?

Promode Elastic




    Copyright ©  WASEDA Univ,Japan. All rights reserved.

    Header

    HEADER    STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION   11-JAN-06   2FNE              
    TITLE     THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE 13TH PDZ DOMAIN OF MPDZ                  
    COMPND    MOL_ID: 1;                                                            
    COMPND   2 MOLECULE: MULTIPLE PDZ DOMAIN PROTEIN;                               
    COMPND   3 CHAIN: A, B, C;                                                      
    COMPND   4 FRAGMENT: MPDZ DOMAIN, RESIDUES 1955-2042;                           
    COMPND   5 SYNONYM: MULTI PDZ DOMAIN PROTEIN 1;                                 
    COMPND   6 ENGINEERED: YES                                                      
    SOURCE    MOL_ID: 1;                                                            
    SOURCE   2 ORGANISM_SCIENTIFIC: HOMO SAPIENS;                                   
    SOURCE   3 ORGANISM_COMMON: HUMAN;                                              
    SOURCE   4 ORGANISM_TAXID: 9606;                                                
    SOURCE   5 GENE: MPDZ, MUPP1;                                                   
    SOURCE   6 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI;                                 
    SOURCE   7 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 562;                                        
    SOURCE   8 EXPRESSION_SYSTEM_STRAIN: BL-21(DE3)R3;                              
    SOURCE   9 EXPRESSION_SYSTEM_VECTOR_TYPE: PLASMID;                              
    SOURCE  10 EXPRESSION_SYSTEM_PLASMID: PNIC28-BSA4                               
    KEYWDS    STRUCTURAL PROTEIN, STRUCTURAL GENOMICS, SGC, STRUCTURAL              
    KEYWDS   2 GENOMICS CONSORTIUM, UNKNOWN FUNCTION                                
    EXPDTA    X-RAY DIFFRACTION                                                     
    AUTHOR    E.PAPAGRIGORIOU,G.BERRIDGE,C.JOHANSSON,S.COLEBROOK,E.SALAH,           
    AUTHOR   2 N.BURGESS,C.SMEE,P.SAVITSKY,J.BRAY,G.SCHOCH,C.PHILLIPS,              
    AUTHOR   3 C.GILEADI,M.SOUNDARAJAN,X.YANG,J.M.ELKINS,F.GORREC,                  
    AUTHOR   4 A.TURNBULL,A.EDWARDS,C.ARROWSMITH,J.WEIGELT,M.SUNDSTROM,             
    AUTHOR   5 D.A.DOYLE,STRUCTURAL GENOMICS CONSORTIUM (SGC)                       
    REVDAT   3   24-FEB-09 2FNE    1       VERSN                                    
    REVDAT   2   30-SEP-08 2FNE    1       JRNL                                     
    REVDAT   1   24-JAN-06 2FNE    0                                                
    JRNL        AUTH   J.M.ELKINS,E.PAPAGRIGORIOU,G.BERRIDGE,X.YANG,                
    JRNL        AUTH 2 C.PHILLIPS,C.GILEADI,P.SAVITSKY,D.A.DOYLE                    
    JRNL        TITL   STRUCTURE OF PICK1 AND OTHER PDZ DOMAINS OBTAINED            
    JRNL        TITL 2 WITH THE HELP OF SELF-BINDING C-TERMINAL                     
    JRNL        TITL 3 EXTENSIONS.                                                  
    JRNL        REF    PROTEIN SCI.                  V.  16   683 2007              
    JRNL        REFN                   ISSN 0961-8368                               
    JRNL        PMID   17384233                                                     
    JRNL        DOI    10.1110/PS.062657507                                         
    REMARK   1                                                                      
    REMARK   2                                                                      
    REMARK   2 RESOLUTION.    1.83 ANGSTROMS.                                       
    REMARK   3                                                                      
    REMARK   3 REFINEMENT.                                                          
    REMARK   3   PROGRAM     : REFMAC 5.2.0019                                      
    REMARK   3   AUTHORS     : MURSHUDOV,VAGIN,DODSON                               
    REMARK   3                                                                      
    REMARK   3    REFINEMENT TARGET : MAXIMUM LIKELIHOOD                            
    REMARK   3                                                                      
    REMARK   3  DATA USED IN REFINEMENT.                                            
    REMARK   3   RESOLUTION RANGE HIGH (ANGSTROMS) : 1.83                           
    REMARK   3   RESOLUTION RANGE LOW  (ANGSTROMS) : 39.50                          
    REMARK   3   DATA CUTOFF            (SIGMA(F)) : 0.000                          
    REMARK   3   COMPLETENESS FOR RANGE        (%) : 100.0                          
    REMARK   3   NUMBER OF REFLECTIONS             : 26605                          
    REMARK   3                                                                      
    REMARK   3  FIT TO DATA USED IN REFINEMENT.                                     
    REMARK   3   CROSS-VALIDATION METHOD          : THROUGHOUT                      
    REMARK   3   FREE R VALUE TEST SET SELECTION  : RANDOM                          
    REMARK   3   R VALUE     (WORKING + TEST SET) : 0.194                           
    REMARK   3   R VALUE            (WORKING SET) : 0.190                           
    REMARK   3   FREE R VALUE                     : 0.243                           
    REMARK   3   FREE R VALUE TEST SET SIZE   (%) : 7.700                           
    REMARK   3   FREE R VALUE TEST SET COUNT      : 2038                            
    REMARK   3                                                                      
    REMARK   3  FIT IN THE HIGHEST RESOLUTION BIN.                                  
    REMARK   3   TOTAL NUMBER OF BINS USED           : 20                           
    REMARK   3   BIN RESOLUTION RANGE HIGH       (A) : 1.83                         
    REMARK   3   BIN RESOLUTION RANGE LOW        (A) : 1.87                         
    REMARK   3   REFLECTION IN BIN     (WORKING SET) : 1799                         
    REMARK   3   BIN COMPLETENESS (WORKING+TEST) (%) : 100.00                       
    REMARK   3   BIN R VALUE           (WORKING SET) : 0.2370                       
    REMARK   3   BIN FREE R VALUE SET COUNT          : 141                          
    REMARK   3   BIN FREE R VALUE                    : 0.3050                       
    REMARK   3                                                                      
    REMARK   3  NUMBER OF NON-HYDROGEN ATOMS USED IN REFINEMENT.                    
    REMARK   3   PROTEIN ATOMS            : 2175                                    
    REMARK   3   NUCLEIC ACID ATOMS       : 0                                       
    REMARK   3   HETEROGEN ATOMS          : 0                                       
    REMARK   3   SOLVENT ATOMS            : 199                                     
    REMARK   3                                                                      
    REMARK   3  B VALUES.                                                           
