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相关链接

- 大阪大学蛋白质研究所 蛋白质结构数据库构筑研究室 - 大阪大学蛋白质研究所 - 大阪大学 - Japan alliance for Bioscience Information (JBI) - 生物科学数据库中心(JST-NBDC) - 日本DNA数据库(DDBJ) - Database Center for Life Science (DBCLS) - Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB) - European ...

COVID-19特辑

冠状病毒,2020. 由David S. Goodsell @ RCSB PDB原图修改 最近爆发的新型冠状病毒传染病(Novel Coronavirus disease 2019: COVID-19)对全世界的人们都构成了严重威胁。 为了尽早了解新病毒(Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2: SARS-CoV-2)以开发出有效的抗病毒药物,已经有很多科研人員开始了相关蛋白结构的研究,并且将所获得的结构数据存储于PDB。 PDBj为用户提 ...

蛋白质三维结构数据库咨询委员会

来自科学社区的顾问 - 光冈 薰 (大阪大学超高压显微镜中心 教授) - 神田 大辅(九州大学生体防御医学研究所 教授) - 千田 俊哉(高能量加速器研究机构 物质构造科学研究所 教授) - 山本 雅贵(理化学研究所放射线科学综合研究中心 部长) - 齐藤 纯一(协和KIRIN株式会社低分子医药研究所 副所长) - Kyeong Kyu Kim(韩国,成均馆大学校 教授) - 萧 传证(台湾,中央研究院分子生物研究所 代理所长) 既往成员 - 李 奉振(韩国,首尔大学校药学大学 教授) - 若槻 ...

2020年7月是PDBj成立20周年。

日本蛋白质数据库(PDBj)于2020年7月迎来成立20周年的纪念日。 2000年7月6日,PDBj在JST-BIRD的支援下,受理了第一例数据登录以及处理。 2000年当时,年间总计处理数据仅157例的PDBj, 在RCSB PDB的协助和技术支持下,2001年处理数据376例,2002年处理量达到602例。 2003年,PDBj携手RCSB PDB以及PDBe成立wwPDB,作为wwPDB一员承担起整个亚洲和大洋洲地区的业务。 近年,来自亚洲,尤其是中国大陆的登录数量显著增加,PDBj的主要责任区域也在 ...

数据登记指南

关于新wwPDB登记系统 (OneDep) wwPDB OneDep system supports X-ray, EM and NMR structures. - 登记导航 新数据登记指南 (wwPDB site: Tutorials) wwPDB site: wwPDB Deposition & Annotation System wwPDB site: wwPDB Deposition & Annotation System FAQ 使用OneDep系统进行PDB登记的5个简单步骤 ( ...

[wwPDB] MX数据登记文件格式将仅限于PDBx / mmCIF格式

自2019年7月1日开始,PDB的晶体学结构数据登记将限定使用PDBx / mmCIF的格式文件。 自2019年7月1日,通过OneDep 登记大分子晶体学(MX)解析的晶体结构,包括X光、中子、纤维衍射和电子衍射法,PDBx / mmCIF将是PDB唯一接受的文件格式。与以往的PDB格式相比,使用PDBx / mmCIF格式文件将改善数据登记效率,并且更完整的记录实验数据以有益于来强化数据验证。同时,以往的PDB格式文件不支持含有100,000以上原子的结构数据以及多个字符的分子链ID。此外,到 ...

个人信息保护方针

* 请参阅此处有关使用条款 除非信息提供者同意,或者基于相关法律法规的需要,否则将不向任何第三方提供个人信息。 个人信息的范围 - 用户在联系页面提交的各种信息 (姓名、电子邮件地址等) - 访问纪录 (包括访问者的网域名称、IP地址、网络浏览器、访问时间以及检索用语等。此项纪录不包含可以特定的个人信息) 个人信息的使用目的 - 回复各种咨询 - 统计访问量和分析访问模式。 有关个人信息的管理 PDBj将尽可能在安全的环境下严格谨慎管理所有个人信息。 如有其他问题,请 ...

我们将于11月24日至26日在电信中心大楼(东京台场)举办的“2017年科学博览会”

wwPDB登记系统:简介

想要了解更多信息,请参照 wwPDB: Deposition Tutorial (英语) 登记系统的简介 目录 - 录像教程 - 逐步教程 坐标登记 NMR结构的登记 电子显微镜法数据的登记 - 坐标登记 - NMR结构的登记 - 电子显微镜法数据的登记 请对新数据登记系统以及本教程提出意见和建议。如在数据登记过程中遇到任何问题,请联系: - deposit-help@mail.wwpdb.org - PDBj 咨询表格 (根据需要,可能转发wwPDB)

News on 2016-1-11

wwPDB新数据登记以及注释系统开放接受NMR和3DEM结构数据 wwPDB合作伙伴隆重推出新数据登记系统,全面支持使用3DEM,NMR和X射线,中子线和电子晶体学测定的各种结构数据。 请从下述网页提交新数据: http://deposit-next.wwpdb.org/deposition/ 新系统实现了与EMDB和BMRB群集交互操作,可将原子坐标(PDB)文件与EM电子密度图(EMDB)或核磁共振实验数据(BMRB)同时登记,并同时发行PDB,EMDB以及BMRB编号。 请 ...

217705

数据于2024-03-27公开中

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