6B09
Crystal structure of HsNUDT16 in complex with diADPR (soaked)
エンティティ
Entity ID | 鎖名 | 説明 | 種類 | 鎖長 | 化学式量 | 分子数 | データベース名(アクセス番号) | 由来する生物種 | エンティティの一般名 |
1 | A, B | U8 snoRNA-decapping enzyme | polymer | 195 | 21330.4 | 2 | UniProt (Q96DE0) Pfam (PF00293) In PDB | Homo sapiens (Human) | IDP phosphatase,IDPase,Inosine diphosphate phosphatase,Nucleoside diphosphate-linked moiety X motif 16,Nudix motif 16,Nudix hydrolase 16,U8 snoRNA-binding protein H29K,m7GpppN-mRNA hydrolase |
2 | A, B | [(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S})-5-[[[[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{S})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxymethyl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]oxy-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate | non-polymer | 968.5 | 2 | Chemie (C7G) | |||
3 | A, B | MAGNESIUM ION | non-polymer | 24.3 | 4 | Chemie (MG) | |||
4 | A | CHLORIDE ION | non-polymer | 35.5 | 1 | Chemie (CL) | |||
5 | A, B | SODIUM ION | non-polymer | 23.0 | 2 | Chemie (NA) | |||
6 | water | water | 18.0 | 3 | Chemie (HOH) |
配列変更
A, B: 1 - 195 (UniProt: Q96DE0)
PDB | 外部データベース | 詳細 |
---|---|---|
Val 22 | Ala 22 | engineered mutation |
配列ビューア
非対称単位の内容
タンパク質・ 核酸鎖 | 鎖の数 | 2 |
化学式量合計 | 42660.8 | |
タンパク質・ 核酸・ 糖鎖以外* | 分子数 | 9 |
化学式量合計 | 2115.7 | |
全て* | 化学式量合計 | 44776.5 |