    REMARK   3   FROM WILSON PLOT           (A**2) : NULL                           
    REMARK   3   MEAN B VALUE      (OVERALL, A**2) : 44.10                          
    REMARK   3   OVERALL ANISOTROPIC B VALUE.                                       
    REMARK   3    B11 (A**2) : 0.21000                                              
    REMARK   3    B22 (A**2) : 0.05000                                              
    REMARK   3    B33 (A**2) : -0.22000                                             
    REMARK   3    B12 (A**2) : 0.00000                                              
    REMARK   3    B13 (A**2) : 0.06000                                              
    REMARK   3    B23 (A**2) : 0.00000                                              
    REMARK   3                                                                      
    REMARK   3  ESTIMATED OVERALL COORDINATE ERROR.                                 
    REMARK   3   ESU BASED ON R VALUE                            (A): 0.142         
    REMARK   3   ESU BASED ON FREE R VALUE                       (A): 0.142         
    REMARK   3   ESU BASED ON MAXIMUM LIKELIHOOD                 (A): 0.099         
    REMARK   3   ESU FOR B VALUES BASED ON MAXIMUM LIKELIHOOD (A**2): 6.208         
    REMARK   3                                                                      
    REMARK   3 CORRELATION COEFFICIENTS.                                            
    REMARK   3   CORRELATION COEFFICIENT FO-FC      : 0.956                         
    REMARK   3   CORRELATION COEFFICIENT FO-FC FREE : 0.932                         
    REMARK   3                                                                      
    REMARK   3  RMS DEVIATIONS FROM IDEAL VALUES        COUNT    RMS    WEIGHT      
    REMARK   3   BOND LENGTHS REFINED ATOMS        (A):  2207 ; 0.015 ; 0.022       
    REMARK   3   BOND LENGTHS OTHERS               (A):  NULL ;  NULL ;  NULL       
    REMARK   3   BOND ANGLES REFINED ATOMS   (DEGREES):  2995 ; 1.556 ; 1.983       
    REMARK   3   BOND ANGLES OTHERS          (DEGREES):  NULL ;  NULL ;  NULL       
    REMARK   3   TORSION ANGLES, PERIOD 1    (DEGREES):   304 ; 6.513 ; 5.000       
    REMARK   3   TORSION ANGLES, PERIOD 2    (DEGREES):    79 ;36.366 ;24.557       
    REMARK   3   TORSION ANGLES, PERIOD 3    (DEGREES):   364 ;14.272 ;15.000       
    REMARK   3   TORSION ANGLES, PERIOD 4    (DEGREES):    12 ;19.574 ;15.000       
    REMARK   3   CHIRAL-CENTER RESTRAINTS       (A**3):   356 ; 0.119 ; 0.200       
    REMARK   3   GENERAL PLANES REFINED ATOMS      (A):  1646 ; 0.006 ; 0.020       
    REMARK   3   GENERAL PLANES OTHERS             (A):  NULL ;  NULL ;  NULL       
    REMARK   3   NON-BONDED CONTACTS REFINED ATOMS (A):   877 ; 0.213 ; 0.200       
    REMARK   3   NON-BONDED CONTACTS OTHERS        (A):  NULL ;  NULL ;  NULL       
    REMARK   3   NON-BONDED TORSION REFINED ATOMS  (A):  1520 ; 0.308 ; 0.200       
    REMARK   3   NON-BONDED TORSION OTHERS         (A):  NULL ;  NULL ;  NULL       
    REMARK   3   H-BOND (X...Y) REFINED ATOMS      (A):   183 ; 0.152 ; 0.200       
    REMARK   3   H-BOND (X...Y) OTHERS             (A):  NULL ;  NULL ;  NULL       
    REMARK   3   POTENTIAL METAL-ION REFINED ATOMS (A):  NULL ;  NULL ;  NULL       
    REMARK   3   POTENTIAL METAL-ION OTHERS        (A):  NULL ;  NULL ;  NULL       
    REMARK   3   SYMMETRY VDW REFINED ATOMS        (A):    73 ; 0.264 ; 0.200       
    REMARK   3   SYMMETRY VDW OTHERS               (A):  NULL ;  NULL ;  NULL       
    REMARK   3   SYMMETRY H-BOND REFINED ATOMS     (A):    17 ; 0.175 ; 0.200       
    REMARK   3   SYMMETRY H-BOND OTHERS            (A):  NULL ;  NULL ;  NULL       
    REMARK   3   SYMMETRY METAL-ION REFINED ATOMS  (A):  NULL ;  NULL ;  NULL       
    REMARK   3   SYMMETRY METAL-ION OTHERS         (A):  NULL ;  NULL ;  NULL       
    REMARK   3                                                                      
    REMARK   3  ISOTROPIC THERMAL FACTOR RESTRAINTS.     COUNT   RMS    WEIGHT      
    REMARK   3   MAIN-CHAIN BOND REFINED ATOMS  (A**2):  1517 ; 3.272 ; 3.000       
    REMARK   3   MAIN-CHAIN BOND OTHER ATOMS    (A**2):  NULL ;  NULL ;  NULL       
    REMARK   3   MAIN-CHAIN ANGLE REFINED ATOMS (A**2):  2369 ; 4.243 ; 5.000       
    REMARK   3   SIDE-CHAIN BOND REFINED ATOMS  (A**2):   759 ; 5.951 ; 7.000       
    REMARK   3   SIDE-CHAIN ANGLE REFINED ATOMS (A**2):   622 ; 8.016 ;11.000       
    REMARK   3                                                                      
    REMARK   3 ANISOTROPIC THERMAL FACTOR RESTRAINTS.    COUNT   RMS   WEIGHT       
    REMARK   3   RIGID-BOND RESTRAINTS          (A**2):  NULL ;  NULL ;  NULL       
    REMARK   3   SPHERICITY; FREE ATOMS         (A**2):  NULL ;  NULL ;  NULL       
    REMARK   3   SPHERICITY; BONDED ATOMS       (A**2):  NULL ;  NULL ;  NULL       
    REMARK   3                                                                      
    REMARK   3  NCS RESTRAINTS STATISTICS                                           
    REMARK   3   NUMBER OF DIFFERENT NCS GROUPS : 1                                 
    REMARK   3                                                                      
    REMARK   3  NCS GROUP NUMBER               : 1                                  
    REMARK   3     CHAIN NAMES                    : A B C                           
    REMARK   3     NUMBER OF COMPONENTS NCS GROUP : 1                               
    REMARK   3       COMPONENT C  SSSEQI  TO  C   SSSEQI   CODE                     
    REMARK   3           1     A   1956       A    2048      4                      
    REMARK   3           1     B   1956       B    2048      4                      
    REMARK   3           1     C   1956       C    2048      4                      
    REMARK   3                   GROUP CHAIN        COUNT   RMS     WEIGHT          
    REMARK   3   MEDIUM POSITIONAL  1    A    (A):    636 ;  0.34 ;  0.50           
    REMARK   3   MEDIUM POSITIONAL  1    B    (A):    636 ;  0.61 ;  0.50           
    REMARK   3   MEDIUM POSITIONAL  1    C    (A):    636 ;  0.53 ;  0.50           
    REMARK   3   MEDIUM THERMAL     1    A (A**2):    636 ;  2.80 ;  2.00           
    REMARK   3   MEDIUM THERMAL     1    B (A**2):    636 ;  1.98 ;  2.00           
    REMARK   3   MEDIUM THERMAL     1    C (A**2):    636 ;  2.02 ;  2.00           
    REMARK   3                                                                      
    REMARK   3  TLS DETAILS                                                         
    REMARK   3   NUMBER OF TLS GROUPS  : NULL                                       
    REMARK   3                                                                      
    REMARK   3  BULK SOLVENT MODELLING.                                             
    REMARK   3   METHOD USED : BABINET MODEL WITH MASK                              
    REMARK   3   PARAMETERS FOR MASK CALCULATION                                    
