2GUB

Crystal Structure of Metal Free D-Xylose Isomerase.

2GUB の概要

関連するPDBエントリー1XIB 2GLK
分子名称Xylose isomerase (2 entities in total)
機能のキーワードtim barrel, beta-alpha-barrel, metal-free, inactive enzyme, sugar interconversion, isomerase
由来する生物種Streptomyces rubiginosus
細胞内の位置Cytoplasm P24300
ポリマー鎖数1
分子量合計43283.3
構造登録者
Carrell, H.L.,Katz, A.K.,Glusker, J.P. (登録日: 2006-04-29, 公開日: 2006-05-16, 最終更新日: 2011-07-13)
主引用文献
Katz, A.K.,Li, X.,Carrell, H.L.,Hanson, B.L.,Langan, P.,Coates, L.,Schoenborn, B.P.,Glusker, J.P.,Bunick, G.J.
Locating active-site hydrogen atoms in D-xylose isomerase: Time-of-flight neutron diffraction.
Proc.Natl.Acad.Sci.Usa, 103:8342-8347, 2006
PubMed: 16707576 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1073/pnas.0602598103
MImport into Mendeley
実験手法
X-RAY DIFFRACTION (1.8 Å)
?

構造検証レポート

RfreeClashscoreRamachandran outliersSidechain outliersRSRZ outliers0.18140.3%2.6%1.3%MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
検証レポート(詳細版)をダウンロード

他の静止画像(非対称単位)

Molmil generated image of 2gub
回転なし
Molmil generated image of 2gub
x軸(左右方向)周りに90°回転
Molmil generated image of 2gub
y軸(上下方向)周りに90°回転

他の静止画像(生物学的単位)

Molmil generated image of 2gub
回転なし
Molmil generated image of 2gub
x軸(左右方向)周りに90°回転
Molmil generated image of 2gub
y軸(上下方向)周りに90°回転
(*)表面構造(coarse surface)で表現されている場合、非対称単位は、赤色のリボンモデルで表示されています。
生物学的単位の座標ファイル (2gub.pdb1.gz [270.46 KB])