+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 1ohg | |||||||||
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Title | STRUCTURE OF THE DSDNA BACTERIOPHAGE HK97 MATURE EMPTY CAPSID | |||||||||
Components | MAJOR CAPSID PROTEIN | |||||||||
Keywords | VIRUS / VIRUS COAT PROTEIN / VIRUS/VIRAL PROTEIN / BACTERIOPHAGE / CAPSID / AUTO- CATALYTIC CROSS-LINK / ICOSAHEDRAL VIRUS | |||||||||
Function / homology | Function and homology information viral procapsid maturation / T=7 icosahedral viral capsid / viral capsid / identical protein binding Similarity search - Function | |||||||||
Biological species | BACTERIOPHAGE HK97 (virus) | |||||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 3.45 Å | |||||||||
Authors | Helgstrand, C. / Wikoff, W.R. / Duda, R.L. / Hendrix, R.W. / Johnson, J.E. / Liljas, L. | |||||||||
Citation | Journal: J.Mol.Biol. / Year: 2003 Title: The Refined Structure of a Protein Catenane: The Hk97 Bacteriophage Capsid at 3.44A Resolution Authors: Helgstrand, C. / Wikoff, W.R. / Duda, R.L. / Hendrix, R.W. / Johnson, J.E. / Liljas, L. #1: Journal: Acta Crystallogr.,Sect.D / Year: 2000 Title: Increased Resolution Data from a Large Unit Cell Crystal Collected at a Third-Generation Synchrotron X-Ray Source Authors: Wikoff, W.R. / Schildkamp, W. / Johnson, J.E. #2: Journal: Science / Year: 2000 Title: Topologically Linked Protein Rings in the Bacteriophage Hk97 Capsid Authors: Wikoff, W.R. / Liljas, L. / Duda, R.L. / Tsuruta, H. / Hendrix, R.W. / Johnson, J.E. #3: Journal: Acta Crystallogr.,Sect.D / Year: 1999 Title: Crystallographic Analysis of the DsDNA Bacteriophage Hk97 Mature Empty Capsid Authors: Wikoff, W.R. / Duda, R.L. / Hendrix, R.W. / Johnson, J.E. | |||||||||
History |
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Remark 700 | SHEET THE SHEET STRUCTURE OF THIS MOLECULE IS BIFURCATED. IN ORDER TO REPRESENT THIS FEATURE IN ... SHEET THE SHEET STRUCTURE OF THIS MOLECULE IS BIFURCATED. IN ORDER TO REPRESENT THIS FEATURE IN THE SHEET RECORDS BELOW, TWO SHEETS ARE DEFINED. |
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 1ohg.cif.gz | 379.4 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb1ohg.ent.gz | 316.1 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 1ohg.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 1ohg_validation.pdf.gz | 461 KB | Display | wwPDB validaton report |
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Full document | 1ohg_full_validation.pdf.gz | 527.9 KB | Display | |
Data in XML | 1ohg_validation.xml.gz | 47.8 KB | Display | |
Data in CIF | 1ohg_validation.cif.gz | 69 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/oh/1ohg ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/oh/1ohg | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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1 |
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2 |
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3 |
| x 5|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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5 |
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6 |
| x 60|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
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Symmetry | Point symmetry: (Schoenflies symbol: I (icosahedral)) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS oper:
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