    REMARK   3   VDW PROBE RADIUS   : 1.40                                          
    REMARK   3   ION PROBE RADIUS   : 0.80                                          
    REMARK   3   SHRINKAGE RADIUS   : 0.80                                          
    REMARK   3                                                                      
    REMARK   3  OTHER REFINEMENT REMARKS: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE          
    REMARK   3  RIDING POSITIONS                                                    
    REMARK   4                                                                      
    REMARK   4 2FNE COMPLIES WITH FORMAT V. 3.15, 01-DEC-08                         
    REMARK 100                                                                      
    REMARK 100 THIS ENTRY HAS BEEN PROCESSED BY RCSB ON 13-JAN-06.                  
    REMARK 100 THE RCSB ID CODE IS RCSB036082.                                      
    REMARK 200                                                                      
    REMARK 200 EXPERIMENTAL DETAILS                                                 
    REMARK 200  EXPERIMENT TYPE                : X-RAY DIFFRACTION                  
    REMARK 200  DATE OF DATA COLLECTION        : 09-DEC-05                          
    REMARK 200  TEMPERATURE           (KELVIN) : 100                                
    REMARK 200  PH                             : 4.6                                
    REMARK 200  NUMBER OF CRYSTALS USED        : 1                                  
    REMARK 200                                                                      
    REMARK 200  SYNCHROTRON              (Y/N) : Y                                  
    REMARK 200  RADIATION SOURCE               : SLS                                
    REMARK 200  BEAMLINE                       : X10SA                              
    REMARK 200  X-RAY GENERATOR MODEL          : NULL                               
    REMARK 200  MONOCHROMATIC OR LAUE    (M/L) : M                                  
    REMARK 200  WAVELENGTH OR RANGE        (A) : 0.97900                            
    REMARK 200  MONOCHROMATOR                  : SI(111)                            
    REMARK 200  OPTICS                         : NULL                               
    REMARK 200                                                                      
    REMARK 200  DETECTOR TYPE                  : CCD                                
    REMARK 200  DETECTOR MANUFACTURER          : MARRESEARCH                        
    REMARK 200  INTENSITY-INTEGRATION SOFTWARE : HKL-2000                           
    REMARK 200  DATA SCALING SOFTWARE          : SCALEPACK                          
    REMARK 200                                                                      
    REMARK 200  NUMBER OF UNIQUE REFLECTIONS   : 26605                              
    REMARK 200  RESOLUTION RANGE HIGH      (A) : 1.830                              
    REMARK 200  RESOLUTION RANGE LOW       (A) : 39.500                             
    REMARK 200  REJECTION CRITERIA  (SIGMA(I)) : 0.000                              
    REMARK 200                                                                      
    REMARK 200 OVERALL.                                                             
    REMARK 200  COMPLETENESS FOR RANGE     (%) : 99.9                               
    REMARK 200  DATA REDUNDANCY                : NULL                               
    REMARK 200  R MERGE                    (I) : 0.05080                            
    REMARK 200  R SYM                      (I) : NULL                               
    REMARK 200  <I/SIGMA(I)> FOR THE DATA SET  : NULL                               
    REMARK 200                                                                      
    REMARK 200 IN THE HIGHEST RESOLUTION SHELL.                                     
    REMARK 200  HIGHEST RESOLUTION SHELL, RANGE HIGH (A) : 1.83                     
    REMARK 200  HIGHEST RESOLUTION SHELL, RANGE LOW  (A) : 1.95                     
    REMARK 200  COMPLETENESS FOR SHELL     (%) : 100.0                              
    REMARK 200  DATA REDUNDANCY IN SHELL       : NULL                               
    REMARK 200  R MERGE FOR SHELL          (I) : 0.47530                            
    REMARK 200  R SYM FOR SHELL            (I) : NULL                               
    REMARK 200  <I/SIGMA(I)> FOR SHELL         : 2.150                              
    REMARK 200                                                                      
    REMARK 200 DIFFRACTION PROTOCOL: SINGLE WAVELENGTH                              
    REMARK 200 METHOD USED TO DETERMINE THE STRUCTURE: MOLECULAR REPLACEMENT        
    REMARK 200 SOFTWARE USED: PHASER                                                
    REMARK 200 STARTING MODEL: 2BYG                                                 
    REMARK 200                                                                      
    REMARK 200 REMARK: NULL                                                         
    REMARK 280                                                                      
    REMARK 280 CRYSTAL                                                              
    REMARK 280 SOLVENT CONTENT, VS   (%): 40.00                                     
    REMARK 280 MATTHEWS COEFFICIENT, VM (ANGSTROMS**3/DA): 2.10                     
    REMARK 280                                                                      
    REMARK 280 CRYSTALLIZATION CONDITIONS: 8% PEG P3350, 0.1M ACETATE, PH 4.6,      
    REMARK 280  VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 298K                     
    REMARK 290                                                                      
    REMARK 290 CRYSTALLOGRAPHIC SYMMETRY                                            
    REMARK 290 SYMMETRY OPERATORS FOR SPACE GROUP: P 1 21 1                         
    REMARK 290                                                                      
    REMARK 290      SYMOP   SYMMETRY                                                
    REMARK 290     NNNMMM   OPERATOR                                                
    REMARK 290       1555   X,Y,Z                                                   
    REMARK 290       2555   -X,Y+1/2,-Z                                             
    REMARK 290                                                                      
    REMARK 290     WHERE NNN -> OPERATOR NUMBER                                     
    REMARK 290           MMM -> TRANSLATION VECTOR                                  
    REMARK 290                                                                      
    REMARK 290 CRYSTALLOGRAPHIC SYMMETRY TRANSFORMATIONS                            
    REMARK 290 THE FOLLOWING TRANSFORMATIONS OPERATE ON THE ATOM/HETATM             
    REMARK 290 RECORDS IN THIS ENTRY TO PRODUCE CRYSTALLOGRAPHICALLY                
    REMARK 290 RELATED MOLECULES.                                                   
