4G0R
Structural characterization of H-1 Parvovirus: comparison of infectious virions to replication defective particles
エンティティ
| Entity ID | 鎖名 | 説明 | 種類 | 鎖長 | 化学式量 | 分子数 | データベース名(アクセス番号) | 由来する生物種 | エンティティの一般名 |
| 1 | A | Capsid protein VP1 | polymer | 735 | 81341.2 | 1 | UniProt (P03136) Pfam (PF08398) Pfam (PF00740) In PDB | H-1 parvovirus | Coat protein VP1 |
| 2 | C | DNA (5'-D(P*CP*TP*GP*AP*CP*TP*TP*CP*AP*A)-3') | polymer | 10 | 3004.0 | 1 | H-1 PARVOVIRUS | ||
| 3 | A | 1,2-ETHANEDIOL | non-polymer | 62.1 | 4 | Chemie (EDO) | |||
| 4 | A | 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE | non-polymer | 307.2 | 1 | Chemie (DC) | |||
| 5 | A | SODIUM ION | non-polymer | 23.0 | 2 | Chemie (NA) | |||
| 6 | A | CHLORIDE ION | non-polymer | 35.5 | 1 | Chemie (CL) | |||
| 7 | C | MAGNESIUM ION | non-polymer | 24.3 | 2 | Chemie (MG) | |||
| 8 | water | water | 18.0 | 131 | Chemie (HOH) |
配列変更
A: -141 - 593 (UniProt: P03136)
| PDB | 外部データベース | 詳細 |
|---|---|---|
| Asp 104 | - | SEE REMARK 999 |
| Gly 295 | Ala 436 | SEE REMARK 999 |
| Met 296 | Cys 437 | SEE REMARK 999 |
| Pro 297 | Leu 438 | SEE REMARK 999 |
| Pro 298 | Gln 439 | SEE REMARK 999 |
| Arg 299 | Gly 440 | SEE REMARK 999 |
| Arg 506 | His 647 | SEE REMARK 999 |
配列ビューア
非対称単位の内容
| タンパク質・ 核酸鎖 | 鎖の数 | 2 |
| 化学式量合計 | 84345.2 | |
| タンパク質・ 核酸・ 糖鎖以外* | 分子数 | 10 |
| 化学式量合計 | 685.5 | |
| 全て* | 化学式量合計 | 85030.7 |
