物種 | Allochromatium vinosum (紅色硫黄細菌) | |||||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 1.8 Å | |||||||||
データ登録者 | Ren, Z. / Mcree, D.E. | |||||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1993 タイトル: Atomic structure of a cytochrome c' with an unusual ligand-controlled dimer dissociation at 1.8 A resolution. 著者: Ren, Z. / Meyer, T. / McRee, D.E. #1: ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1990 タイトル: Crystallization and Characterization of Chromatium Vinosum Cytochrome C' 著者: Mcree, D.E. / Redford, S.M. / Meyer, T.E. / Cusanovich, M.A. | |||||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1bbh.cif.gz | 62.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1bbh.ent.gz | 50.9 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1bbh.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bb/1bbh ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bb/1bbh | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 13806.436 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Allochromatium vinosum (紅色硫黄細菌) 参照: UniProt: P00154 #2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.49 Å3/Da / 溶媒含有率: 50.7 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 7 / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / 詳細: using macroseeding | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.8 Å / 最低解像度: 3.3 Å / Num. all: 26336 / Num. obs: 25244 / % possible obs: 96 % / Num. measured all: 102043 / Rmerge(I) obs: 0.069 |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 1.8 Å / 最低解像度: 1.9 Å / % possible obs: 95 % / Mean I/σ(I) obs: 28.8 / Num. possible: 4304 / Num. unique obs: 4102 / Num. measured obs: 14700 / Rmerge(I) obs: 0.29 |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 1.8→5 Å / σ(F): 2 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.8→5 Å
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ソフトウェア | *PLUS 名称: X-PLOR / 分類: refinement | ||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.8 Å / 最低解像度: 5 Å / Num. reflection obs: 21287 / σ(F): 2 / Rfactor obs: 0.185 | ||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||
LS精密化 シェル | *PLUS 最高解像度: 1.8 Å / 最低解像度: 1.88 Å / Total num. of bins used: 8 / Num. reflection obs: 1798 / Rfactor obs: 0.301 |