    REMARK 290   SMTRY1   1  1.000000  0.000000  0.000000        0.00000            
    REMARK 290   SMTRY2   1  0.000000  1.000000  0.000000        0.00000            
    REMARK 290   SMTRY3   1  0.000000  0.000000  1.000000        0.00000            
    REMARK 290   SMTRY1   2 -1.000000  0.000000  0.000000        0.00000            
    REMARK 290   SMTRY2   2  0.000000  1.000000  0.000000       31.19000            
    REMARK 290   SMTRY3   2  0.000000  0.000000 -1.000000        0.00000            
    REMARK 290                                                                      
    REMARK 290 REMARK: NULL                                                         
    REMARK 300                                                                      
    REMARK 300 BIOMOLECULE: 1, 2, 3, 4                                              
    REMARK 300 SEE REMARK 350 FOR THE AUTHOR PROVIDED AND/OR PROGRAM                
    REMARK 300 GENERATED ASSEMBLY INFORMATION FOR THE STRUCTURE IN                  
    REMARK 300 THIS ENTRY. THE REMARK MAY ALSO PROVIDE INFORMATION ON               
    REMARK 300 BURIED SURFACE AREA.                                                 
    REMARK 300 REMARK: EACH OF THE THREE MONOMERS FOUND IN THE ASU REPRESENTS A     
    REMARK 300 BIOLOGICAL UNIT                                                      
    REMARK 350                                                                      
    REMARK 350 COORDINATES FOR A COMPLETE MULTIMER REPRESENTING THE KNOWN           
    REMARK 350 BIOLOGICALLY SIGNIFICANT OLIGOMERIZATION STATE OF THE                
    REMARK 350 MOLECULE CAN BE GENERATED BY APPLYING BIOMT TRANSFORMATIONS          
    REMARK 350 GIVEN BELOW.  BOTH NON-CRYSTALLOGRAPHIC AND                          
    REMARK 350 CRYSTALLOGRAPHIC OPERATIONS ARE GIVEN.                               
    REMARK 350                                                                      
    REMARK 350 BIOMOLECULE: 1                                                       
    REMARK 350 AUTHOR DETERMINED BIOLOGICAL UNIT: MONOMERIC                         
    REMARK 350 SOFTWARE DETERMINED QUATERNARY STRUCTURE: MONOMERIC                  
    REMARK 350 SOFTWARE USED: PISA                                                  
    REMARK 350 APPLY THE FOLLOWING TO CHAINS: A                                     
    REMARK 350   BIOMT1   1  1.000000  0.000000  0.000000        0.00000            
    REMARK 350   BIOMT2   1  0.000000  1.000000  0.000000        0.00000            
    REMARK 350   BIOMT3   1  0.000000  0.000000  1.000000        0.00000            
    REMARK 350                                                                      
    REMARK 350 BIOMOLECULE: 2                                                       
    REMARK 350 AUTHOR DETERMINED BIOLOGICAL UNIT: MONOMERIC                         
    REMARK 350 APPLY THE FOLLOWING TO CHAINS: B                                     
    REMARK 350   BIOMT1   1  1.000000  0.000000  0.000000        0.00000            
    REMARK 350   BIOMT2   1  0.000000  1.000000  0.000000        0.00000            
    REMARK 350   BIOMT3   1  0.000000  0.000000  1.000000        0.00000            
    REMARK 350                                                                      
    REMARK 350 BIOMOLECULE: 3                                                       
    REMARK 350 AUTHOR DETERMINED BIOLOGICAL UNIT: MONOMERIC                         
    REMARK 350 APPLY THE FOLLOWING TO CHAINS: C                                     
    REMARK 350   BIOMT1   1  1.000000  0.000000  0.000000        0.00000            
    REMARK 350   BIOMT2   1  0.000000  1.000000  0.000000        0.00000            
    REMARK 350   BIOMT3   1  0.000000  0.000000  1.000000        0.00000            
    REMARK 350                                                                      
    REMARK 350 BIOMOLECULE: 4                                                       
    REMARK 350 SOFTWARE DETERMINED QUATERNARY STRUCTURE: DIMERIC                    
    REMARK 350 SOFTWARE USED: PISA                                                  
    REMARK 350 TOTAL BURIED SURFACE AREA: 1010 ANGSTROM**2                          
    REMARK 350 SURFACE AREA OF THE COMPLEX: 11650 ANGSTROM**2                       
    REMARK 350 CHANGE IN SOLVENT FREE ENERGY: -11.0 KCAL/MOL                        
    REMARK 350 APPLY THE FOLLOWING TO CHAINS: B                                     
    REMARK 350   BIOMT1   1  1.000000  0.000000  0.000000        0.00000            
    REMARK 350   BIOMT2   1  0.000000  1.000000  0.000000        0.00000            
    REMARK 350   BIOMT3   1  0.000000  0.000000  1.000000        0.00000            
    REMARK 350 APPLY THE FOLLOWING TO CHAINS: C                                     
    REMARK 350   BIOMT1   2 -1.000000  0.000000  0.000000      -29.75132            
    REMARK 350   BIOMT2   2  0.000000  1.000000  0.000000      -31.19000            
    REMARK 350   BIOMT3   2  0.000000  0.000000 -1.000000      102.00587            
    REMARK 465                                                                      
    REMARK 465 MISSING RESIDUES                                                     
    REMARK 465 THE FOLLOWING RESIDUES WERE NOT LOCATED IN THE                       
    REMARK 465 EXPERIMENT. (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN               
    REMARK 465 IDENTIFIER; SSSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE.)                
    REMARK 465                                                                      
    REMARK 465   M RES C SSSEQI                                                     
    REMARK 465     MET A  1932                                                      
    REMARK 465     HIS A  1933                                                      
    REMARK 465     HIS A  1934                                                      
    REMARK 465     HIS A  1935                                                      
    REMARK 465     HIS A  1936                                                      
    REMARK 465     HIS A  1937                                                      
    REMARK 465     HIS A  1938                                                      
    REMARK 465     SER A  1939                                                      
    REMARK 465     SER A  1940                                                      
    REMARK 465     GLY A  1941                                                      
    REMARK 465     VAL A  1942                                                      
    REMARK 465     ASP A  1943                                                      
    REMARK 465     LEU A  1944                                                      
    REMARK 465     GLY A  1945                                                      
    REMARK 465     THR A  1946                                                      
    REMARK 465     GLU A  1947                                                      
