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你可以自由利用PDB數據於又商業又非商業用途(CC0 1.0通用公眾領域貢獻)。對於使用PDBj網站中的其他內容,也請參見下面的描述以了解詳情。 你可以自由鏈接到我們網站的任何頁面,而不需要我們的許可。 如果有任何問題,請從聯繫表格中查詢。 關於我們的隱私政策,請看這裡。 對象 版權出處 範例與備註 PDB數據(各格式,存儲在通常從每個wwPDB成員站點發布的PDB存檔中) PDB ID - 你可以自由利用PDB數據於又商業又非商業用途(CC0 1.0通用公眾領域貢獻 ...

相關連接

- 大阪大學蛋白質研究所 蛋白質結構數據庫構築研究室 - 大阪大學蛋白質研究所 - 大阪大學 - Japan alliance for Bioscience Information (JBI) - 生物科學數據庫中心(JST-NBDC) - 日本DNA資料庫(DDBJ) - Database Center for Life Science (DBCLS) - Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB) - European ...

COVID-19特輯

冠狀病毒,2020. 由David S. Goodsell @ RCSB PDB原圖修改 最近爆發的新型冠狀病毒傳染病(Novel Coronavirus disease 2019: COVID-19)對全世界的人們都構成了嚴重威脅。 為了儘早了解新病毒(Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2: SARS-CoV-2)以開發出有效的抗病毒藥物,已經有很多科研人員開始了相關蛋白結構的研究,並且將所獲得結構數據存儲與PDB。 PDBj為用戶提供 ...

蛋白質三維結構數據庫諮詢委員會

來自科學社區的顧問 - 光岡 薰 (大阪大學超高壓顯微鏡中心 教授) - 神田 大輔 (九州大學生體防御醫學研究所 教授) - 千田 俊哉 (高能量加速器研究機構 物質構造科學研究所 教授) - 山本 雅貴 (理化學研究所放射線科學綜合研究中心 部長) - 齊藤 純一 (協和KIRIN株式會社低分子醫藥研究所 副所長) - Kyeong Kyu Kim(韓國,成均館大學校 教授) - 蕭 傳證 (台灣,中央研究院分子生物研究所 代理所長) 既往成員 - 李 奉振 (韓國,首爾大學校藥學大學 教授) ...

2020年7月是PDBj成立20週年。

日本蛋白質數據庫(PDBj)於2020年7月迎來成立20週年的紀念日。 2000年7月6日,PDBj在JST-BIRD的支援下,受理了第一例數據登錄以及處理。 2000年當時,年間總計處理數據157例的PDBj, 在RCSB PDB的協助和技術支持下,2001年處理數據376例,2002年處理量達到602例。 2003年,PDBj攜手RCSB PDB以及PDBe成立wwPDB,作為wwPDB一員承擔起整個亞洲和大洋洲地區的業務。 近年,來自亞洲,尤其是中國大陸的登錄數量顯著增加,PDBj的主要責任區域也在 ...

數據儲存指南

關於新wwPDB OneDep系統 wwPDB OneDep system supports X-ray, EM and NMR structures. - 儲存導航 新數據登記指南 (wwPDB site: Tutorials) wwPDB site: wwPDB OneDep System wwPDB site: wwPDB OneDep System FAQ 使用OneDep系統進行PDB登記的5個簡單步驟 (PDF) - 新數據登記指南 (wwPDB site: Tutorials) ...

[wwPDB] 提存MX版本的規定性PDBx / mmCIF格式檔案

自2019年7月1日開始,提存PDB的晶體學檔案將只限於PDBx / mmCIF的格式。 從2019年7月1日,透過OneDep 所提存巨分子晶體學(MX)解析的晶體結構,包括X光、中子、纖維和電子繞射方法,PDBx / mmCIF將是PDB唯一可接受的格式。與過去行之有年的PDB格式相比,PDBx / mmCIF格式檔案將改善提存過程的效率,並運用PDBx / mmCIF的支援可處理更大量的實驗數據來強化驗證。具有100,000個或更多原子的PDB結構項目以及具有多個字元鏈ID的項目已不再適用傳統 ...

個人資料保護方針

* 請參閱此處有關使用條款 除非取得用戶同意或依法令得提供予第三人,否則決不將用戶之個人資料開示或提供予第三人。 個人資料的範圍 - 用戶在聯絡頁面提交的各種資料 (姓名、電子郵件帳號等) - 瀏覽記錄 (包括瀏覽者域名、連線設備IP位址、使用時間、使用的瀏覽器以及查詢用語等。此項記錄不包含可以特定的個人資料) 個人資料的使用目的 - 回應各種查詢 - 統計瀏覽人數及分析瀏覽模式。 有關個人資料的管理 PDB將盡可能在安全的環境下嚴格謹慎管理所有個人資料。 如有其他問 ...

我們將於11月24日至26日在電信中心大樓(東京台場)舉行的“2017年科學博覽會”

wwPDB登記系統:簡介

想要了解更多信息,請參照wwPDB: Deposition Tutorial (英語) 登記系統的簡介 目錄 - 錄像教程 - 逐步教程 坐標登記 NMR結構的登記 電子顯微鏡法數據的登記 - 坐標登記 - NMR結構的登記 - 電子顯微鏡法數據的登記 請對新數據登記系統以及本教程提出意見和建議。如在數據登記過程中遇到任何問題,請聯繫: - deposit-help@mail.wwpdb.org - PDBj 諮詢表格 (根據需要,可能轉發wwPDB) 录像教程 X ...

News on 2016-1-11

wwPDB新數據登記以及註釋系統開放接受NMR和3DEM結構數據 wwPDB合作夥伴隆重推出新數據登記系統,全面支持使用3DEM,NMR和X射線,中子線和電子晶體學測定的各種結構數據。 請從下述網頁提交新數據: http://deposit-next.wwpdb.org/deposition/ 新系統實現了與EMDB和BMRB群集交互操作,可將原子坐標(PDB)文件與EM電子密度圖(EMDB)或核磁共振實驗數據(BMRB)同時登記,並同時發行PDB,EMDB以及BMRB編號。 請參 ...

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數據於2024-04-17公開中

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