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タイトルIFITM3 blocks influenza virus entry by sorting lipids and stabilizing hemifusion.
ジャーナル・号・ページCell Host Microbe, Vol. 31, Issue 4, Page 616-633.e20, Year 2023
掲載日2023年4月12日
著者Steffen Klein / Gonen Golani / Fabio Lolicato / Carmen Lahr / Daniel Beyer / Alexia Herrmann / Moritz Wachsmuth-Melm / Nina Reddmann / Romy Brecht / Mehdi Hosseinzadeh / Androniki Kolovou / Jana Makroczyova / Sarah Peterl / Martin Schorb / Yannick Schwab / Britta Brügger / Walter Nickel / Ulrich S Schwarz / Petr Chlanda /
PubMed 要旨Interferon-induced transmembrane protein 3 (IFITM3) inhibits the entry of numerous viruses through undefined molecular mechanisms. IFITM3 localizes in the endosomal-lysosomal system and specifically ...Interferon-induced transmembrane protein 3 (IFITM3) inhibits the entry of numerous viruses through undefined molecular mechanisms. IFITM3 localizes in the endosomal-lysosomal system and specifically affects virus fusion with target cell membranes. We found that IFITM3 induces local lipid sorting, resulting in an increased concentration of lipids disfavoring viral fusion at the hemifusion site. This increases the energy barrier for fusion pore formation and the hemifusion dwell time, promoting viral degradation in lysosomes. In situ cryo-electron tomography captured IFITM3-mediated arrest of influenza A virus membrane fusion. Observation of hemifusion diaphragms between viral particles and late endosomal membranes confirmed hemifusion stabilization as a molecular mechanism of IFITM3. The presence of the influenza fusion protein hemagglutinin in post-fusion conformation close to hemifusion sites further indicated that IFITM3 does not interfere with the viral fusion machinery. Collectively, these findings show that IFITM3 induces lipid sorting to stabilize hemifusion and prevent virus entry into target cells.
リンクCell Host Microbe / PubMed:37003257
手法EM (トモグラフィー)
構造データ

EMDB-15130: Tomogram of a late endosome of A549-IFITM3 cells infected with influenza A virus (Figure 4E)
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-15131: Tomogram of a late endosome of A549-IFITM3 cells infected with influenza A virus (Figure S7)
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-15132: Tomogram of a late endosome of A549-IFITM3 cells infected with influenza A virus (Figure S8)
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-15133: Tomogram of a late endosome of A549-IFITM3 cells infected with influenza A virus (Figure S9)
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-15705: Tomogram of a late endosome of A549 cell (Figure 1R)
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-15707: Tomogram of a late endosome of A549 cell treated with IFN-beta (Figure 1T)
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-15708: Tomogram of a late endosome of A549-IFITM3 cell (Figure 1V)
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-16128: Tomogram of a late endosome of A549 cell infected with influenza A virus.
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-16129: Tomogram of a late endosome of A549 cell infected with influenza A virus (Figure 6C).
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-16130: Tomogram of a late endosome of A549 cell infected with influenza A virus (Figure 6E)
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-16131: Tomogram of a late endosome of A549 cell infected with influenza A virus (Figure 6G)
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-16132: Tomogram of a late endosome of A549 cell infected with influenza A virus (Figure 6I,K,M)
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-16133: Tomogram of a late endosome of A549 cell infected with influenza A virus (Figure 6O)
手法: EM (トモグラフィー)

由来
  • Homo sapiens (ヒト)

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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