    REMARK 465     ASN A  1948                                                      
    REMARK 465     LEU A  1949                                                      
    REMARK 465     TYR A  1950                                                      
    REMARK 465     PHE A  1951                                                      
    REMARK 465     GLN A  1952                                                      
    REMARK 465     SER A  1953                                                      
    REMARK 465     MET B  1932                                                      
    REMARK 465     HIS B  1933                                                      
    REMARK 465     HIS B  1934                                                      
    REMARK 465     HIS B  1935                                                      
    REMARK 465     HIS B  1936                                                      
    REMARK 465     HIS B  1937                                                      
    REMARK 465     HIS B  1938                                                      
    REMARK 465     SER B  1939                                                      
    REMARK 465     SER B  1940                                                      
    REMARK 465     GLY B  1941                                                      
    REMARK 465     VAL B  1942                                                      
    REMARK 465     ASP B  1943                                                      
    REMARK 465     LEU B  1944                                                      
    REMARK 465     GLY B  1945                                                      
    REMARK 465     THR B  1946                                                      
    REMARK 465     GLU B  1947                                                      
    REMARK 465     ASN B  1948                                                      
    REMARK 465     MET C  1932                                                      
    REMARK 465     HIS C  1933                                                      
    REMARK 465     HIS C  1934                                                      
    REMARK 465     HIS C  1935                                                      
    REMARK 465     HIS C  1936                                                      
    REMARK 465     HIS C  1937                                                      
    REMARK 465     HIS C  1938                                                      
    REMARK 465     SER C  1939                                                      
    REMARK 465     SER C  1940                                                      
    REMARK 465     GLY C  1941                                                      
    REMARK 465     VAL C  1942                                                      
    REMARK 465     ASP C  1943                                                      
    REMARK 465     LEU C  1944                                                      
    REMARK 470                                                                      
    REMARK 470 MISSING ATOM                                                         
    REMARK 470 THE FOLLOWING RESIDUES HAVE MISSING ATOMS(M=MODEL NUMBER;            
    REMARK 470 RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN IDENTIFIER; SSEQ=SEQUENCE NUMBER;          
    REMARK 470 I=INSERTION CODE):                                                   
    REMARK 470   M RES CSSEQI  ATOMS                                                
    REMARK 470     MET A1954    CG   SD   CE                                        
    REMARK 470     LYS A1994    CG   CD   CE   NZ                                   
    REMARK 470     LYS A2033    CG   CD   CE   NZ                                   
    REMARK 470     LEU B1949    CG   CD1  CD2                                       
    REMARK 470     TYR B1950    CG   CD1  CD2  CE1  CE2  CZ   OH                    
    REMARK 470     TYR B1977    CG   CD1  CD2  CE1  CE2  CZ   OH                    
    REMARK 470     HIS B1981    CG   ND1  CD2  CE1  NE2                             
    REMARK 470     LYS B1994    CG   CD   CE   NZ                                   
    REMARK 470     LYS B2033    CG   CD   CE   NZ                                   
    REMARK 470     GLU C1963    CD   OE1  OE2                                       
    REMARK 470     LYS C1994    CG   CD   CE   NZ                                   
    REMARK 470     GLU C1999    CD   OE1  OE2                                       
    REMARK 470     GLU C2023    CD   OE1  OE2                                       
    REMARK 470     LYS C2033    CD   CE   NZ                                        
    REMARK 500                                                                      
    REMARK 500 GEOMETRY AND STEREOCHEMISTRY                                         
    REMARK 500 SUBTOPIC: COVALENT BOND ANGLES                                       
    REMARK 500                                                                      
    REMARK 500 THE STEREOCHEMICAL PARAMETERS OF THE FOLLOWING RESIDUES              
    REMARK 500 HAVE VALUES WHICH DEVIATE FROM EXPECTED VALUES BY MORE               
    REMARK 500 THAN 6*RMSD (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN               
    REMARK 500 IDENTIFIER; SSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE).                 
    REMARK 500                                                                      
    REMARK 500 STANDARD TABLE:                                                      
    REMARK 500 FORMAT: (10X,I3,1X,A3,1X,A1,I4,A1,3(1X,A4,2X),12X,F5.1)              
    REMARK 500                                                                      
    REMARK 500 EXPECTED VALUES PROTEIN: ENGH AND HUBER, 1999                        
    REMARK 500 EXPECTED VALUES NUCLEIC ACID: CLOWNEY ET AL 1996                     
    REMARK 500                                                                      
    REMARK 500  M RES CSSEQI ATM1   ATM2   ATM3                                     
    REMARK 500    PHE B1951   CB  -  CG  -  CD2 ANGL. DEV. =  -5.2 DEGREES          
    REMARK 500    PHE B1951   CB  -  CG  -  CD1 ANGL. DEV. =   4.8 DEGREES          
    REMARK 500                                                                      
    REMARK 500 REMARK: NULL                                                         
    REMARK 500                                                                      
    REMARK 500 GEOMETRY AND STEREOCHEMISTRY                                         
    REMARK 500 SUBTOPIC: TORSION ANGLES                                             
    REMARK 500                                                                      
    REMARK 500 TORSION ANGLES OUTSIDE THE EXPECTED RAMACHANDRAN REGIONS:            
    REMARK 500 (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN IDENTIFIER;               
