6K1E
Crystal structure of EXD2 exonuclease domain soaked in Mg and GMP
GO(遺伝子オントロジー)由来の情報
鎖名 | GO(遺伝子オントロジー)id | 名前空間 | 内容 |
A | 0003676 | molecular_function | nucleic acid binding |
A | 0006139 | biological_process | nucleobase-containing compound metabolic process |
A | 0008408 | molecular_function | 3'-5' exonuclease activity |
B | 0003676 | molecular_function | nucleic acid binding |
B | 0006139 | biological_process | nucleobase-containing compound metabolic process |
B | 0008408 | molecular_function | 3'-5' exonuclease activity |
PDBデータベースに由来する情報
site_id | AC1 |
残基数 | 7 |
詳細 | binding site for residue MG A 301 |
鎖名 | 残基 |
A | ASP108 |
A | HOH401 |
A | HOH402 |
A | HOH403 |
A | HOH405 |
A | HOH406 |
A | HOH409 |
site_id | AC2 |
残基数 | 6 |
詳細 | binding site for residue MG A 302 |
鎖名 | 残基 |
A | HOH403 |
A | HOH405 |
B | TYR242 |
B | ASP246 |
A | ASP108 |
A | GLU110 |
site_id | AC3 |
残基数 | 6 |
詳細 | binding site for residue MG B 301 |
鎖名 | 残基 |
A | TYR242 |
A | ASP246 |
A | HOH404 |
B | ASP108 |
B | GLU110 |
B | HOH407 |
site_id | AC4 |
残基数 | 6 |
詳細 | binding site for residue MG B 302 |
鎖名 | 残基 |
A | HOH404 |
B | ASP108 |
B | HOH401 |
B | HOH405 |
B | HOH407 |
B | HOH413 |
SwissProt/UniProtに記載されている蛋白質分子機能情報
site_id | SWS_FT_FI1 |
残基数 | 2 |
詳細 | BINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:31127291, ECO:0007744|PDB:6K19, ECO:0007744|PDB:6K1A, ECO:0007744|PDB:6K1B, ECO:0007744|PDB:6K1C, ECO:0007744|PDB:6K1D, ECO:0007744|PDB:6K1E |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | ASP108 | |
B | ASP108 |
site_id | SWS_FT_FI2 |
残基数 | 4 |
詳細 | BINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:31127291, ECO:0007744|PDB:6K18, ECO:0007744|PDB:6K1A, ECO:0007744|PDB:6K1B, ECO:0007744|PDB:6K1D, ECO:0007744|PDB:6K1E |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | GLU110 | |
A | ASP246 | |
B | GLU110 | |
B | ASP246 |