5FW2
Crystal structure of SpCas9 variant EQR bound to sgRNA and TGAG PAM target DNA
エンティティ
| Entity ID | 鎖名 | 説明 | 種類 | 鎖長 | 化学式量 | 分子数 | データベース名(アクセス番号) | 由来する生物種 | エンティティの一般名 |
| 1 | A | SGRNA | polymer | 83 | 26789.0 | 1 | SYNTHETIC CONSTRUCT | ||
| 2 | B | CRISPR-ASSOCIATED ENDONUCLEASE CAS9/CSN1 | polymer | 1372 | 158916.1 | 1 | UniProt (Q99ZW2) Pfam (PF16593) Pfam (PF16592) Pfam (PF13395) Pfam (PF16595) In PDB | STREPTOCOCCUS PYOGENES | CAS9 EQR VARIANT, SPCAS9 |
| 3 | C | TARGET DNA STRAND | polymer | 28 | 8543.5 | 1 | SYNTHETIC CONSTRUCT | ||
| 4 | D | NON-TARGET DNA STRAND | polymer | 12 | 3734.5 | 1 | SYNTHETIC CONSTRUCT | ||
| 5 | A | MAGNESIUM ION | non-polymer | 24.3 | 2 | Chemie (MG) | |||
| 6 | A, B | POTASSIUM ION | non-polymer | 39.1 | 10 | Chemie (K) | |||
| 7 | water | water | 18.0 | 204 | Chemie (HOH) |
配列変更
B: 1 - 1368 (UniProt: Q99ZW2)
| PDB | 外部データベース | 詳細 |
|---|---|---|
| Gly -3 | - | expression tag |
| Ala -2 | - | expression tag |
| Ala -1 | - | expression tag |
| Ser 0 | - | expression tag |
| Ala 10 | Asp 10 | engineered mutation |
| Ala 840 | His 840 | engineered mutation |
| Glu 1135 | Asp 1135 | engineered mutation |
| Gln 1335 | Arg 1335 | engineered mutation |
| Arg 1337 | Thr 1337 | engineered mutation |
配列ビューア
非対称単位の内容
| タンパク質・ 核酸鎖 | 鎖の数 | 4 |
| 化学式量合計 | 197983.1 | |
| タンパク質・ 核酸・ 糖鎖以外* | 分子数 | 12 |
| 化学式量合計 | 439.6 | |
| 全て* | 化学式量合計 | 198422.7 |