    REMARK 500 SSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE).                             
    REMARK 500                                                                      
    REMARK 500 STANDARD TABLE:                                                      
    REMARK 500 FORMAT:(10X,I3,1X,A3,1X,A1,I4,A1,4X,F7.2,3X,F7.2)                    
    REMARK 500                                                                      
    REMARK 500 EXPECTED VALUES: GJ KLEYWEGT AND TA JONES (1996). PHI/PSI-           
    REMARK 500 CHOLOGY: RAMACHANDRAN REVISITED. STRUCTURE 4, 1395 - 1400            
    REMARK 500                                                                      
    REMARK 500  M RES CSSEQI        PSI       PHI                                   
    REMARK 500    PRO A1985     -178.80    -66.30                                   
    REMARK 500    LYS A1994       -5.74     76.29                                   
    REMARK 500    LYS B1989      -65.88    -98.08                                   
    REMARK 500    LYS B1994      -12.26     77.57                                   
    REMARK 500    THR C1946       46.94    -81.39                                   
    REMARK 500    ASP C1967       41.32    -96.91                                   
    REMARK 500    LYS C1989      -64.66    -97.72                                   
    REMARK 500    LYS C1994       -8.24     78.04                                   
    REMARK 500                                                                      
    REMARK 500 REMARK: NULL                                                         
    REMARK 500                                                                      
    REMARK 500 GEOMETRY AND STEREOCHEMISTRY                                         
    REMARK 500 SUBTOPIC: NON-CIS, NON-TRANS                                         
    REMARK 500                                                                      
    REMARK 500 THE FOLLOWING PEPTIDE BONDS DEVIATE SIGNIFICANTLY FROM BOTH          
    REMARK 500 CIS AND TRANS CONFORMATION.  CIS BONDS, IF ANY, ARE LISTED           
    REMARK 500 ON CISPEP RECORDS.  TRANS IS DEFINED AS 180 +/- 30 AND               
    REMARK 500 CIS IS DEFINED AS 0 +/- 30 DEGREES.                                  
    REMARK 500                                 MODEL     OMEGA                      
    REMARK 500 THR C 1946     GLU C 1947                  133.21                    
    REMARK 500                                                                      
    REMARK 500 REMARK: NULL                                                         
    DBREF  2FNE A 1954  2042  UNP    Q5VZ62   MPDZ_HUMAN       1     89             
    DBREF  2FNE B 1954  2042  UNP    Q5VZ62   MPDZ_HUMAN       1     89             
    DBREF  2FNE C 1954  2042  UNP    Q5VZ62   MPDZ_HUMAN       1     89             
    SEQADV 2FNE MET A 1932  UNP  Q5VZ62              EXPRESSION TAG                 
    SEQADV 2FNE HIS A 1933  UNP  Q5VZ62              EXPRESSION TAG                 
    SEQADV 2FNE HIS A 1934  UNP  Q5VZ62              EXPRESSION TAG                 
    SEQADV 2FNE HIS A 1935  UNP  Q5VZ62              EXPRESSION TAG                 
    SEQADV 2FNE HIS A 1936  UNP  Q5VZ62              EXPRESSION TAG                 
    SEQADV 2FNE HIS A 1937  UNP  Q5VZ62              EXPRESSION TAG                 
    SEQADV 2FNE HIS A 1938  UNP  Q5VZ62              EXPRESSION TAG                 
    SEQADV 2FNE SER A 1939  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE SER A 1940  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE GLY A 1941  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE VAL A 1942  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE ASP A 1943  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE LEU A 1944  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE GLY A 1945  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE THR A 1946  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE GLU A 1947  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE ASN A 1948  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE LEU A 1949  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE TYR A 1950  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE PHE A 1951  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE GLN A 1952  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE SER A 1953  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE SER A 2043  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE ASP A 2044  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE GLU A 2045  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE THR A 2046  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE SER A 2047  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE VAL A 2048  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE MET B 1932  UNP  Q5VZ62              EXPRESSION TAG                 
    SEQADV 2FNE HIS B 1933  UNP  Q5VZ62              EXPRESSION TAG                 
    SEQADV 2FNE HIS B 1934  UNP  Q5VZ62              EXPRESSION TAG                 
    SEQADV 2FNE HIS B 1935  UNP  Q5VZ62              EXPRESSION TAG                 
    SEQADV 2FNE HIS B 1936  UNP  Q5VZ62              EXPRESSION TAG                 
    SEQADV 2FNE HIS B 1937  UNP  Q5VZ62              EXPRESSION TAG                 
    SEQADV 2FNE HIS B 1938  UNP  Q5VZ62              EXPRESSION TAG                 
    SEQADV 2FNE SER B 1939  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE SER B 1940  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE GLY B 1941  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE VAL B 1942  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE ASP B 1943  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE LEU B 1944  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE GLY B 1945  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE THR B 1946  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE GLU B 1947  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE ASN B 1948  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE LEU B 1949  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE TYR B 1950  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE PHE B 1951  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE GLN B 1952  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE SER B 1953  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE SER B 2043  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE ASP B 2044  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE GLU B 2045  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE THR B 2046  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE SER B 2047  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE VAL B 2048  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE MET C 1932  UNP  Q5VZ62              EXPRESSION TAG                 
    SEQADV 2FNE HIS C 1933  UNP  Q5VZ62              EXPRESSION TAG                 
    SEQADV 2FNE HIS C 1934  UNP  Q5VZ62              EXPRESSION TAG                 
