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基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDG34 |
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![]() | Subgenomic flavivirus RNAs from West nile virus
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生物種 | ![]() ![]() |
![]() | ![]() タイトル: Long non‐coding subgenomic flavivirus RNAs have extended 3D structures and are flexible in solution 著者: Zhang Y / Zhang Y / Liu Z / Cheng M / Ma J / Wang Y / Qin C |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #3586 | ![]() タイプ: dummy / ソフトウェア: (2.8.3) / ダミー原子の半径: 7.00 A / カイ2乗値: 1.908 / P-value: 0.016729 ![]() |
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モデル #3603 | ![]() タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.402 ![]() |
モデル #3604 | ![]() タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.402 ![]() |
モデル #3605 | ![]() タイプ: atomic / カイ2乗値: 1.402 ![]() |
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試料
![]() | 名称: Subgenomic flavivirus RNAs from West nile virus / 試料濃度: 0.75-3.00 |
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バッファ | 名称: 20mM Tris-HCl, 100mM NaCl, 5mM MgCl2 / pH: 7.5 |
要素 #1838 | 名称: WNV-sfRNA / タイプ: RNA / 記述: Subgenomic flavivirus RNAs from West nile virus / 分子量: 170.058 / 分子数: 1 / 由来: West Nile virus 配列: GGAGUCAGGC CAGAUUAAUG CUGCCACCGG AAGUUGAGUA GACGGUGCUG CCUGCGGCUC AACCCCAGGA GGACUGGGUG ACCAAAGCUG CGAGGUGAUC CACGUAAGCC CUCAGAACCG UCUCGGAAGG AGGACCCCAC GUGCUUUAGC CUCAAGGCCC AGUGUCAGAC ...配列: GGAGUCAGGC CAGAUUAAUG CUGCCACCGG AAGUUGAGUA GACGGUGCUG CCUGCGGCUC AACCCCAGGA GGACUGGGUG ACCAAAGCUG CGAGGUGAUC CACGUAAGCC CUCAGAACCG UCUCGGAAGG AGGACCCCAC GUGCUUUAGC CUCAAGGCCC AGUGUCAGAC CACACUCUAG UGUGCCACUC UGCGGAGAGU GCAGUCUGCG AUAGUGCCCC AGGUGGACUG GGUUAACAAA GGCAAAACAU CGCCCCACGC GGCCAUAACC CUGGCUAUGG UGUUAACCAG GGAGAAGGGA CUAGAGGUUA GAGGAGACCC CGCGUCAAAA AGUGCACGGC CCAACUUGGC UGAAGCUGUA AGCCAAGGGA AGGACUAGAG GUUAGAGGAG ACCCCGUGCC AAAAACACCA AAAGAAACAG CAUAUUGACA CCUGGGAUAG ACUAGGGGAU CUUCUGCUCU GCACAACCAG CCACACGGCA CAGUGCGCCG AUAUAGGUGG CUGGUGGUGC GAGAACACAG GAUCU |
-実験情報
ビーム | 設備名称: Advanced Photon Source (APS), Argonne National Laboratory 12ID-B SAXS/WAXS 地域: Lemont, IL / 国: USA ![]() ![]() | |||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Pilatus 2M | |||||||||||||||||||||||||||
スキャン | 測定日: 2017年3月13日 / 保管温度: 4 °C / セル温度: 25 °C / 照射時間: 1 sec. / フレーム数: 30 / 単位: 1/A /
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距離分布関数 P(R) |
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結果 | コメント: The subtracted SAXS data series used to generate the final extrapolated to zero-concentration profile displayed in this entry are provided in the full entry zip archive. The ab initio ...コメント: The subtracted SAXS data series used to generate the final extrapolated to zero-concentration profile displayed in this entry are provided in the full entry zip archive. The ab initio dummy atom model represents the averaged spatial disposition of the RNA in solution (DAMFILT model), derived from several aligned individual models (corresponding fit).
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