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タイトルStructural Basis for a Neutralizing Antibody Response Elicited by a Recombinant Hantaan Virus Gn Immunogen.
ジャーナル・号・ページmBio, Vol. 12, Issue 4, Page e0253120, Year 2021
掲載日2021年8月31日
著者Ilona Rissanen / Stefanie A Krumm / Robert Stass / Annalis Whitaker / James E Voss / Emily A Bruce / Sylvia Rothenberger / Stefan Kunz / Dennis R Burton / Juha T Huiskonen / Jason W Botten / Thomas A Bowden / Katie J Doores /
PubMed 要旨Hantaviruses are a group of emerging pathogens capable of causing severe disease upon zoonotic transmission to humans. The mature hantavirus surface presents higher-order tetrameric assemblies of two ...Hantaviruses are a group of emerging pathogens capable of causing severe disease upon zoonotic transmission to humans. The mature hantavirus surface presents higher-order tetrameric assemblies of two glycoproteins, Gn and Gc, which are responsible for negotiating host cell entry and constitute key therapeutic targets. Here, we demonstrate that recombinantly derived Gn from Hantaan virus (HTNV) elicits a neutralizing antibody response (serum dilution that inhibits 50% infection [ID], 1:200 to 1:850) in an animal model. Using antigen-specific B cell sorting, we isolated monoclonal antibodies (mAbs) exhibiting neutralizing and non-neutralizing activity, termed mAb HTN-Gn1 and mAb nnHTN-Gn2, respectively. Crystallographic analysis reveals that these mAbs target spatially distinct epitopes at disparate sites of the N-terminal region of the HTNV Gn ectodomain. Epitope mapping onto a model of the higher order (Gn-Gc) spike supports the immune accessibility of the mAb HTN-Gn1 epitope, a hypothesis confirmed by electron cryo-tomography of the antibody with virus-like particles. These data define natively exposed regions of the hantaviral Gn that can be targeted in immunogen design. The spillover of pathogenic hantaviruses from rodent reservoirs into the human population poses a continued threat to human health. Here, we show that a recombinant form of the Hantaan virus (HTNV) surface-displayed glycoprotein, Gn, elicits a neutralizing antibody response in rabbits. We isolated a neutralizing (HTN-Gn1) and a non-neutralizing (nnHTN-Gn2) monoclonal antibody and provide the first molecular-level insights into how the Gn glycoprotein may be targeted by the antibody-mediated immune response. These findings may guide rational vaccine design approaches focused on targeting the hantavirus glycoprotein envelope.
リンクmBio / PubMed:34225492 / PubMed Central
手法EM (サブトモグラム平均) / X線回折
解像度2.7 - 19.0 Å
構造データ

EMDB-12543:
Hantaan virus-like particle glycoprotein lattice.
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 12.3 Å

12544

7nrh

EMDB-12544: Hantaan virus-like particle glycoprotein spike in complex with Fab fragment HTN-Gn1.
PDB-7nrh: Hantaan virus glycoprotein (Gn) in complex with Fab fragment HTN-Gn1.
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 19.0 Å

PDB-7nks:
Structure of the Hantaan virus Gn glycoprotein ectodomain in complex with Fab HTN-Gn1
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 3.5 Å

PDB-7o9s:
Hantaan virus Gn in complex with Fab nnHTN-Gn2
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.7 Å

化合物

ChemComp-GOL:
GLYCEROL / グリセロ-ル / グリセリン

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-アセチル-β-D-グルコサミン / N-アセチルグルコサミン

由来
  • oryctolagus cuniculus (ウサギ)
  • hantaan orthohantavirus (ウイルス)
キーワードVIRAL PROTEIN (ウイルスタンパク質) / Hantaan virus glycoprotein / Gn glycoprotein / Fab / neutralizing antibody (中和抗体) / viral glycoprotein in complex with antibody / VIRUS LIKE PARTICLE (ウイルス様粒子) / VLP / virus-like particle (ウイルス様粒子) / Hantaan / HTNV / HNTV / glycoprotein (糖タンパク質) / spike / HTN-Gn1 / antibody (抗体) / epitope (エピトープ) / Gn in complex with Fab

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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