    SEQADV 2FNE HIS C 1935  UNP  Q5VZ62              EXPRESSION TAG                 
    SEQADV 2FNE HIS C 1936  UNP  Q5VZ62              EXPRESSION TAG                 
    SEQADV 2FNE HIS C 1937  UNP  Q5VZ62              EXPRESSION TAG                 
    SEQADV 2FNE HIS C 1938  UNP  Q5VZ62              EXPRESSION TAG                 
    SEQADV 2FNE SER C 1939  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE SER C 1940  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE GLY C 1941  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE VAL C 1942  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE ASP C 1943  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE LEU C 1944  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE GLY C 1945  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE THR C 1946  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE GLU C 1947  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE ASN C 1948  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE LEU C 1949  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE TYR C 1950  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE PHE C 1951  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE GLN C 1952  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE SER C 1953  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE SER C 2043  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE ASP C 2044  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE GLU C 2045  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE THR C 2046  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE SER C 2047  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQADV 2FNE VAL C 2048  UNP  Q5VZ62              CLONING ARTIFACT               
    SEQRES   1 A  117  MET HIS HIS HIS HIS HIS HIS SER SER GLY VAL ASP LEU          
    SEQRES   2 A  117  GLY THR GLU ASN LEU TYR PHE GLN SER MET PRO GLN CYS          
    SEQRES   3 A  117  LYS SER ILE THR LEU GLU ARG GLY PRO ASP GLY LEU GLY          
    SEQRES   4 A  117  PHE SER ILE VAL GLY GLY TYR GLY SER PRO HIS GLY ASP          
    SEQRES   5 A  117  LEU PRO ILE TYR VAL LYS THR VAL PHE ALA LYS GLY ALA          
    SEQRES   6 A  117  ALA SER GLU ASP GLY ARG LEU LYS ARG GLY ASP GLN ILE          
    SEQRES   7 A  117  ILE ALA VAL ASN GLY GLN SER LEU GLU GLY VAL THR HIS          
    SEQRES   8 A  117  GLU GLU ALA VAL ALA ILE LEU LYS ARG THR LYS GLY THR          
    SEQRES   9 A  117  VAL THR LEU MET VAL LEU SER SER ASP GLU THR SER VAL          
    SEQRES   1 B  117  MET HIS HIS HIS HIS HIS HIS SER SER GLY VAL ASP LEU          
    SEQRES   2 B  117  GLY THR GLU ASN LEU TYR PHE GLN SER MET PRO GLN CYS          
    SEQRES   3 B  117  LYS SER ILE THR LEU GLU ARG GLY PRO ASP GLY LEU GLY          
    SEQRES   4 B  117  PHE SER ILE VAL GLY GLY TYR GLY SER PRO HIS GLY ASP          
    SEQRES   5 B  117  LEU PRO ILE TYR VAL LYS THR VAL PHE ALA LYS GLY ALA          
    SEQRES   6 B  117  ALA SER GLU ASP GLY ARG LEU LYS ARG GLY ASP GLN ILE          
    SEQRES   7 B  117  ILE ALA VAL ASN GLY GLN SER LEU GLU GLY VAL THR HIS          
    SEQRES   8 B  117  GLU GLU ALA VAL ALA ILE LEU LYS ARG THR LYS GLY THR          
    SEQRES   9 B  117  VAL THR LEU MET VAL LEU SER SER ASP GLU THR SER VAL          
    SEQRES   1 C  117  MET HIS HIS HIS HIS HIS HIS SER SER GLY VAL ASP LEU          
    SEQRES   2 C  117  GLY THR GLU ASN LEU TYR PHE GLN SER MET PRO GLN CYS          
    SEQRES   3 C  117  LYS SER ILE THR LEU GLU ARG GLY PRO ASP GLY LEU GLY          
    SEQRES   4 C  117  PHE SER ILE VAL GLY GLY TYR GLY SER PRO HIS GLY ASP          
    SEQRES   5 C  117  LEU PRO ILE TYR VAL LYS THR VAL PHE ALA LYS GLY ALA          
    SEQRES   6 C  117  ALA SER GLU ASP GLY ARG LEU LYS ARG GLY ASP GLN ILE          
    SEQRES   7 C  117  ILE ALA VAL ASN GLY GLN SER LEU GLU GLY VAL THR HIS          
    SEQRES   8 C  117  GLU GLU ALA VAL ALA ILE LEU LYS ARG THR LYS GLY THR          
    SEQRES   9 C  117  VAL THR LEU MET VAL LEU SER SER ASP GLU THR SER VAL          
    FORMUL   4  HOH   *199(H2 O)                                                    
    HELIX    1   1 GLY A 1995  GLY A 2001  1                                   7    
    HELIX    2   2 THR A 2021  THR A 2032  1                                  12    
    HELIX    3   3 GLY B 1995  GLY B 2001  1                                   7    
    HELIX    4   4 THR B 2021  THR B 2032  1                                  12    
    HELIX    5   5 GLU C 1947  GLN C 1952  5                                   6    
    HELIX    6   6 GLY C 1995  GLY C 2001  1                                   7    
    HELIX    7   7 THR C 2021  ARG C 2031  1                                  11    
    SHEET    1   A 4 GLN A1956  LEU A1962  0                                        
    SHEET    2   A 4 VAL A2036  SER A2042 -1  O  LEU A2038   N  ILE A1960           
    SHEET    3   A 4 GLN A2008  VAL A2012 -1  N  ILE A2010   O  MET A2039           
    SHEET    4   A 4 GLN A2015  SER A2016 -1  O  GLN A2015   N  VAL A2012           
    SHEET    1   B 2 PHE A1971  SER A1979  0                                        
    SHEET    2   B 2 GLY A1982  VAL A1991 -1  O  LYS A1989   N  SER A1972           
    SHEET    1   C 3 THR A2046  VAL A2048  0                                        
    SHEET    2   C 3 PHE B1971  GLY B1976 -1  O  PHE B1971   N  VAL A2048           
    SHEET    3   C 3 LEU B1984  VAL B1991 -1  O  LYS B1989   N  SER B1972           
    SHEET    1   D 4 PRO B1955  LEU B1962  0                                        
    SHEET    2   D 4 VAL B2036  SER B2043 -1  O  VAL B2036   N  LEU B1962           
    SHEET    3   D 4 GLN B2008  VAL B2012 -1  N  GLN B2008   O  LEU B2041           
    SHEET    4   D 4 GLN B2015  SER B2016 -1  O  GLN B2015   N  VAL B2012           
    SHEET    1   E 3 THR B2046  VAL B2048  0                                        
    SHEET    2   E 3 PHE C1971  GLY C1975 -1  O  PHE C1971   N  VAL B2048           
    SHEET    3   E 3 ILE C1986  VAL C1991 -1  O  LYS C1989   N  SER C1972           
    SHEET    1   F 4 GLN C1956  GLU C1963  0                                        
    SHEET    2   F 4 THR C2035  SER C2042 -1  O  VAL C2036   N  LEU C1962           
    SHEET    3   F 4 GLN C2008  VAL C2012 -1  N  GLN C2008   O  LEU C2041           
    SHEET    4   F 4 GLN C2015  SER C2016 -1  O  GLN C2015   N  VAL C2012           
    CRYST1   47.943   62.380   53.128  90.00 106.26  90.00 P 1 21 1      6          
    ORIGX1      1.000000  0.000000  0.000000        0.00000                         
    ORIGX2      0.000000  1.000000  0.000000        0.00000                         
    ORIGX3      0.000000  0.000000  1.000000        0.00000                         
    SCALE1      0.020858  0.000000  0.006083        0.00000                         
    SCALE2      0.000000  0.016031  0.000000        0.00000                         
    SCALE3      0.000000  0.000000  0.019607        0.00000                         

