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タイトルCryo-EM of Aβ fibrils from mouse models find tg-APP fibrils resemble those found in patients with sporadic Alzheimer's disease.
ジャーナル・号・ページNat Neurosci, Vol. 26, Issue 12, Page 2073-2080, Year 2023
掲載日2023年11月16日
著者Mara Zielinski / Fernanda S Peralta Reyes / Lothar Gremer / Sarah Schemmert / Benedikt Frieg / Luisa U Schäfer / Antje Willuweit / Lili Donner / Margitta Elvers / Lars N G Nilsson / Stina Syvänen / Dag Sehlin / Martin Ingelsson / Dieter Willbold / Gunnar F Schröder /
PubMed 要旨The use of transgenic mice displaying amyloid-β (Aβ) brain pathology has been essential for the preclinical assessment of new treatment strategies for Alzheimer's disease. However, the properties ...The use of transgenic mice displaying amyloid-β (Aβ) brain pathology has been essential for the preclinical assessment of new treatment strategies for Alzheimer's disease. However, the properties of Aβ in such mice have not been systematically compared to Aβ in the brains of patients with Alzheimer's disease. Here, we determined the structures of nine ex vivo Aβ fibrils from six different mouse models by cryogenic-electron microscopy. We found novel Aβ fibril structures in the APP/PS1, ARTE10 and tg-SwDI models, whereas the human type II filament fold was found in the ARTE10, tg-APP and APP23 models. The tg-APP mice showed an Aβ fibril whose structure resembles the human type I filament found in patients with sporadic Alzheimer's disease. A detailed assessment of the Aβ fibril structure is key to the selection of adequate mouse models for the preclinical development of novel plaque-targeting therapeutics and positron emission tomography imaging tracers in Alzheimer's disease.
リンクNat Neurosci / PubMed:37973869 / PubMed Central
手法EM (らせん対称)
解像度3.0 - 4.2 Å
構造データ

16942

8ol2

EMDB-16942, PDB-8ol2:
Murine type II Abeta fibril from APP23 mouse
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.0 Å

16944

8ol3

EMDB-16944, PDB-8ol3:
Murine type III Abeta fibril from APP/PS1 mouse
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.5 Å

16949

8ol5

EMDB-16949, PDB-8ol5:
Murine type II Abeta fibril from ARTE10 mouse
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.4 Å

16952

8ol6

EMDB-16952, PDB-8ol6:
Murine type II Abeta fibril from tgAPPSwe mouse
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.8 Å

16953

8ol7

EMDB-16953, PDB-8ol7:
MurineArc type I Abeta fibril from tg-APPArcSwe mouse
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.0 Å

16957

8olg

EMDB-16957, PDB-8olg:
DI2 Abeta fibril from tg-SwDI mouse
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 4.2 Å

16959

8oln

EMDB-16959, PDB-8oln:
DI1 Abeta fibril from tg-SwDI mouse
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.3 Å

16960

8olo

EMDB-16960, PDB-8olo:
Murine type III Abeta fibril from ARTE10 mouse
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.5 Å

16961

8olq

EMDB-16961, PDB-8olq:
DI3 Abeta fibril from tg-SwDI mouse
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 4.0 Å

由来
  • Mus musculus (ハツカネズミ)
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードPROTEIN FIBRIL / Amyloid fibril (アミロイド)

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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