3FBC
Crystal structure of the Mimivirus NDK N62L-R107G double mutant complexed with dTDP
エンティティ
Entity ID | 鎖名 | 説明 | 種類 | 鎖長 | 化学式量 | 分子数 | データベース名(アクセス番号) | 由来する生物種 | エンティティの一般名 |
1 | A, B, C, D, E... | Nucleoside diphosphate kinase | polymer | 142 | 16200.4 | 6 | UniProt (Q5UQL3) Pfam (PF00334) In PDB | Acanthamoeba polyphaga mimivirus | NDP kinase, NDK |
2 | A, B, C, D, E... | MAGNESIUM ION | non-polymer | 24.3 | 6 | Chemie (MG) | |||
3 | A, B, C, D, E... | THYMIDINE-5'-DIPHOSPHATE | non-polymer | 402.2 | 6 | Chemie (TYD) | |||
4 | A, B, C, D, E... | PHOSPHATE ION | non-polymer | 95.0 | 6 | Chemie (PO4) | |||
5 | water | water | 18.0 | 107 | Chemie (HOH) |
配列変更
A, B, C, D, E, F: 2 - 137 (UniProt: Q5UQL3)
PDB | 外部データベース | 詳細 |
---|---|---|
Tyr -4 | - | expression tag |
Lys -3 | - | expression tag |
Lys -2 | - | expression tag |
Ala -1 | - | expression tag |
Gly 0 | - | expression tag |
Leu 1 | - | expression tag |
Leu 62 | Asn 62 | engineered mutation |
Gly 107 | Arg 107 | engineered mutation |
配列ビューア
非対称単位の内容
タンパク質・ 核酸鎖 | 鎖の数 | 6 |
化学式量合計 | 97202.4 | |
タンパク質・ 核酸・ 糖鎖以外* | 分子数 | 18 |
化学式量合計 | 3128.8 | |
全て* | 化学式量合計 | 100331.2 |