    3D molecular view of vibration

    Displacement vectors
    Display
    Animation
    Display

    Still image of displacement vectors and GIF animation


    Mode 1

    Time-average properties and properties of the 10 lowest-frequency modes

    Fluctuation of atoms:
    Time average and for the 3 lowest-frequency modes.
    Fluctuation of dihedral angles:
    Time average and for the 3 lowest-frequency modes.
    Fluctuation of atomsFluctuation of dihedral angles

    Correlations between fluctuations of atoms

    Mode 1
    Correlations between fluctuations of atoms - Mode 1
    Time Average
    Time Average
    Distance map
    Distance map

    Calculation note

    PDB file name : pdb2fne.ent

    Chains and HETATMs selected: 
      ATOM        A

    = Normal mode analysis calculation =

    No. of modes used in the calculation : All modes.

    Parameters of potential energies:
      1-4 and 1-5 non-bonded interactions: E(d) = A*exp(-d(PDB)**2/B**2)(d-d(PDB))**2.
      Loop-closing potential:              E(d) = A*(d-d(PDB))**2.
        for a disulfide bond and one of the bonds in the DNA and RNA sugar ring.
      where d and d(PDB) are distances between atoms in calculation and in PDB data, 
      respectively.

      Interaction type   A       B      Cutoff distance (A)
        1-4             1.00    5.00      100.00
        1-5             1.00    5.00      100.00
        Loop-closing  100.00

    Temperature adjustment by magnitude of fluctuation:
      Set to mean displacements of atoms       0.500 A

    Animation
      No. of frames: 11
      Mean displacements (A):    0.50

    Displacement vector
      Mean length of vectors (A):    3.00