5Z3V
Structure of Snf2-nucleosome complex at shl-2 in ADP BeFx state
エンティティ
Entity ID | 鎖名 | 説明 | 種類 | 鎖長 | 化学式量 | 分子数 | データベース名(アクセス番号) | 由来する生物種 | エンティティの一般名 |
1 | O | Transcription regulatory protein SNF2 | polymer | 735 | 85802.8 | 1 | UniProt (P22082) Pfam (PF00176) Pfam (PF00271) Pfam (PF14619) In PDB | Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) | ATP-dependent helicase SNF2,Regulatory protein GAM1,Regulatory protein SWI2,SWI/SNF complex component SNF2,Transcription factor TYE3 |
2 | A, E | Histone H3.2 | polymer | 135 | 15303.9 | 2 | UniProt (P84233) Pfam (PF00125) In PDB | Xenopus laevis (African clawed frog) | |
3 | B, F | Histone H4 | polymer | 102 | 11263.2 | 2 | UniProt (P62799) Pfam (PF15511) In PDB | Xenopus laevis (African clawed frog) | |
4 | C, G | Histone H2A | polymer | 129 | 13978.2 | 2 | UniProt (Q6AZJ8) Pfam (PF00125) Pfam (PF16211) In PDB | Xenopus laevis (African clawed frog) | |
5 | D, H | Histone H2B 1.1 | polymer | 122 | 13524.8 | 2 | UniProt (P02281) Pfam (PF00125) In PDB | Xenopus laevis (African clawed frog) | H2B1.1 |
6 | I | DNA (167-MER) | polymer | 167 | 51381.8 | 1 | synthetic construct | ||
7 | J | DNA (167-MER) | polymer | 167 | 51723.9 | 1 | synthetic construct | ||
8 | O | ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE | non-polymer | 427.2 | 1 | Chemie (ADP) | |||
9 | O | BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION | non-polymer | 66.0 | 1 | Chemie (BEF) | |||
10 | O | MAGNESIUM ION | non-polymer | 24.3 | 1 | Chemie (MG) |
配列変更
A, E: 1 - 135 (UniProt: P84233)
D, H: 1 - 122 (UniProt: P02281)
PDB | 外部データベース | 詳細 |
---|---|---|
Ala 102 | Gly 103 | conflict |
PDB | 外部データベース | 詳細 |
---|---|---|
Thr 29 | Ser 33 | see sequence details |
配列ビューア
非対称単位の内容
タンパク質・ 核酸鎖 | 鎖の数 | 11 |
化学式量合計 | 297048.8 | |
タンパク質・ 核酸・ 糖鎖以外* | 分子数 | 3 |
化学式量合計 | 517.5 | |
全て* | 化学式量合計 | 297566.3 |