6NJI
Crystal Structure of the PDE4D Catalytic Domain and UCR2 Regulatory Helix with T-49
GO（遺伝子オントロジー）由来の情報
| 鎖名 | GO（遺伝子オントロジー）id | 名前空間 | 内容 |
| A | 0004114 | molecular_function | 3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity |
| A | 0007165 | biological_process | signal transduction |
| A | 0008081 | molecular_function | phosphoric diester hydrolase activity |
| B | 0004114 | molecular_function | 3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity |
| B | 0007165 | biological_process | signal transduction |
| B | 0008081 | molecular_function | phosphoric diester hydrolase activity |
PDBデータベースに由来する情報
| site_id | AC1 |
| 残基数 | 7 |
| 詳細 | binding site for residue ZN A 700 |
| 鎖名 | 残基 |
| A | HIS330 |
| A | HIS366 |
| A | ASP367 |
| A | ASP484 |
| A | MG701 |
| A | HOH805 |
| A | HOH822 |
| site_id | AC2 |
| 残基数 | 7 |
| 詳細 | binding site for residue MG A 701 |
| 鎖名 | 残基 |
| A | HOH802 |
| A | HOH805 |
| A | HOH830 |
| A | HOH842 |
| A | HOH846 |
| A | ASP367 |
| A | ZN700 |
| site_id | AC3 |
| 残基数 | 7 |
| 詳細 | binding site for residue KR4 A 702 |
| 鎖名 | 残基 |
| A | ASN487 |
| A | THR499 |
| A | GLN535 |
| A | PHE538 |
| A | PHE599 |
| A | HOH807 |
| A | HOH820 |
| site_id | AC4 |
| 残基数 | 6 |
| 詳細 | binding site for residue ZN B 700 |
| 鎖名 | 残基 |
| B | HIS330 |
| B | HIS366 |
| B | ASP367 |
| B | ASP484 |
| B | HOH805 |
| B | HOH810 |
| site_id | AC5 |
| 残基数 | 6 |
| 詳細 | binding site for residue MG B 701 |
| 鎖名 | 残基 |
| B | ASP367 |
| B | HOH805 |
| B | HOH807 |
| B | HOH813 |
| B | HOH816 |
| B | HOH822 |
| site_id | AC6 |
| 残基数 | 7 |
| 詳細 | binding site for residue KR4 B 702 |
| 鎖名 | 残基 |
| B | ASN487 |
| B | THR499 |
| B | GLN535 |
| B | PHE538 |
| B | PHE599 |
| B | HOH804 |
| B | HOH812 |
UniProtにおけるモチーフ・データベースPROSITEからの機能情報
| site_id | PS00126 |
| 残基数 | 12 |
| 詳細 | PDEASE_I_1 3'5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase domain signature. HDVdHpGvsNqF |
| 鎖名 | 残基 | 詳細 |
| A | HIS366-PHE377 |
SwissProt/UniProtに記載されている蛋白質分子機能情報
| site_id | SWS_FT_FI1 |
| 残基数 | 2 |
| 詳細 | ACT_SITE: Proton donor => ECO:0000250|UniProtKB:Q07343 |
| 鎖名 | 残基 | 詳細 |
| A | LEU387 | |
| B | LEU387 |
| site_id | SWS_FT_FI2 |
| 残基数 | 4 |
| 詳細 | BINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:14609333, ECO:0000269|PubMed:15260978, ECO:0007744|PDB:1PTW, ECO:0007744|PDB:1TB7 |
| 鎖名 | 残基 | 詳細 |
| A | LEU387 | |
| A | GLU548 | |
| B | LEU387 | |
| B | GLU548 |
| site_id | SWS_FT_FI3 |
| 残基数 | 2 |
| 詳細 | BINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:14609333, ECO:0000269|PubMed:15260978, ECO:0000269|PubMed:15576036, ECO:0000269|PubMed:17582435, ECO:0007744|PDB:1PTW, ECO:0007744|PDB:1TB7, ECO:0007744|PDB:1TBB, ECO:0007744|PDB:1XOM, ECO:0007744|PDB:1XON, ECO:0007744|PDB:1XOQ, ECO:0007744|PDB:2PW3 |
| 鎖名 | 残基 | 詳細 |
| A | ASP391 | |
| B | ASP391 |
| site_id | SWS_FT_FI4 |
| 残基数 | 4 |
| 詳細 | BINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:14609333, ECO:0000269|PubMed:15260978, ECO:0000269|PubMed:15576036, ECO:0000269|PubMed:17582435, ECO:0007744|PDB:1PTW, ECO:0007744|PDB:1TB7, ECO:0007744|PDB:1TBB, ECO:0007744|PDB:1XOM, ECO:0007744|PDB:1XON, ECO:0007744|PDB:1XOQ, ECO:0007744|PDB:1XOR, ECO:0007744|PDB:2PW3 |
| 鎖名 | 残基 | 詳細 |
| A | ARG427 | |
| A | PRO545 | |
| B | ARG427 | |
| B | PRO545 |
| site_id | SWS_FT_FI5 |
| 残基数 | 2 |
| 詳細 | BINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:14609333, ECO:0007744|PDB:1PTW |
| 鎖名 | 残基 | 詳細 |
| A | LYS428 | |
| B | LYS428 |
| site_id | SWS_FT_FI6 |
| 残基数 | 4 |
| 詳細 | MOD_RES: Phosphoserine => ECO:0007744|PubMed:23186163 |
| 鎖名 | 残基 | 詳細 |
| A | PHE273 | |
| A | THR300 | |
| B | PHE273 | |
| B | THR300 |
| site_id | SWS_FT_FI7 |
| 残基数 | 4 |
| 詳細 | CROSSLNK: Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in SUMO) |
| 鎖名 | 残基 | 詳細 |
| A | LEU312 | |
| B | LEU312 |
